● Penipisan rRNA diikuti oleh persiapan perpustakaan mRNA terarah.
● Urutan di Illumina novaseq.
●Mempelajari perubahan komunitas mikroba yang kompleks:Ini terjadi pada tingkat transkripsi dan mengeksplorasi pot baru yang potensial.
●Menjelaskan interaksi komunitas mikroba dengan host atau lingkungan.
●Analisis bioinformatik yang komprehensif: Ini memberikan wawasan tentang komposisi taksonomi dan fungsional masyarakat, serta analisis ekspresi gen diferensial.
●Anotasi gen yang luas:Menggunakan database fungsi gen terkini untuk informasi ekspresi gen informatif dari komunitas mikroba.
●Dukungan pasca-penjualan:Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Platform Sequencing | Strategi Sequencing | Data direkomendasikan | Kontrol Kualitas Data |
Illumina Novaseq | PE150 | 12GB | Q30 ≥85% |
Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah Total (μg) | Volume (μl) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Termasuk analisis berikut:
● Kontrol kualitas data sekuensing
● Perakitan transkrip
● Anotasi dan kelimpahan taksonomi
● Anotasi dan kelimpahan fungsional
● Kuantifikasi ekspresi dan analisis diferensial
Distribusi taksonomi dari setiap sampel:
Analisis Keragaman Beta: UPGMA
Anotasi fungsional - kelimpahan
Kelimpahan taksonomi diferensial - lefse
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan sekuensing meta transkriptomik BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori.
Lu, Z. et al. ;Nutrisi Hewan, 14, hlm. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Mengurai mikrobiota fungsional inti dalam fermentasi solid-state tradisional oleh amplikon throughput tinggi dan sekuensing metatranskriptomik',Perbatasan dalam mikrobiologi, 8 (Jul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/penuh.
Wang, W. et al. (2022) 'Mikovirus novel yang ditemukan dari survei metatranskripomik dari jamur alternaria fitopatogenik',Virus, 14 (11), hlm. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analisis metatranskripom paralel mengungkapkan degradasi metabolit sekunder tanaman oleh kumbang dan simbion ususnya',Molekuler Ekologi, 31 (15), hlm. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.