Long non-coding sequencing-illumina
Keuntungan Layanan
●Analisis bersama mRNA dan lncRNA: Dengan menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan studi lncRNA dan targetnya, dimungkinkan untuk mendapatkan gambaran mendalam tentang mekanisme pengaturan yang mendasari respons seluler.
●Keahlian yang luas: Tim kami membawa banyak pengalaman ke setiap proyek, dengan rekam jejak memproses lebih dari 23.000 sampel di BMK yang mencakup beragam jenis sampel dan proyek lncRNA.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Dukungan pasca-penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Persyaratan dan pengiriman sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang disarankan | Data QC |
| rRNA menipiskan perpustakaan directional | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30 ≥85% |
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
● Tanaman:
Root, batang atau kelopak: 450 mg
Daun atau biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Hewan:
Jantung atau usus: 450 mg
Viscera atau Brain: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Darah utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan plasma: 6 ml
Pengiriman sampel yang disarankan
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (timah tidak disarankan)
Label sampel: grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNASTABLE: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNASTABLE®) dan dikirim dalam suhu kamar.
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Bioinformatika
Analisis Ekspresi Gen Diferensial (DEG)
Kuantifikasi ekspresi lncRNA - pengelompokan
Pengayaan gen target lncRNA
Analisis posisi mRNA dan lncRNA bersama - plot Circos (lingkaran tengah adalah mRNA dan cicrlce bagian dalam adalah lncRNA)
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh LNCRNA Equencing Services BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori.
Ji, H. et al. (2020) 'Identifikasi, prediksi fungsional, dan verifikasi lncRNA kunci dari lncRNA terkait stres dingin pada hati tikus', Laporan Ilmiah 2020 10: 1, 10 (1), hlm. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analisis transkriptomi integratif mengungkapkan mekanisme kekebalan untuk strain ikan mas umum yang resistan terhadap CyHV-3, perbatasan dalam imunologi, 12, hal. 687151. Doi: 10.3389/fimmu.2021.687151/Bibtex.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritas berbasis integrasi multi-omics dari jaringan regulasi RNA endogen yang bersaing pada kanker paru-paru sel kecil: karakteristik molekuler dan kandidat obat', perbatasan dalam onkologi, 12, hal. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/Bibtex.
Xiao, L. et al. (2020) 'Diseksi genetik dari jaringan koekspresi gen yang mendasari fotosintesis di Populus', Plant Biotechnology Journal, 18 (4), hlm. 1015-1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Jaringan pengaturan global untuk ekspresi gen yang tidak teratur dan pensinyalan metabolik abnormal dalam sel -sel kekebalan tubuh dalam lingkungan mikro penyakit Graves dan tiroiditis Hashimoto', perbatasan dalam imunologi, 13, hal. 879824. Doi: 10.3389/fimmu.2022.879824/Bibtex.
