Langar ókóðandi raðgreiningar - Illumina
Kostir þjónustu
●Sameiginleg greining á mRNA og lncRNAMeð því að sameina magngreiningu mRNA umrita við rannsóknir á lncRNA og markmiðum þeirra er hægt að fá ítarlega yfirsýn yfir stjórnunarferlið sem liggur að baki frumuviðbrögðunum.
●Víðtæk sérþekkingVið höfum unnið úr yfir 230.000 sýnum, sem spanna fjölbreytt markmið verkefna og sýnatöku. Við leggjum mikla þekkingu okkar í hvert verkefni.
●Sameiginleg greining á mRNA og lncRNAVið sameinum magngreiningu mRNA umrita við rannsóknir á lncRNA og markmiðum þeirra, sem gerir það mögulegt að fá ítarlega yfirsýn yfir stjórnunarferlið sem liggur að baki frumuviðbrögðunum.
●Strangt gæðaeftirlitVið innleiðum kjarnaeftirlitspunkta á öllum stigum, allt frá sýnishornsundirbúningi til bókasafnsundirbúnings, raðgreiningar og lífupplýsingafræði. Nákvæmt eftirlit okkar tryggir að niðurstöður séu stöðugt hágæða.
●Ítarleg skýringVið notum marga gagnagrunna til að merkja mismunandi tjáð gen (DEG) og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningar. Þessi alhliða aðferð veitir innsýn í frumu- og sameindaferli sem liggja að baki umritunarviðbrögðunum og tryggir að þú fáir allar mögulegar upplýsingar um gögn tilraunarinnar.
●Stuðningur eftir söluVið skiljum hversu mikilvægt það er að vera til staðar, þess vegna nær skuldbinding okkar lengra en til verkefnaloka með þriggja mánaða þjónustu eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á eftirfylgni með verkefnum, aðstoð við bilanaleit og spurninga- og svaratíma til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
Kröfur um sýnishorn og afhending
| Bókasafn | Pallur | Ráðlagðar upplýsingar | Gagnagæðaeftirlit |
| rRNA tæmt stefnubundið bókasafn | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Núkleótíð:
| Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA-mengun sést á geli. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnlínuhæð |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg
Lauf eða fræ: 300 mg
Ávöxtur: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þarmar: 450 mg
Innyfli eða heili: 240 mg
Vöðvi: 600 mg
Bein, hár eða húð: 1,5 g
● Liðdýr:
Skordýr: 9 g
Krabbadýr: 450 mg
● Heilblóð:2 rör
● Frumur: 106 frumur
● Sermi og plasma6 ml
Ráðlagður sýnishornsafhending
Ílát: 2 ml skilvinduglas (Ekki er mælt með álpappír)
Merking sýnishorns: Hópur+afrit t.d. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sending:
1. Þurrís: Sýni þarf að pakka í poka og grafa í þurrís.
2. RNAstable rör: RNA sýni má þurrka í RNA stöðugleikaröri (t.d. RNAstable®) og flytja við stofuhita.
Þjónustuvinnuflæði
Tilraunahönnun
Sýnishornsafhending
RNA útdráttur
Bygging bókasafna
Raðgreining
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Lífupplýsingafræði
- Óunnin gögn
- Gagnagæðaeftirlit
- Erfðamengisröðun
- Genabygging (valfrjáls splicing, hagræðing genabyggingar og spá um nýjar gena)
- Magnbundin greining á genatjáningu
- Mismunadreifingargreining
- DEG skýring og auðgun + mismunandi tjáð lncRNA markgen
- Auðkenning afrits
- lncRNA auðkenning (lncRNA varðveisla og þekkt lncRNA)
- Spá um lncRNA markgen
- Magnbundin lncRNA tjáningarmæling
- Sameiginleg greining með mRNA gögnum
Greining á mismunandi genatjáningu (DEG)
Magnbundin ákvörðun á lncRNA tjáningu – þyrping
Auðgun á lncRNA markgenum
Greining á sameiginlegri staðsetningu mRNA og lncRNA – Circos graf (miðhringurinn er mRNA og innri hringurinn er lncRNA)
Kannaðu framfarirnar sem lncRNA raðgreiningarþjónusta BMKGene hefur gert mögulegar í gegnum úrval rita.
Ji, H. o.fl. (2020) „Auðkenning, virknispá og lykil lncRNA staðfesting á kuldastreitutengdum lncRNA í rottulifur“,Vísindalegar skýrslur2020 10:1, 10(1), bls. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. o.fl. (2021) „Samþætt umritunargreining leiðir í ljós ónæmiskerfið fyrir CyHV-3-ónæman karpastofn“,Landamæri í ónæmisfræði, 12, bls. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ o.fl. (2022) „Forgangsröðun samkeppnishæfra innrænna RNA stjórnkerfa í smáfrumukrabbameini í lungum: Sameindaeiginleikar og lyfjaframbjóðendur“,Landamæri í krabbameinslækningum, 12, bls. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. o.fl. (2020) „Erfðafræðileg greining á samræmdu genakerfi sem liggur að baki ljóstillífun í Populus“,Tímarit um plöntulíftækni, 18(4), bls. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. o.fl. (2022) „Alþjóðlegt eftirlitsnet fyrir óreglulega genatjáningu og óeðlilega efnaskiptaboð í ónæmisfrumum í örumhverfi Graves-sjúkdóms og Hashimoto-skjaldkirtilsbólgu“,Landamæri í ónæmisfræði, 13, bls. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
