-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq veitir erfðamengi-vítt prófíl DNA-markmiða fyrir histónbreytingar, umritunarþætti og önnur DNA-tengd prótein.Það sameinar sérhæfni krómatínónæmisútfellingar (ChIP) til að endurheimta sértækar prótein-DNA fléttur, með krafti næstu kynslóðar raðgreiningar (NGS) fyrir raðgreiningu með miklum afköstum endurheimts DNA.Þar að auki, vegna þess að prótein-DNA flétturnar eru endurheimtar úr lifandi frumum, er hægt að bera saman bindistaði í mismunandi frumugerðum og vefjum, eða við mismunandi aðstæður.Umsóknir eru allt frá umritunarstjórnun til þroskaferla til sjúkdómsferla og víðar.
Pallur: Illumina NovaSeq 6000
-
Bisúlfít raðgreining í heilu erfðamengi
DNA metýlering í fimmta stöðu í cýtósíni (5-mC) hefur grundvallaráhrif á tjáningu gena og frumuvirkni.Óeðlilegt metýlunarmynstur hefur verið tengt nokkrum sjúkdómum og sjúkdómum, svo sem krabbameini.WGBS hefur orðið gulls ígildi til að rannsaka erfðamengi-breiður metýleringu við eins basa upplausn.
Pallur: Illumina NovaSeq6000
-
Greining fyrir transposasaaðgengilegu krómatíni með raðgreiningu með mikilli afköst (ATAC-seq)
ATAC-seq er raðgreiningaraðferð með mikilli afköstum til að greina aðgengi að litningi um allt erfðamengi, sem er mikilvægt fyrir hnattræna erfðafræðilega stjórn á genatjáningu.Raðunarmillistykki eru sett inn í opin litningasvæði með ofvirkum Tn5 transposasa.Eftir PCR mögnun er raðgreiningarsafn smíðað.Hægt er að fá öll opnu litningasvæðin undir sérstöku rúm-tíma ástandi, ekki aðeins takmörkuð við bindistaði umritunarþáttar eða ákveðið histón breytt svæði.
-
Minni birgða bísúlfít raðgreining (RRBS)
Rannsóknir á DNA metýleringu hafa alltaf verið heitt umræðuefni í sjúkdómsrannsóknum og eru nátengdar genatjáningu og svipgerðaeinkennum.RRBS er nákvæm, skilvirk og hagkvæm aðferð til rannsókna á DNA metýleringu.Auðgun verkefnis- og CpG-eyjasvæða með ensímklofnun (Msp I), ásamt Bisulfite raðgreiningu, veitir háupplausn DNA metýleringargreiningar.
Pallur: Illumina NovaSeq 6000
