条形 Banner-03

Vörur

DNA/RNA röð - Nanopore Sequencer

ONT raðgreining er ein sameind í rauntíma rafmerkjatækni sem byggist á nanopores, raðgreiningarreglan hvers pallsins er sú sama. Tvístrengt DNA/RNA mun bindast nanoporous próteini sem er innbyggt í líffilminn og vinda ofan af undir forystu mótorpróteins, undir verkun spennum mun frá báðum hliðum líffilmsins, DNA/RNA þræðir fara um nanopore rásina prótein á ákveðnum Einkunn. Vegna munar á efnafræðilegum eiginleikum mismunandi basa á DNA/RNA strengnum, þegar stakur grunnur eða DNA sameind fer í gegnum nanopore rásina, mun það valda breytingu á mismunandi rafmerkjum. Með því að greina og samsvara þessum merkjum er hægt að reikna út samsvarandi grunngerðir og hægt er að ljúka rauntíma uppgötvun röðarinnar.


Þjónustuupplýsingar

Demo niðurstaða

Þjónustuupplýsingar aðgerðir

Pallur

Stærð bókasafns

Fræðileg gögn ávöxtun (á klefi)

Nákvæmni eins basa

Forrit

Nanopore

8kb, 10kb, 20kb, ultralong, cDNA-PCR

70-90GB/klefi

85-92%

SV Calling, de Novo, raðgreining í fullri lengd, ISO-seq, genaskýring, uppgötvun DNA metýleringar

Þjónustu kostir

● Yfir 5 ára reynsla af pacbio raðgreiningarpalli með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsum tegundum.
● BMKGENE er opinber félagi í Oxford Nanopore, með tvöföldum RNA/DNA vottun.
● Það eru almennar gerðir af röð með fullkomnum búnaði og nægjanlegum raðgreiningar.
● Byggt á Nanopore pallinum hafa meira en 10 rannsóknir á dýra og plöntum verið birtar í alþjóðlega þekktum tímaritum.

Dæmi um kröfur


Dæmi um gerð

Upphæð

Styrkur (Qubit ®)

Bindi

Hreinleiki

Aðrir

Erfðafræðilegt DNA

Fer eftir gagnaþörf

 ≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2.2;

OD260/230≥1,5 ;

Tær hámark við 260 nm , engin mengun

Mæla þarf styrk með qubit og qubit/nanopore ≤ 2

Heildar RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Engin mengun

RIN gildi ≥7,5

 

Þjónustuferli

sýnishorn undirbúning

Sýnishorn undirbúning

Undirbúningur bókasafns

Bókasafnsbygging

Raðgreining

Raðgreining

Gagnagreining

Gagnagreining

Sýnishorn qc

Afhending verkefnis


  • Fyrri:
  • Næst:

  • Mat á gögnum gagna á DNA -sýni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    BMKID

    Rawseqnum

    RawSumbase

    CleanSeqnum

    Cleansumbase

    Cleann50len

    CleanN90len

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143,181

    9

    Gagnagæðamat á RNA sýnishorni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    Skráarheiti

    Clientid

    Readnum

    Basenum

    N50

    Meðallengd

    MaxLengd

    MeanQScore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Mynd 1. Dreifing lestrarlengdar

    A3

    Mynd 2. Gæðastig dreifing hreinra gagna

    A4

    Mynd 3. Lengd og gæðastig dreifingar á hreinum gögnum

    A5

    Fáðu tilvitnun

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu þau til okkar

    Sendu skilaboðin þín til okkar: