-
Osisi/Anụmanụ De novo Genome Sequencing
De novousoro nke na-ezo aka n'iwu nke ụdị 'genome dum site na iji teknụzụ usoro usoro, dịka PacBio, Nanopore, NGS, wdg, na enweghị genome ntụaka.Ọganihu dị ịrịba ama na ogologo ọgụgụ nke ọgbọ nke atọ usoro teknụzụ ewetawo ohere ọhụrụ n'ịchịkọta genomes dị mgbagwoju anya, dị ka ndị nwere heterozygosity dị elu, oke nke mpaghara ugboro ugboro, polyploids, wdg. Na-agụ ogologo na iri puku kwuru iri kilobases larịị, ndị a sequencing na-agụ na-enyere aka. idozi ihe ndị na-emegharị ugboro ugboro, mpaghara nwere ọdịnaya GC na-adịghị mma na mpaghara ndị ọzọ dị mgbagwoju anya.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Mgbakọ Genome dabere na Hi-C
Hi-C bụ usoro emebere iji weghara nhazi chromosome site na ijikọta mmekọrịta dabere na nso nso yana usoro ntinye dị elu.A na-ekwenye na ike mmekọrịta ndị a na-adịghị mma na anya anụ ahụ na chromosomes.Ya mere, data Hi-C nwere ike na-eduzi nchịkọta, ịtụ na nhazi nke usoro agbakọtara na mkpụrụ ndụ ihe nketa na itinye ndị ahụ na ọnụ ọgụgụ chromosomes ụfọdụ.Nkà na ụzụ a na-enye ike mgbakọ genome ọkwa chromosome na-enweghị maapụ mkpụrụ ndụ ihe nketa dabere na ọnụ ọgụgụ mmadụ.genome ọ bụla chọrọ Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetics evolushọn
Mkpụrụ ndụ ihe nketa evolushọn bụ ọrụ njupụta nke emebere maka inye nkọwa zuru oke na ozi evolushọn nke ihe enyere dabere na mgbanwe mkpụrụ ndụ ihe nketa, gụnyere SNPs, InDels, SVs na CNV.Ọ na-enye nyocha niile dị mkpa achọrọ maka ịkọwa mgbanwe mgbanwe evolushọn na njirimara mkpụrụ ndụ ihe nketa nke ọnụ ọgụgụ mmadụ, dị ka nhazi ọnụ ọgụgụ mmadụ, ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa, mmekọrịta phylogeny, wdg. Ọ nwekwara ọmụmụ banyere usoro mkpụrụ ndụ ihe nketa, nke na-enye ike nleba anya nke ọnụọgụ ọnụọgụgụ dị irè, oge dị iche iche.
-
Genomics atụnyere
Ntụnyere genomics pụtara n'ụzọ nkịtị iji atụnyere usoro genome zuru oke na nhazi nke ụdị dị iche iche.Ọzụzụ a na-achọ ikpughe ụdị evolushọn, ọrụ mkpụrụ ndụ ihe nketa, usoro nhazi mkpụrụ ndụ ihe nketa na ọkwa genome site n'ịchọpụta usoro usoro na ihe ndị echekwara ma ọ bụ dị iche n'ofe ụdị dị iche iche.Ọmụmụ ihe ọmụmụ genomics na-ahụkarị gụnyere nyocha na ezinụlọ mkpụrụ ndụ ihe nketa, mmepe evolushọn, mbigharị genome dum, nrụgide nhọrọ, wdg.
-
Nnukwu nyocha Segregant
Bulked segregant analysis (BSA) bụ usoro eji eme ngwa ngwa chọpụta akara mkpụrụ ndụ ihe metụtara phenotype.Isi usoro BSA nwere ịhọrọ otu abụọ nke ndị nwere ụdị phenotypes na-emegide nke ukwuu, na-ejikọta DNA nke mmadụ niile iji mepụta nnukwu DNA abụọ, na-achọpụta usoro dị iche n'etiti ọdọ mmiri abụọ.Ejila usoro a rụọ ọrụ nke ọma n'ịchọpụta akara mkpụrụ ndụ ihe nketa nke mkpụrụ ndụ ihe nketa ezubere iche na genome osisi/anụmanụ jikọtara nke ọma.
