Genetika Evolusioner

Studi genetika evolusioner bertujuan untuk memahami lintasan evolusi populasi menggunakan informasi polimorfisme dalam sekuens genom. Pipeline Genetika Evolusioner BMKCloud dirancang untuk menganalisis data WGS atau Fragmen Amplifikasi Lokus Spesifik (SLAF) dari populasi besar. Setelah kontrol kualitas data mentah, bacaan diselaraskan dengan genom referensi dan varian diidentifikasi. Pipeline ini mencakup konstruksi pohon filogenetik, analisis komponen utama (PCA), analisis struktur populasi, ketidakseimbangan tautan (LD), analisis seleksi alam, dan analisis gen kandidat.