| Pallur | Stærð bókasafns | Fræðileg gagnanýting (á hverja frumu) | Nákvæmni á einum grunni | Umsóknir |
| Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, ofurlangt, cDNA-PCR | 70-90 Gb/farsími | 85-92% | SV-köllun, De novo, raðgreining í fullri lengd, Ísó-raðgreining, Genaskýring, Greining á DNA metýleringu |
● Yfir 5 ára reynsla af PacBio raðgreiningarvettvangi með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsum tegundum.
● BMKGENE er opinber samstarfsaðili Oxford Nanopore, með RNA/DNA vottun fyrir bæði kerfin.
● Það eru til almennar gerðir af raðgreiningartækjum með fullkomnum búnaði og nægilegum raðgreiningarafköstum.
● Byggt á Nanopore vettvanginum hafa meira en 10 rannsóknir á dýrum og plöntum frá Denovo verið birtar í alþjóðlega þekktum tímaritum.
| Tegund sýnishorns | Upphæð | Einbeiting (Qubit ®) | Hljóðstyrkur | Hreinleiki | Aðrir |
| Erfðamengis DNA | Fer eftir gagnakröfum | ≥20 ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,2; OD260/230≥1,5; Tær toppur við 260 nm, engin mengun | Styrk þarf að mæla með Qubit og Qubit/Nanopore ≤ 2 |
| Heildar-RNA | ≥1,2 μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,5; OD260/230 = 0,5-2,5; engin mengun | RIN gildi ≥7,5 |
Gæðamat á DNA-sýni
Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.
| BMKID | rawSeqNum | hrárSummugrunnur | hreinsraðnúmer | hreinnSumBasi | hreintN50Len | hreintN90Len | hreinnMeanLen | hreinnMaxLen | hreintMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25,90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Gæðamat á RNA sýni
Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.
| Skráarnafn | Viðskiptavinaauðkenni | Lesanúmer | Grunnnúmer | N50 | Meðallengd | Hámarkslengd | MeðaltalQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Mynd 1. Dreifing lestrarlengdar
Mynd 2. Dreifing gæðastiga fyrir hrein gögn
Mynd 3. Lengd og gæðastigadreifing hreinna gagna