条形 banner-03

Vörur

DNA/RNA raðgreining – Nanopore raðgreinir

ONT-raðgreining er rauntíma rafboðsraðgreiningartækni fyrir staka sameind sem byggir á nanóholum. Raðgreiningarreglan fyrir hvort kerfi er sú sama. Tvíþátta DNA/RNA binst nanóholum próteinum sem eru innfelld í líffilmunni og vindast upp undir áhrifum hreyfipróteina. Undir áhrifum spennumismunar á báðum hliðum líffilmunnar fara DNA/RNA þræðirnir í gegnum nanóholurásina á ákveðnum hraða. Vegna mismunandi efnafræðilegra eiginleika mismunandi basa á DNA/RNA þræðinum, þegar stakur basi eða DNA sameind fer í gegnum nanóholurásina, mun það valda breytingum á mismunandi rafboðum. Með því að greina og samsvara þessum merkjum er hægt að reikna út samsvarandi basategundir og framkvæma rauntímagreiningu á raðinni.


Upplýsingar um þjónustu

Sýningarniðurstaða

Upplýsingar um þjónustu Eiginleikar

Pallur

Stærð bókasafns

Fræðileg gagnanýting (á hverja frumu)

Nákvæmni á einum grunni

Umsóknir

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, ofurlangt, cDNA-PCR

70-90 Gb/farsími

85-92%

SV-köllun, De novo, raðgreining í fullri lengd, Ísó-raðgreining, Genaskýring, Greining á DNA metýleringu

Kostir þjónustu

● Yfir 5 ára reynsla af PacBio raðgreiningarvettvangi með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsum tegundum.
● BMKGENE er opinber samstarfsaðili Oxford Nanopore, með RNA/DNA vottun fyrir bæði kerfin.
● Það eru til almennar gerðir af raðgreiningartækjum með fullkomnum búnaði og nægilegum raðgreiningarafköstum.
● Byggt á Nanopore vettvanginum hafa meira en 10 rannsóknir á dýrum og plöntum frá Denovo verið birtar í alþjóðlega þekktum tímaritum.

Kröfur um sýnishorn


Tegund sýnishorns

Upphæð

Einbeiting (Qubit ®)

Hljóðstyrkur

Hreinleiki

Aðrir

Erfðamengis DNA

Fer eftir gagnakröfum

 ≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Tær toppur við 260 nm, engin mengun

Styrk þarf að mæla með Qubit og Qubit/Nanopore ≤ 2

Heildar-RNA

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5; engin mengun

RIN gildi ≥7,5

 

Þjónustuvinnuflæði

sýnishornsundirbúningur

Undirbúningur sýnis

Undirbúningur bókasafns

Bygging bókasafna

Raðgreining

Raðgreining

Gagnagreining

Gagnagreining

Sýnishorn af gæðaeftirliti

Verkefnisafhending


  • Fyrri:
  • Næst:

  • Gæðamat á DNA-sýni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    BMKID

    rawSeqNum

    hrárSummugrunnur

    hreinsraðnúmer

    hreinnSumBasi

    hreintN50Len

    hreintN90Len

    hreinnMeanLen

    hreinnMaxLen

    hreintMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Gæðamat á RNA sýni

    Tafla 1. Tölfræði um hrein gögn.

    Skráarnafn

    Viðskiptavinaauðkenni

    Lesanúmer

    Grunnnúmer

    N50

    Meðallengd

    Hámarkslengd

    MeðaltalQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Mynd 1. Dreifing lestrarlengdar

    A3

    Mynd 2. Dreifing gæðastiga fyrir hrein gögn

    A4

    Mynd 3. Lengd og gæðastigadreifing hreinna gagna

    A5

    fá tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu þau til okkar

    Sendu okkur skilaboðin þín: