BMKCloud Log in
条形 banner-03

Vörur

DNA/RNA raðgreining – Nanopore raðgreining

ONT raðgreining er ein sameind í rauntíma rafmerkja raðgreiningartækni sem byggir á nanóporum, raðgreiningarreglan hvers vettvangs er sú sama.Tvíþátta DNA/RNA mun bindast nanoporous próteini sem er fellt inn í líffilmuna og vinda ofan af undir forystu hreyfipróteins, undir áhrifum spennumunar frá báðum hliðum líffilmunnar, fara DNA/RNA þræðir í gegnum nanopore ráspróteinið á ákveðinni hlutfall.Vegna mismunandi efnafræðilegra eiginleika mismunandi basa á DNA/RNA strengnum, þegar ein basi eða DNA sameind fer í gegnum nanopore rásina, mun það valda breytingum á mismunandi rafboðum.Með því að greina og samsvara þessum merkjum er hægt að reikna út samsvarandi grunngerðir og ljúka rauntíma uppgötvun röðarinnar.


Upplýsingar um þjónustu

Niðurstaða kynningar

Þjónustuupplýsingar Eiginleikar

Pallur

Bókasafnsstærð

Fræðileg gagnaafköst (á hólf)

Nákvæmni á einum grunni

Umsóknir

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/klefi

85-92%

SV-kall, De novo, raðgreining í fullri lengd, Iso-Seq, genaskýring, Greining á DNA metýleringu

Þjónustukostir

● Yfir 5 ára reynsla á PacBio raðgreiningarvettvangi með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsum tegundum.
● BMKGENE er opinber samstarfsaðili Oxford Nanopore, með tvískiptur RNA/DNA vottun.
● Það eru til almennar gerðir af röðunartækjum með fullkomnum búnaði og nægilegu raðafköstum.
● Byggt á Nanopore vettvangnum hafa meira en 10 dýra- og plönturannsóknir frá Denovo verið birtar í alþjóðlega þekktum tímaritum.

Dæmi um kröfur


Tegund sýnis

Magn

Styrkur (Qubit ®)

Bindi

Hreinleiki

Aðrir

Erfðafræðilegt DNA

Fer eftir gagnaþörf

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Tær toppur við 260 nm, engin mengun

Mæla þarf styrk með Qubit og Qubit/Nanopore ≤ 2

Heildar RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; engin mengun

RIN gildi ≥7,5

 

Þjónustuverkflæði

undirbúningur sýna

Undirbúningur sýnis

Undirbúningur bókasafns

Bókasafnsbygging

Röðun

Röðun

Gagnagreining

Gagnagreining

Dæmi um QC

Verkefnaafhending


  • Fyrri:
  • Næst:

  • Gagnagæðamat á DNA sýni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    hreinnN50Len

    hreinnN90Len

    hreinnMeanLen

    hreinnMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Gagnagæðamat á RNA sýni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    Skráarnafn

    Auðkenni viðskiptavinar

    ReadNum

    GrunnNum

    N50

    Meðallengd

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Mynd 1. Leslengdardreifing

    A3

    Mynd 2. Dreifing gæðastigs hreinna gagna

    A4

    Mynd 3. Lengd og gæðastigsdreifing hreinna gagna

    A5

    fáðu tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu okkur

    Sendu skilaboðin þín til okkar: