Proteomik
Fitur
●Proteomik Kualitatif: Menggunakan LC-MS/MS untuk mengidentifikasi komposisi protein dalam sampel kompleks (strip gel SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down). Keunggulan: Tidak ada batasan jumlah sampel, deteksi cepat, pemrosesan sampel sederhana, throughput tinggi, dan kemampuan untuk mendeteksi protein dengan kelimpahan rendah.
● Proteomik Kuantitatif Tanpa Label: Teknologi tanpa label dengan deteksi sampel individual. Mengkuantifikasi protein dengan membandingkan intensitas sinyal peptida dalam data spektrometri massa. Keunggulan: Pengoperasian sederhana, throughput tinggi (tidak ada batasan jumlah sampel), dan penerapan luas (cocok untuk perbandingan protein diferensial "kehadiran/ketidakhadiran" antar spesies).
● Proteomik Kuantitatif DIA: Mengadopsi mode akuisisi data independen (DIA), memindai semua ion dalam jendela tersegmentasi untuk menangkap informasi ion lengkap. Keunggulan: Pengulangan yang lebih baik, cakupan protein yang lebih tinggi, dan kuantifikasi yang lebih akurat daripada mode DDA (TMT/Bebas Label), ideal untuk studi sampel besar.
● Proteomik Kuantitatif Bebas Label 4D/Proteomik Kuantitatif 4D-DIA: Berdasarkan spektrometer massa Bruker timsTOF, menambahkan mobilitas ion (penampang tumbukan) ke pemisahan 3D tradisional. Keunggulan: Pemanfaatan ion dan akurasi yang lebih baik, peningkatan komprehensif dalam kedalaman cakupan, sensitivitas, dan throughput; kedalaman identifikasi yang lebih tinggi daripada metode 3D tradisional.
● Proteomik Kuantitatif Bebas Label Astral/Proteomik Kuantitatif Astral DIA: Berdasarkan spektrometer massa resolusi tinggi OrbitrapTM AstralTM. Keunggulan: Kapasitas pemrosesan lebih tinggi (100+ sampel/hari dengan gradien 8 menit), cakupan lebih dalam (8.000+ protein terdeteksi dalam sel Hela dalam 8 menit), dan sensitivitas lebih tinggi (membutuhkan lebih sedikit sampel).
● Proteomik Kuantitatif TMT: Menggunakan 18 penanda isotop untuk memberi label peptida guna deteksi simultan 18 sampel. Keunggulan: Stabilitas tinggi (gangguan stabilitas instrumen minimal, kesalahan sistem kecil) dan sensitivitas tinggi (fraksinasi mengurangi kompleksitas sampel, meningkatkan deteksi protein dengan kelimpahan rendah).
● Proteomik Bertarget PRM: Teknologi bertarget resolusi tinggi untuk deteksi selektif protein/peptida target. Keunggulan: Memungkinkan kuantifikasi relatif/absolut dan verifikasi hasil proteomik kuantitatif; tidak ada batasan antibodi, penerapan lebih luas daripada Western Blot dan ELISA.
Keuntungan
● Peralatan Canggih: Dilengkapi dengan platform proteomik konvensional dan spektrometer massa berkedalaman tinggi yang canggih (misalnya, 4D, Astral).
● Deteksi Stabil: Sistem kontrol kualitas yang ketat memastikan proses pengujian yang konsisten dan stabil.
● Hasil yang Andal: Analisis kualitatif dan kuantitatif simultan memberikan ekspresi relatif, berat molekuler, kelimpahan, dan data penting lainnya untuk setiap kelompok.
● Otomatisasi Tinggi: Sistem LC-MS otomatis memungkinkan analisis cepat dan kinerja pemisahan yang sangat baik.
Spesifikasi Layanan
| Perbandingan Teknik Proteomik Non-target | ||||
| Tanpa label | DIA | TMT | ||
| Pemberian label | NO | NO | YA | |
| Mode Pemindaian Data | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Reproduksibilitas | Lebih rendah | Tinggi | Tinggi | |
| Kepekaan | Lebih rendah | Tinggi | Tinggi | |
| Multiplexing | NO | YA | NO | YA |
| Aplikasi | Membandingkan keberadaan/ketidakberadaan protein | Sampel skala besar | Analisis berbagai kelompok sampel | Membandingkan ekspresi protein diferensial pada spesies dan jaringan yang sama |
| Ketepatan | ★ | ★★(4D/DlA Astral ★★★) | ★★ | |
| Jumlah Deteksi | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Contoh Persyaratan
Apakah Anda ingin mengetahui apakah sampel Anda memenuhi kriteria kami? Klik di sini untuk mendapatkan informasi selengkapnya.persyaratan sampel terbaru.
