Erfðamengi sveppa
Þjónustukostir
● Margar raðgreiningaraðferðir í boði fyrir mismunandi rannsóknarmarkmið
● Mikil reynsla í samsetningu erfðamengis sveppa með yfir 10.000 erfðamengi sem er fullbúið með penna.
● Faglegt tækniaðstoðarteymi eftir sölu sem uppfyllir sérstakar rannsóknarþarfir.
Þjónustulýsingar
| Þjónusta | Röðunaráætlun | Gæði tryggð | Áætlaður afgreiðslutími |
| Sveppa fínt kort | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 virkir dagar |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Sveppapena-heill kort | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Litningafestingarhlutfall >90% | 45 virkir dagar |
Lífupplýsingagreiningar
● Gæðaeftirlit með hráum gögnum
● Erfðamengissamsetning
● Erfðamengiþáttagreining
● Skýring á genaaðgerðum
● Samanburðargreining á erfðaefni
Dæmi um kröfur og afhending
Dæmi um kröfur:
FyrirDNA útdrættir:
| Tegund sýnis | Magn | Einbeiting | Hreinleiki |
| DNA útdrættir | ＞ 1,2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Fyrir vefjasýni:
| Tegund sýnis | Mælt er með sýnishornsmeðferð | Sýnishorn geymsla og sending |
| Einfruma sveppur | Fylgstu með gerinu í smásjá og safnaðu þeim í veldisfasa Flytið ræktunina (sem inniheldur u.þ.b. 3-4.5e9 frumur) yfir í 1,5 eða 2 ml eppendorf.(Haltu á ís) Miðfleyttu rörið í 1 mín. við 14000 g til að safna bakteríum og fjarlægðu flotið vandlega Lokaðu túpunni og frystu bakteríurnar í fljótandi köfnunarefni í að minnsta kosti 1-3 klst.Geymið rörið í -80 ℃ ísskáp. | Frystu sýnin í fljótandi köfnunarefni í 3-4 klukkustundir og geymdu í fljótandi köfnunarefni eða -80 gráður til langtíma geymslu.Sýnisflutningur með þurrís er nauðsynlegur. |
| Makrósveppur | Mælt er með vefjum í virkum vaxtarfasa. Skolaðu vefinn með endotoxínfríu vatni, síðan 70% etónal. Geymið sýnishornið í frystihólkum. |
Þjónustuvinnuflæði
Sýnishorn afhending
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
1.Circos skýringarmynd um erfðaefni sveppa
2. Samanburðarfræðileg erfðafræðigreining: Fylgenfræðilegt tré
