Bulked Segregant greining
Þjónustukostir
Takagi o.fl., The plant journal, 2013
● Nákvæm staðsetning: Blanda saman magni með 30+30 til 200+200 einstaklingum til að lágmarka bakgrunnshljóð;spá fyrir umsækjendasvæði sem ekki er samheiti stökkbreytt.
● Alhliða greining: Ítarleg skýring á umbjóðanda genavirkni, þar á meðal NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG o.s.frv.
● Hraðari afgreiðslutími: Hröð staðsetning gena innan 45 virkra daga.
● Mikil reynsla: BMK hefur lagt sitt af mörkum til að staðsetja þúsundir eiginleika, sem nær yfir fjölbreyttar tegundir eins og ræktun, vatnsafurðir, skóg, blóm, ávexti osfrv.
Þjónustulýsingar
Mannfjöldi:
Aðgreina afkvæmi foreldra með andstæðar svipgerðir.
td F2 afkvæmi, Backcrossing (BC), Recombinant inbreed line (RIL)
Blöndunarlaug
Fyrir eigindlega eiginleika: 30 til 50 einstaklingar (lágmark 20) / magn
Fyrir megindlega greiningu: efstu 5% til 10% einstaklingar með annað hvort öfgakenndar svipgerðir í öllu þýðinu (lágmark 30+30).
Mælt er með dýpt raðgreiningar
Að minnsta kosti 20X/foreldri og 1X/afkvæmi einstaklingur (t.d. fyrir afkvæmablöndunarlaug með 30+30 einstaklingum, verður raðdýpt 30X á lausu)
Lífupplýsingagreiningar
● Endurraðgreining á heilu erfðamengi
● Gagnavinnsla
● SNP/Indel símtöl
● Umsækjendasvæðisskimun
● Frambjóðandi genavirkni skýring
Dæmi um kröfur og afhending
Dæmi um kröfur:
Núkleótíð:
| gDNA sýni | Vefjasýni |
| Styrkur: ≥30 ng/μl | Plöntur: 1-2 g |
| Magn: ≥2 μg (Magn ≥15 μl) | Dýr: 0,5-1 g |
| Hreinleiki: OD260/280= 1,6-2,5 | Heilblóð: 1,5 ml |
Þjónustuvinnuflæði
Hönnun tilrauna
Sýnishorn afhending
RNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
1.Félagsgreiningargrunnur á Euclidean Distance (ED) til að bera kennsl á umsækjendasvæði.Í eftirfarandi mynd
X-ás: Litninganúmer;Hver punktur táknar ED gildi SNP.Svarta línan samsvarar innbyggðu ED gildi.Hærra ED gildi gefur til kynna marktækari tengsl á milli staðarins og svipgerðarinnar.Rauð strikalína táknar þröskuld verulegs sambands.
2.Sambandsgreining byggð á engri SNP-vísitölu
X-ás: Litninganúmer;Hver punktur táknar SNP-vísitölugildi.Svarta línan stendur fyrir fitted SNP-index value.Því hærra sem verðmæti er, því mikilvægara er félagið.
BMK mál
Megindlegi eiginleiki staðsetning Fnl7.1 kóðar fyrir seint fósturvísismyndun mikið prótein sem tengist lengd ávaxtahálsi í agúrku
Birt: Plöntulíftækniblað, 2020
Röðunarstefna:
Foreldrar (Jin5-508, YN): Heils erfðamengi endurraðað fyrir 34× og 20×.
DNA safn (50 langháls og 50 stuttháls): Endurraðgreining fyrir 61× og 52×
Helstu niðurstöður
Í þessari rannsókn var aðskilið þýði (F2 og F2:3) myndað með því að fara yfir langhálsa gúrkulínu Jin5-508 og stuttháls YN.Tvær DNA laugar voru smíðaðar af 50 mjög langhálsum einstaklingum og 50 mjög stuttháls einstaklingum.Major-effect QTL var auðkennt á Chr07 með BSA greiningu og hefðbundinni QTL kortlagningu.Umsækjendasvæðið var þrengt enn frekar með fínkortlagningu, magngreiningu genatjáningar og erfðabreyttum tilraunum, sem leiddi í ljós lykilgen til að stjórna hálslengd, CsFnl7.1.Auk þess kom í ljós að fjölbreytileiki á CsFnl7.1 frumkvöðlasvæði tengdist samsvarandi tjáningu.Frekari sýklafræðileg greining benti til þess að mjög líklegt sé að Fnl7.1 staðurinn sé upprunninn frá Indlandi.
 QTL-kortlagning í BSA greiningu til að bera kennsl á umsækjendasvæði sem tengist hálslengd gúrku |  LOD snið af gúrkuháls-lengd QTL auðkennd á Chr07 |
Xu, X. o.fl.„Megindlegi eiginleiki staðsetning Fnl7.1 kóðar fyrir seint fósturvísismyndun mikið prótein sem tengist lengd ávaxtahálsi í agúrku.Plant Biotechnology Journal 18.7 (2020).
