Pengurutan Transkriptom Lengkap – Illumina
Fitur
● Pembuatan pustaka ganda untuk mengurutkan transkriptom lengkap: pembuatan pustaka pengurangan rRNA dan pustaka RNA kecil.
● Analisis bioinformatika lengkap mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA dalam laporan bioinformatika terpisah, ditambah analisis gabungan dengan semua ekspresi RNA, termasuk analisis jaringan ceRNA.
Keunggulan Layanan
●Keahlian yang LuasKami telah memproses lebih dari 2100 proyek transkriptom lengkap, yang mencakup beragam jenis sampel. Kami membawa kekayaan keahlian ke setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel hingga persiapan pustaka, pengurutan, dan bioinformatika. Pemantauan kami yang cermat memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Anotasi KomprehensifKami menggunakan berbagai basis data untuk memberi anotasi fungsional pada Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda (DEGs) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai. Pendekatan komprehensif ini memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptom, memastikan Anda mendapatkan semua informasi yang mungkin tentang data eksperimen Anda.
●Analisis Mendalam tentang Jaringan RegulasiAnalisis jaringan ceRNA dimungkinkan melalui pengurutan bersama mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA serta alur kerja bioinformatika yang komprehensif.
●Dukungan Purna JualKami memahami betapa pentingnya kehadiran, itulah sebabnya komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasilnya.
Persyaratan dan Pengiriman Sampel
| Perpustakaan | Strategi pengurutan | Data yang direkomendasikan | Kontrol Kualitas |
| rRNA berkurang | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Ukuran yang dipilih | Illumina SE50 | 10-20 juta pembaca |
Contoh Persyaratan:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminasi protein atau DNA yang terlihat pada gel terbatas atau tidak ada sama sekali. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; Peningkatan dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: Tabung sentrifugasi 2 ml (Tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Pelabelan sampel: Grup+replika, misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim pada suhu ruangan.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
Selain semua analisis pada masing-masing jenis RNA yang berbeda, keempat jenis RNA tersebut digabungkan ke dalam analisis gabungan kami:
- Analisis ekspresi bersama antara semua jenis data RNA yang berbeda
- Gambaran umum ekspresi RNA
- Gambaran umum ekspresi diferensial
- Jaringan CeRNA
- Gen-gen kunci yang terintegrasi dalam jalur tersebut
- Analisis konservasi
- Menargetkan hubungan
Gambaran umum ekspresi RNA
Gen yang diekspresikan secara berbeda
analisis ceRNA
miRNA dan RNA terkait yang diekspresikan secara berbeda
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan pengurutan transkriptom lengkap BMKGene melalui koleksi publikasi pilihan.
Dai, Y. dkk. (2022) 'Profil ekspresi komprehensif mRNA, lncRNA, dan miRNA pada penyakit Kashin-Beck yang diidentifikasi melalui sekuensing RNA',Omik Molekuler, 18(2), hlm.154–166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan dkk. (2022) 'Analisis transkriptom lengkap ketahanan terhadap dingin pada Apis cerana di Gunung Changbai selama periode musim dingin.',Gen, 830, hlm. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ dkk. (2022) 'Prioritisasi Jaringan Regulasi RNA Endogen yang Bersaing Berbasis Integrasi Multi-Omik pada Kanker Paru Sel Kecil: Karakteristik Molekuler dan Kandidat Obat',Batasan dalam Onkologi, 12, hal. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. dkk. (2022) 'Analisis terintegrasi profil ekspresi lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA mengungkapkan wawasan baru tentang mekanisme potensial dalam menanggapi nematoda simpul akar pada kacang tanah',BMC Genomics, 23(1), hlm. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. dkk. (2022) 'Pengurutan RNA transkriptom lengkap menyoroti mekanisme molekuler yang terkait dengan pemeliharaan kualitas pasca panen pada brokoli dengan iradiasi LED merah',Biologi dan Teknologi Pascapanen, 188, hlm. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
