Urutan transkriptom keseluruhan – Illumina
Fitur
● Perpustakaan ganda untuk mengurutkan transkriptom lengkap: deplesi rRNA diikuti dengan persiapan perpustakaan PE150 dan pemilihan ukuran diikuti dengan persiapan perpustakaan SE50
● Analisis lengkap bioinformatika mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA dalam laporan bioinformatika terpisah
● Analisis gabungan seluruh ekspresi RNA dalam laporan gabungan, termasuk analisis jaringan ceRNA.
Keunggulan Layanan
●Analisis mendalam tentang jaringan regulasi: Analisis jaringan ceRNA diaktifkan melalui pengurutan gabungan mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA serta melalui alur kerja bioinformatik yang lengkap.
●Anotasi Komprehensif: kami menggunakan banyak basis data untuk secara fungsional memberi anotasi pada Gen yang Diekspresikan Diferensial (DEG) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai, memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptome.
●Keahlian yang Luas: dengan rekam jejak yang berhasil menyelesaikan lebih dari 2000 proyek transkriptome di berbagai domain penelitian, tim kami membawa banyak pengalaman ke setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang Ketat: kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel dan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika.Pemantauan yang cermat ini memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
● Anotasi Komprehensif: kami menggunakan banyak basis data untuk secara fungsional memberi anotasi pada Gen yang Diekspresikan Diferensial (DEG) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai, memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptome.
●Dukungan Pasca Penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual 3 bulan.Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasil
Persyaratan Sampel dan Pengiriman
| Perpustakaan | Strategi pengurutan | Data direkomendasikan | Kontrol kualitas |
| rRNA habis | Menerangi PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Ukuran dipilih | Menerangi SE50 | 10-20 juta dibaca |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein atau DNA terbatas atau tidak ada pada gel. | Tanaman: RIN≥6.5 Hewan: RIN≥7.0 5,0≥28S/18S≥1,0; elevasi dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah:
Tabung centrifuge 2 ml (tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Contoh pelabelan: Grup+replikasi misalnya A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Pengiriman:
1.Es kering: Sampel harus dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstabil: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim dalam suhu kamar.
Alur Kerja Layanan
Desain percobaan
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Pembangunan perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
Ikhtisar ekspresi RNA
Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda
analisis ceRNA
MiRNA yang diekspresikan secara berbeda dan RNA terkait
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh seluruh layanan pengurutan transkriptome BMKGene melalui koleksi publikasi yang dikurasi.
Dai, Y. dkk.(2022) 'Profil ekspresi komprehensif mRNA, lncRNA, dan miRNA pada penyakit Kashin-Beck yang diidentifikasi dengan sekuensing RNA', Molecular Omics, 18(2), hlm.154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N.nan dkk.(2022) 'Analisis transkriptome lengkap tentang ketahanan dingin Apis cerana di Gunung Changbai selama periode musim dingin.', Gene, 830, hlm.146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ dkk.(2022) 'Prioritas Berbasis Integrasi Multi-Omics dari Jaringan Regulasi RNA Endogen yang Bersaing pada Kanker Paru Sel Kecil: Karakteristik Molekuler dan Kandidat Obat', Frontiers in Oncology, 12, hal.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. dkk.(2022) 'Analisis terpadu profil ekspresi lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA mengungkapkan wawasan baru tentang mekanisme potensial sebagai respons terhadap nematoda simpul akar pada kacang tanah', BMC Genomics, 23(1), hlm.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/GAMBAR/7.
Yan, Z. dkk.(2022) 'Pengurutan RNA transkriptome utuh menyoroti mekanisme molekuler yang terkait dengan pemeliharaan kualitas pascapanen brokoli dengan iradiasi LED merah', Postharvest Biology and Technology, 188, hal.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
