Pengurutan RNA Kecil - Illumina
Fitur
● Persiapan perpustakaan pemilihan ukuran.
● Analisis bioinformatika yang berpusat pada prediksi dan target miRNA.
Keunggulan Layanan
●Keahlian yang LuasKami telah memproses lebih dari 300 sampel, yang mencakup berbagai jenis sampel. Kami menghadirkan kekayaan keahlian untuk setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel hingga persiapan pustaka, pengurutan, dan bioinformatika. Pemantauan kami yang cermat memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Analisis bioinformatika komprehensif:Hal ini memungkinkan identifikasi miRNA yang sudah dikenal maupun yang baru, identifikasi target miRNA, serta anotasi fungsional dan pengayaan yang sesuai dengan berbagai basis data (KEGG, GO).
●Dukungan Purna JualKami memahami betapa pentingnya kehadiran, itulah sebabnya komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasilnya.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang direkomendasikan | Kontrol Kualitas Data |
| Ukuran yang dipilih | Illumina SE50 | 10 juta-20 juta pembaca | Q30≥85% |
Contoh Persyaratan:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
● Tanaman:
Akar, Batang, atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1,2 g
● Hewan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Organ Dalam atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut, atau Kulit: 1,5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Darah utuh: 2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma:6 mL
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: Tabung sentrifugasi 2 ml (Tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Pelabelan sampel: Grup+replika, misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim pada suhu ruangan.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
● Kontrol kualitas data mentah
● Klasifikasi RNA kecil
● Ekspresi miRNA dan analisis ekspresi diferensial
● Anotasi gen target miRNA dan gen target miRNA yang diekspresikan secara berbeda
● Anotasi gen target dan pengayaan fungsi gen miRNA yang diekspresikan secara berbeda
Identifikasi miRNA: struktur dan kedalaman
Ekspresi diferensial miRNA – pengelompokan hierarkis
Anotasi fungsional target miRNA yang diekspresikan secara berbeda
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan pengurutan sRNA BMKGene melalui koleksi publikasi pilihan.
Chen, H. dkk. (2023) 'Infeksi virus menghambat biosintesis saponin dan fotosintesis pada Panax notoginseng',Fisiologi dan Biokimia Tumbuhan, 203, hlm. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Protein FREE1 yang mengandung domain FYVE pada tumbuhan berasosiasi dengan komponen mikroprosesor untuk menekan biogenesis miRNA',Laporan EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. dkk. (2023) 'MikroRNA Ame-Bantam-3p Mengontrol Perkembangan Larva Pupa dengan Menargetkan Gen Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 (megf8) pada Lebah Madu, Apis mellifera',Jurnal Internasional Ilmu Molekuler, 24(6), hal. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. dkk. (2018) 'Analisis Terpadu MiRNA dan Gen yang Berasosiasi dengan Kualitas Daging Mengungkapkan bahwa Gga-MiR-140-5p Mempengaruhi Deposisi Lemak Intramuskular pada Ayam',Fisiologi dan Biokimia Seluler, 46(6), hlm.2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