Alur Kerja Layanan
Pengumpulan Sampel
Ekstraksi Protein
Pencernaan enzimatik
Pemisahan
Akuisisi Data
Analisis Data
Pengiriman Data
Proteomik Kualitatif
1. Larutan/gel protein: tabel hasil kualitatif
2. Hasil Pencarian Basis Data
2.1 Daftar segmen peptida yang cocok dalam pencarian basis data
2.2 Daftar protein yang cocok dalam pencarian basis data
2.3 Daftar modifikasi yang cocok dalam pencarian basis data (fosforilasi, ubikuitinasi, dll.)
3. Data mentah
Proteomik Kuantitatif(Bebas Label/DIA/TMT)
1. Praproses Data
1.1 Pencarian Basis Data Protein
2. Analisis Ekspresi Protein
2.1 Analisis Komponen Utama (PCA)
2.2 Deviasi Standar Relatif (RSD)
2.3 Distribusi Tren K-means
2.4 Evaluasi Reproduksibilitas
2.5 Peta Panas Ekspresi Protein
3. Anotasi Fungsional
3.1 Anotasi Fungsional GO
3.2 Anotasi Fungsional KEGG
3.3 Anotasi Fungsional COG
3.4 Anotasi Fungsional GOslim
3.5 Anotasi Domain Struktur Protein Pfam
4. Analisis Diferensial Protein (replikasi biologis ≥ 3)
4.1 Hasil Analisis Diferensial Protein
4.2 Distribusi Perubahan Lipatan Protein Diferensial (FC)
4.3 Analisis Statistik Kuantitas Protein Diferensial
4.4 Plot Gunung Berapi Protein Diferensial
4.5 Peta Panas Pengelompokan Protein Diferensial
4.6 Anotasi Fungsional GO Protein Diferensial dan Analisis Pengayaan
4.7 Anotasi Fungsional KEGG Protein Diferensial dan Analisis Pengayaan
4.8 Anotasi Fungsional COG Protein Diferensial
4.9 Analisis Anotasi dan Pengayaan GOslim Protein Diferensial
4.10 Anotasi Domain Struktur Protein Diferensial dan Analisis Pengayaan
5. Analisis Interaksi Jaringan Protein
6. Anotasi Jalur Reaktom Protein
7. Prediksi Peptida Sinyal
8. Lokalisasi Subseluler Protein
Proteomik Kuantitatif(PRM)
1. Hasil Kuantifikasi Protein PRM
1.1 Gambaran Umum Hasil Kuantifikasi
1.2 Distribusi Luas Puncak Ion Fragmen untuk Segmen Peptida
Proteomik Kuantitatif
1.Analisis Ekspresi Protein
↑Analisis Komponen Utama (PCA)↑Deviasi Standar Relatif (RSD)
↑Distribusi Tren K-means ↑KorelasiAanalisisPproteinEekspresiLtingkat
↑ Peta Panas Ekspresi Protein
2. Anotasi Fungsional
↑Anotasi Fungsional GO↑Anotasi Fungsional KEGG
↑ Anotasi Fungsional COG ↑ Anotasi Fungsional GOslim
↑ Anotasi Domain Struktur Protein Pfam
3.Analisis Interaksi Jaringan Protein
↑ Analisis Interaksi Jaringan Protein
4.Prediksi Peptida Sinyal
↑ Prediksi Peptida Sinyal
5. Lokalisasi Subseluler Protein
↑Lokalisasi Subseluler Protein
| Tahun 2025 | Vesikel Apoptotik yang Berasal dari Sel Punca Mesenkim Meredakan Respons Hipersensitivitas melalui Induksi Apoptosis Sel T CD8+ dengan Kelebihan Kalsium dan Disfungsi Mitokondria | Sains Tingkat Lanjut |
| Tahun 2024 | Multi-omik terintegrasi menunjukkan peningkatan efektivitas antitumor pada | Onkologi Translasi |
| Tahun 2024 | Analisis Multi-Omik Mengungkapkan Ciri Khas Jalur Metabolisme yang Mendukung Ukuran Buah dan Variasi Warna Labu Raksasa | Jurnal Internasional Ilmu Molekuler |
| Tahun 2024 | Analisis Profiling Transkriptom dan Metabolom Memberikan Wawasan Baru tentang Atrofi Otot Akibat Tidak Digunakan pada Ayam: Peran Potensial Serat Otot Cepat (Fast-Twitch Muscle Fibers) | Jurnal Internasional Ilmu Molekuler |
| Tahun 2023 | Analisis multi-omik mengungkapkan pengaruh tetrasiklin terhadap pertumbuhan akar rumput gandum. | Jurnal bahan berbahaya |
