Pengurutan Bisulfit Representasi yang Dikurangi (RRBS)
Spesifikasi Layanan
Peron: Platform NovaSeq, PE150
Jenis perpustakaan: 200-400bp masukkan perpustakaan DNA yang diberi perlakuan bisulfit
Strategi pengurutan: Berpasangan-Akhir 150 bp
Rekomendasi keluaran data: 10 Gb data/sampel mentah
Persyaratan Sampel
Kuantitas DNA: ≥ 2ug
Konsentrasi DNA: ≥ 20ng/μl.
Kemurnian: OD260/280 = 1,8 hingga 2,0 tanpa degradasi atau kontaminasi RNA
Analisis bioinformatika
Alur Kerja Layanan
Pengiriman sampel
Pembangunan perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
a.Referensi statistik penyelarasan genom
Statistik pemetaan berbunyi
Sstatistik kedalaman sekuensing dan cakupan situs C
Acakupan yang terakumulasi
Defisiensi pencernaan setiap sampel
b.Deteksi situs metilasi
Daftar tingkat metilasi di situs C
Bkonversi S
Msitosin teretilasi
Distribusi tingkat metilasi
c.Peta metilasi
Gluas
Gelemen enome
d.Perbandingan tingkat metilasi antar sampel
PKorelasi udara metilasi CG
PMetilasi CA-CG
Ckilau metilasi CG
d.Analisis metilasi secara diferensial
Sstatistik DMR
Distribusi panjang DMR
Hmakan peta
DDistribusi MR di wilayah sasaran
