Vörur

Röðun heils genamengis plantna/dýra

Röðun plöntu/dýra í heilu erfðamengi Valin mynd

Endurröðun alls erfðamengisins, einnig þekkt sem WGS, gerir kleift að sýna bæði algengar og sjaldgæfar stökkbreytingar á öllu erfðamenginu, þar með talið Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV) og Copy Number Variation (CNV) ).SV eru stærri hluti breytileikagrunnsins en SNP og hafa meiri áhrif á erfðamengið, sem hefur veruleg áhrif á lífverur.Langlestur endurröðun gerir ráð fyrir nákvæmari auðkenningu stórra brota og flókinna afbrigða vegna þess að langur lestur gerir það mun auðveldara að fara yfir flókin svæði á litningum eins og tandem endurtekningar, GC/AT-rík svæði og ofbreytileg svæði.

Pallur: Illumina, PacBio, Nanopore

Hafðu samband við okkur

Upplýsingar um þjónustu

Niðurstaða kynningar

Valið rit

1.Þjónustukostir

Mikil reynsla í erfðamengisröðun fyrir yfir 1000 tegundir.

Yfir 800 birt tilvik með uppsafnaðan áhrifaþátt upp á yfir 4000.

Alhliða lífupplýsingagreining á tilbrigðakalli og virknigreiningu.

2. Þjónustulýsingar

Pallur		Bókasafn	Mælt er með seq dýpt
Illumina		PE 150	Fyrir SNP, InDel símtöl ≥ 10x Fyrir SV, CNY símtöl ≥ 30x
Nanopore		8 kb	Fyrir SV, CNY símtöl ≥ 20x
Pacbio	CCS	15 kb	Fyrir SNP, InDel, SV, CNY símtöl ≥ 10x

3. Dæmi um kröfur

Pallur		Samþ.(ng/μL)	Magn (ng)	Hreinleiki		Agarósa hlaup
				OD260/280	OD260/230	1. Hreinsa aðalhljómsveit með engu eða takmörkuðuniðurbrot sem sést á hlaupi. 2. Engin eða takmörkuð RNA- eða próteinmengun
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopore		≥30	Fer eftir gagnaafköstum 10μg/klefa	1,7-2,2	≥1,5
Pacbio	CCS	≥50		1,7-2,2	1,8-2,5

4. Lífupplýsingagreining

5. Þjónustuverkflæði

Sýnishorn afhending

DNA útdráttur

Bókasafnsbygging

Röðun

Gagnagreining

Gagnaafhending

Fyrri: BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Næst: Einkjarna RNA röðun

1) Tölfræði um kortlagningu erfðamengis

Tafla 1 Tölfræði yfir niðurstöður kortlagningar

Mynd 1 Dreifing á innleggsstærð og lestur umfangs.

2) Variate Detection

Mynd 2 Tölfræði og skýring á SNP/INDEL/SV meðal sýna

Mynd 3 Erfðamengi-breiður dreifing vatiations

3) Hagnýtur skýring á afbrigðum

2019	Náttúrusamskipti	Endurröðun heils erfðaefnis leiðir í ljós Brassica napus uppruna og erfðafræðilegar staðsetningar sem taka þátt í endurbótum þess
2020	PNAS	Þróunaruppruni og heimilissaga gullfiska (Carassius auratus)
2021	Plöntulíftækniblað	Tilvísunarerfðamengi tveggja ræktuðu jútutegundanna
2021	Plöntulíftækniblað	Erfðafræðileg einkenni jurta- og olíufræja allopolyploid Brassicajuncea og erfðafræðilegar staðsetningar sem stjórna uppsöfnun glúkósínólata
2019	Sameindaplanta	Endurröðun alls erfðaefnis á heimsvísu safni repjufræja sýnir erfðafræðilegan grundvöll mismunandi vistgerða þeirra
2022	Garðyrkjurannsóknir	Sambandsgreining á erfðamengi veitir sameindainnsýn í náttúrulega breytileika vatnsmelónufræstærðar
2021	Journal of Experimental Botany	Rannsókn á erfðamengi um tengsl greinir afbrigði af GhSAD1 sem veita kuldaþol í bómull
2021	Journal of Experimental Botany	Rannsókn á erfðamengi tengsla og samanburður á umritum sýna ný QTL og frambjóðandi gen sem stjórna stærð krónublaða í repjufræjum