Pengurutan Non-coding Panjang - Illumina
Keunggulan Layanan
●Analisis gabungan mRNA dan lncRNADengan menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan studi lncRNA dan targetnya, dimungkinkan untuk mendapatkan gambaran mendalam tentang mekanisme pengaturan yang mendasari respons seluler.
●Keahlian yang LuasKami telah memproses lebih dari 230.000 sampel, yang mencakup beragam tujuan sampel dan proyek. Kami menghadirkan kekayaan keahlian untuk setiap proyek.
●Analisis gabungan mRNA dan lncRNAKami menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan studi lncRNA dan targetnya, sehingga memungkinkan untuk mendapatkan gambaran mendalam tentang mekanisme pengaturan yang mendasari respons seluler.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel hingga persiapan pustaka, pengurutan, dan bioinformatika. Pemantauan kami yang cermat memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Anotasi KomprehensifKami menggunakan berbagai basis data untuk memberi anotasi fungsional pada Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda (DEGs) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai. Pendekatan komprehensif ini memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptom, memastikan Anda mendapatkan semua informasi yang mungkin tentang data eksperimen Anda.
●Dukungan Purna JualKami memahami betapa pentingnya kehadiran, itulah sebabnya komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasilnya.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang direkomendasikan | Kontrol Kualitas Data |
| pustaka terarah yang kekurangan rRNA | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
● Tanaman:
Akar, Batang, atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1,2 g
● Hewan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Organ Dalam atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut, atau Kulit: 1,5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Darah utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma: 6 mL
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: Tabung sentrifugasi 2 ml (Tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Pelabelan sampel: Grup+replika, misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim pada suhu ruangan.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
- Data mentah
- Kontrol Kualitas Data
- Penyelarasan genom
- Struktur gen (Penyambungan alternatif, optimasi struktur gen, dan prediksi gen baru)
- Kuantifikasi ekspresi gen
- Analisis ekspresi diferensial
- Anotasi dan pengayaan DEG + Gen target lncRNA yang diekspresikan secara berbeda
- Identifikasi transkrip
- Identifikasi lncRNA (konservasi lncRNA dan lncRNA yang diketahui)
- prediksi gen target lncRNA
- Kuantifikasi ekspresi lncRNA
- Analisis gabungan dengan data mRNA
Analisis Ekspresi Gen Diferensial (DEGs)
Kuantifikasi ekspresi lncRNA – pengelompokan
Pengayaan gen target lncRNA
Analisis posisi gabungan mRNA dan lncRNA – Plot Circos (lingkaran tengah adalah mRNA dan lingkaran dalam adalah lncRNA)
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan pengurutan lncRNA BMKGene melalui koleksi publikasi pilihan.
Ji, H. dkk. (2020) 'Identifikasi, prediksi fungsional, dan verifikasi lncRNA kunci terkait stres dingin pada hati tikus',Laporan Ilmiah2020 10:1, 10(1), hlm. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. dkk. (2021) 'Analisis Transkriptomik Integratif Mengungkap Mekanisme Imun untuk Strain Ikan Mas Biasa yang Resisten terhadap CyHV-3',Batasan dalam Imunologi, 12, hal. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ dkk. (2022) 'Prioritisasi Jaringan Regulasi RNA Endogen yang Bersaing Berbasis Integrasi Multi-Omik pada Kanker Paru Sel Kecil: Karakteristik Molekuler dan Kandidat Obat',Batasan dalam Onkologi, 12, hal. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. dkk. (2020) 'Analisis genetik jaringan koekspresi gen yang mendasari fotosintesis pada Populus',Jurnal Bioteknologi Tanaman, 18(4), hlm. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. dkk. (2022) 'Jaringan Regulasi Global untuk Ekspresi Gen yang Tidak Teratur dan Sinyal Metabolik Abnormal pada Sel Imun di Lingkungan Mikro Penyakit Graves dan Tiroiditis Hashimoto',Batasan dalam Imunologi, 13, hal. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
