WGS (Nanopore)

Pengurutan ulang seluruh genom dengan Nanopore adalah metode populer untuk mengidentifikasi varian genomik, khususnya varian struktural (SV), yang lebih akurat diidentifikasi dengan pengurutan bacaan panjang daripada pengurutan bacaan pendek. Pipeline BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) dirancang untuk menganalisis data dari proyek WGS dengan Nanopore menggunakan genom referensi berkualitas tinggi dan terannotasi dengan baik. Analisis dimulai dengan pemangkasan bacaan dan kontrol kualitas, diikuti dengan penyelarasan ke genom referensi, identifikasi SV, dan anotasi fungsional gen terkait SV menggunakan beberapa basis data.