Lítil RNA raðgreining - Illumina
Eiginleikar
● Undirbúningur stærðarvalsbókasafns.
● Lífupplýsingagreining sem snýst um spá og markmið miRNA.
Kostir þjónustu
●Víðtæk sérþekkingVið höfum unnið úr yfir 300 sýni, af ýmsum gerðum. Við leggjum mikla þekkingu okkar í hvert verkefni.
●Strangt gæðaeftirlitVið innleiðum kjarnaeftirlitspunkta á öllum stigum, allt frá sýnishornsundirbúningi til bókasafnsundirbúnings, raðgreiningar og lífupplýsingafræði. Nákvæmt eftirlit okkar tryggir að niðurstöður séu stöðugt hágæða.
●Ítarleg lífupplýsingagreining:Það gerir kleift að bera kennsl á bæði þekkt og ný miRNA, bera kennsl á markmið miRNA og samsvarandi virkniskýringar og auðgun með mörgum gagnagrunnum (KEGG, GO).
●Stuðningur eftir söluVið skiljum hversu mikilvægt það er að vera til staðar, þess vegna nær skuldbinding okkar lengra en til verkefnaloka með þriggja mánaða þjónustu eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á eftirfylgni með verkefnum, aðstoð við bilanaleit og spurninga- og svaratíma til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
Kröfur um sýnishorn og afhending
| Bókasafn | Pallur | Ráðlagðar upplýsingar | Gagnagæðaeftirlit |
| Stærð valin | Illumina SE50 | 10M-20M lestur | Q30≥85% |
Kröfur um sýnishorn:
Núkleótíð:
| Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA-mengun sést á geli. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnlínuhæð |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg
Lauf eða fræ: 300 mg
Ávöxtur: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þarmar: 450 mg
Innyfli eða heili: 240 mg
Vöðvi: 600 mg
Bein, hár eða húð: 1,5 g
● Liðdýr:
Skordýr: 9 g
Krabbadýr: 450 mg
● Heilblóð2 rör
● Frumur: 106 frumur
● Sermi og plasma:6 ml
Ráðlagður sýnishornsafhending
Ílát: 2 ml skilvinduglas (Ekki er mælt með álpappír)
Merking sýnishorns: Hópur+afrit t.d. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sending:
1. Þurrís: Sýni þarf að pakka í poka og grafa í þurrís.
2. RNAstable rör: RNA sýni má þurrka í RNA stöðugleikaröri (t.d. RNAstable®) og flytja við stofuhita.
Þjónustuvinnuflæði
Tilraunahönnun
Sýnishornsafhending
RNA útdráttur
Bygging bókasafna
Raðgreining
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Lífupplýsingafræði
● Gæðaeftirlit með hrágögnum
● Flokkun lítilla RNA
● miRNA tjáning og mismunandi tjáningargreining
● Skýringar á miRNA markgeni og mismunandi tjáðu miRNA markgeni
● Skýringar á markgenum og auðgun á genavirkni miRNA á mismunandi hátt
Auðkenning miRNA: uppbygging og dýpt
Mismunandi tjáning miRNA – stigveldisþyrping
Virkniskýring á markmiði mismunandi tjáðra miRNA
Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem sRNA raðgreiningarþjónusta BMKGene hefur auðveldað í gegnum safn ritrýndra greina.
Chen, H. o.fl. (2023) „Veirusýkingar hamla sapónínmyndun og ljóstillífun í Panax notoginseng“,Plöntulífeðlisfræði og lífefnafræði, 203, bls. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. o.fl. (2023) „Próteinið FREE1, sem inniheldur FYVE-lénið í plöntunni, tengist örgjörvaþáttum til að bæla niður myndun miRNA“.EMBO skýrslur, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. o.fl. (2023) „MikroRNA Ame-Bantam-3p stýrir þroska lirfupúpa með því að miða á genið fyrir marga húðþekjuvaxtarþætti (megf8) í hunangsflugunni Apis mellifera“.Alþjóðlegt tímarit um sameindavísindi, 24(6), bls. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. o.fl. (2018) „Samþætt greining á MiRNA og genum sem tengjast gæðum kjöts sýnir að Gga-MiR-140-5p hefur áhrif á fituútfellingu í vöðva hjá kjúklingum“.Frumulífeðlisfræði og lífefnafræði, 46(6), bls. 2421–2433. Doi: 10.1159/000489649.
