Vörur

Metatranscriptome raðgreining

Með því að nýta Illumina raðgreiningartækni, afhjúpar metatranscriptome raðgreiningarþjónustan frá BMKGENE kraftmikla genatjáningu fjölbreyttrar örvera, sem spannar heilkjörnunga til dreifkjörnunga og veira, innan náttúrulegs umhverfis eins og jarðvegs, vatns, sjós, hægða og þörmanna. Alhliða þjónusta okkar gerir rannsakendum kleift að kafa ofan í fullkomna genatjáningarsnið flókinna örverusamfélaga. Fyrir utan flokkunarfræðilega greiningu, auðveldar metatranscriptome raðgreiningarþjónustan könnun á hagnýtri auðgun, varpar ljósi á mismunandi gena og hlutverk þeirra. Afhjúpaðu mikið af líffræðilegri innsýn þegar þú vafrar um flókið landslag genatjáningar, flokkunarfræðilegrar fjölbreytni og hagnýtrar gangverki innan þessara fjölbreyttu umhverfissviða.

Hafðu samband

Upplýsingar um þjónustu

Lífupplýsingafræði

Niðurstöður kynningar

Valin rit

Þjónustueiginleikar

● rRNA eyðingu fylgt eftir með stefnubundinni mRNA safnundirbúning.

● Röðun á Illumina NovaSeq.

Þjónustukostir

●Rannsakaðu breytingar á flóknum örverusamfélögum:Þetta gerist á umritunarstigi og kanna hugsanleg ný gen.

●Útskýrir samskipti örverusamfélagsins við gestgjafann eða umhverfið.

●Alhliða lífupplýsingagreining: Þetta veitir innsýn í flokkunarfræðilegar og hagnýtar samsetningar samfélagsins, svo og mismunagreiningu á genatjáningu.

●Umfangsmikil genaskýring:Notkun uppfærðra genavirknigagnagrunna fyrir upplýsandi genatjáningarupplýsingar um örverusamfélög.

●Stuðningur eftir sölu:Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.

Þjónustulýsingar

Röðunarvettvangur	Röðunaráætlun	Mælt er með gögnum	Gagnagæðaeftirlit
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Dæmi um kröfur

Styrkur (ng/µL)	Heildarmagn (µg)	Rúmmál (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1,0	≥20	1,8-2,0	1,0-2,5	≥6,5

Þjónustuvinnuflæði

Sýnishorn afhending

Bygging bókasafna

Röðun

Gagnagreining

Þjónusta eftir sölu

Fyrri: Ný sveppaerfðasamkoma

Næst: Dreifkjörnunga RNA raðgreining

Inniheldur eftirfarandi greiningu:

● Röðun gagnagæðaeftirlits

● Afritsþing

● Flokkunarfræðileg skýring og gnægð

● Hagnýtur athugasemd og gnægð

● Tjáningamæling og mismunagreining

Flokkunarfræðileg dreifing hvers úrtaks:

Beta fjölbreytileikagreining: UPGMA

Hagnýtur athugasemd - GO gnægð

Differentiell flokkunargæði – LEFSE

Kannaðu framfarirnar sem auðveldað er af meta transcriptomics raðgreiningarþjónustu BMKGene í gegnum safn rita.

Lu, Z. o.fl. (2023) „Sýruþol baktería sem notar laktat af röðinni Bacteroidales stuðlar að því að koma í veg fyrir brjóstsýrublóðsýringu hjá geitum sem eru aðlagaðar að þéttu fóðri“,Dýranæring, 14, bls. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. o.fl. (2017) „Unraveling kjarna starfrænnar örveru í hefðbundinni gerjun í föstu formi með mikilli afkastamplikonum og metatranscriptomics raðgreiningu“,Landamæri í örverufræði, 8 (JÚL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. o.fl. (2022) „Nýjar mycoviruses uppgötvaðar úr metatranscriptomics könnun á plöntusjúkdómsvaldandi Alternaria sveppum“,Veirur, 14(11), bls. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. o.fl. (2022) „Samhliða metatranscriptome greining leiðir í ljós niðurbrot á efri umbrotsefnum plantna af völdum bjöllur og þarmasamhverfa þeirra“,sameinda Vistfræði, 31(15), bls. 3999–4016. Doi: 10.1111/MEC.16557.