Analisis Asosiasi Seluruh Genom

Studi asosiasi genome-wide (GWAS) bertujuan untuk mengidentifikasi varian genetik (genotipe) yang berhubungan dengan sifat-sifat tertentu (fenotipe).Studi GWAS menyelidiki penanda genetik melintasi seluruh genom sejumlah besar individu dan memprediksi hubungan genotipe-fenotip melalui analisis statistik pada tingkat populasi.Ini telah diterapkan secara luas dalam penelitian penyakit manusia dan penambangan gen fungsional pada sifat-sifat kompleks hewan atau tumbuhan.

Hubungi kami

Detail Layanan

Hasil Demo

Publikasi Unggulan

1. Keuntungan Layanan

● Kasus Proyek Berlimpah: sejak didirikan pada tahun 2009, BMKGENE telah menyelesaikan ratusan proyek spesies dalam penelitian GWAS populasi, membantu peneliti menerbitkan lebih dari 100 artikel, dan faktor dampak kumulatif mencapai 500.
● Analis profesional.
● Siklus analisis yang singkat.
● Penambangan data yang akurat.

2. Spesifikasi Layanan

Jenis	Skala Populasi	Strategi pengurutan dan kedalaman
SLAF-GWAS	Nomor sampel ≥200	Ukuran genom <400M, dengan ref-genom, WGS direkomendasikan
		Ukuran genom ≤ 1G, Tag 100K dan 10X
		1G ≤ Ukuran genom ≤ 2G, Tag 200K dan 10X
		Ukuran genom> 2G, Tag 300K dan 10X
WGS-GWAS	Nomor sampel ≥200	10X untuk setiap sampel

3. Pemilihan Bahan

Varietas, subspesies, ras lokal/bank gen/keluarga campuran/sumber daya alam yang berbeda

Varietas yang berbeda, subspesies, ras lokal

Keluarga saudara tiri/keluarga saudara kandung/sumber daya liar

4. Analisis Bioinformasi

● Analisis asosiasi genom secara luas
● Analisis dan penyaringan SNP yang signifikan
● Anotasi fungsional gen kandidat

5. Alur Kerja Pelayanan

Desain percobaan

Pengiriman sampel

Ekstraksi RNA

Pembangunan perpustakaan

Pengurutan

Analisis data

Layanan purna jual

Sebelumnya: Urutan RNA inti tunggal

Berikutnya:

A.QC fenotipe

Histogram distribusi frekuensi

Statistik fenotip

B.Analisis asosiasi (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Plot QQ

Plot Manhattan

Tahun	Jurnal	IF	Judul
2022	NC	17.69	Dasar genom giga-kromosom dan giga-genom pohon peoni Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Jejak domestikasi menjadi penanda wilayah genom yang memiliki kepentingan agronomi pada kedelai
2018	MP	9.32	Pengurutan ulang seluruh genom dari koleksi aksesi rapeseed di seluruh dunia mengungkapkan dasar genetik dari perbedaan ekotipe mereka
2022	HR	7.29	Analisis asosiasi genom memberikan wawasan molekuler tentang variasi alami ukuran biji semangka