-
MRNA raðgreining í fullri lengd-Nanopore
RNA raðgreining hefur verið ómetanlegt tæki til yfirgripsmikilla umritagreininga.Vafalaust hefur hefðbundin stuttlestraröð náð margvíslegri þróun hér.Engu að síður lendir það oft í takmörkunum við auðkenningu ísóforma í fullri lengd, magngreiningu, PCR hlutdrægni.
Nanopore raðgreining aðgreinir sig frá öðrum raðgreiningarpöllum, að því leyti að núkleótíðin eru lesin beint án DNA nýmyndunar og mynda langan lestur við tugi kílóbasa.Þetta gerir kleift að lesa út yfir afrit í fullri lengd og takast á við áskoranirnar í rannsóknum á isoform-stigi.
Pallur：Nanopore PromethION
Bókasafn:cDNA-PCR
-
De novo Transcriptome raðgreining í fullri lengd -PacBio
Nýjastaraðritun í fullri lengd, einnig þekkt semNýjastaIso-Seq nýtir sér kosti PacBio raðgreinar í lestrarlengd, sem gerir raðgreiningu cDNA sameinda í fullri lengd kleift án nokkurra hléa.Þetta kemur algjörlega í veg fyrir allar villur sem myndast í afritssamsetningarskrefum og smíðar samsett sett með upplausn á ísóformi.Þessi einingasett veitir öflugar erfðafræðilegar upplýsingar sem „viðmiðunarerfðamengi“ á umritunarstigi.Að auki, með því að sameina næstu kynslóðar raðgreiningargögn, gerir þessi þjónusta nákvæma magngreiningu á tjáningu á ísóformi.
Pall: PacBio Sequel IIBókasafn: SMRT bjöllubókasafn -
Heilkjörnunga mRNA raðgreiningu-Illumina
mRNA raðgreining gerir sniðgreiningu á öllum mRNA sem eru umrituð úr frumum við sérstakar aðstæður.Það er öflug tækni til að sýna genatjáningarsnið, genabyggingu og sameindaferli ákveðinna líffræðilegra ferla.Hingað til hefur mRNA raðgreining verið mikið notuð í grundvallarrannsóknum, klínískum greiningu, lyfjaþróun o.s.frv.
Pallur: Illumina NovaSeq 6000
-
MRNA raðgreiningar-Illumina sem ekki byggir á tilvísun
mRNA raðgreining notar næstu kynslóðar raðgreiningartækni (NGS) til að fanga boðbera RNA(mRNA) mynd heilkjörnunga á ákveðnu tímabili sem sumar sérstakar aðgerðir eru að virkja.Lengsta afritið sem var splæst var kallað „Unigene“ og notað sem viðmiðunarröð fyrir síðari greiningu, sem er áhrifarík leið til að rannsaka sameindakerfi og stjórnkerfi tegundarinnar án tilvísunar.
Eftir umritsgagnasamsetningu og óviðeigandi virka skýringu
(1) SNP-greining, SSR-greining, CDS-spá og genabygging verða forsköpuð.
(2) Framkvæmd verður magngreining á tjáningu frumefnis í hverju sýni.
(3) Mismunandi tjáð einfrumuefni milli sýna (eða hópa) verða uppgötvað á grundvelli einingatjáningar
(4) Framkvæmd verður klasagerð, hagnýtur skýring og auðgunargreining á mismunandi tjáðum einstofnum
-
Löng ókóðun raðgreining - Illumina
Löng ókóðun RNA (lncRNA) eru tegund RNA sameinda með lengd yfir 200 nt, sem einkennast af mjög lágum kóðamöguleika.LncRNA, sem lykilþáttur í RNA sem ekki er kóða, er aðallega að finna í kjarna og plasma.Þróun í raðgreiningartækni og lífupplýsingafræði gerir kleift að bera kennsl á fjölda nýrra lncRNAs og tengja þau við líffræðilega virkni.Uppsöfnuð sönnunargögn benda til þess að lncRNA eigi víða þátt í stjórnun á erfðaefni, umritunarstjórnun og stjórnun eftir umritun.
-
Lítil RNA raðgreining-Illumina
Lítið RNA vísar til flokks RNA sameinda sem ekki eru kóðaðar og eru venjulega minni en 200 nt að lengd, þar á meðal ör-RNA (miRNA), lítið truflunar-RNA (siRNA) og piwi-víxlverkandi RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) er flokkur innræns lítils RNA með lengd um það bil 20-24nt, sem gegnir margvíslegum mikilvægum stjórnunarhlutverkum í frumum.miRNA tekur þátt í mörgum lífsferlum sem sýna vef - sértæka og stigs - sértæka tjáningu og mjög varðveitt í mismunandi tegundum.
-
circRNA raðgreiningu-Illumina
Raðgreining heilrar umrita er hönnuð til að gera grein fyrir öllum gerðum RNA sameinda, þar á meðal kóða (mRNA) og RNA sem ekki eru kóðaðar (þar á meðal lncRNA, circRNA og miRNA) sem eru umrituð af sérstökum frumum á ákveðnum tíma.Heildar umritaröðun, einnig þekkt sem „heildar RNA raðgreining“ miðar að því að sýna yfirgripsmikið eftirlitsnet á umritastigi.Með því að nýta NGS tæknina eru raðir af heilum transcriptome afurðum fáanlegar fyrir ceRNA greiningu og sameiginlega RNA greiningu, sem gefur fyrsta skrefið í átt að starfrænni persónugreiningu.Sýnir stjórnunarnet circRNA-miRNA-mRNA byggt ceRNA.
-
Heildar umritaröðun – Illumina
Raðgreining heilrar umrita er hönnuð til að gera grein fyrir öllum gerðum RNA sameinda, þar á meðal kóða (mRNA) og RNA sem ekki eru kóðaðar (þar á meðal lncRNA, circRNA og miRNA) sem eru umrituð af sérstökum frumum á ákveðnum tíma.Heildar umritaröðun, einnig þekkt sem „heildar RNA raðgreining“ miðar að því að sýna yfirgripsmikið eftirlitsnet á umritastigi.Með því að nýta NGS tæknina eru raðir af heilum transcriptome afurðum fáanlegar fyrir ceRNA greiningu og sameiginlega RNA greiningu, sem gefur fyrsta skrefið í átt að starfrænni persónugreiningu.Sýnir stjórnunarnet circRNA-miRNA-mRNA byggt ceRNA.
-
Dreifkjörnunga RNA raðgreining
Dreifkjörnunga RNA raðgreining notar næstu kynslóðar raðgreiningu (NGS) til að sýna tilvist og magn RNA á tilteknu augnabliki, með því að greina breytt frumu umrit.Dreifkjörnunga RNA raðgreining fyrirtækisins okkar miðar sérstaklega að dreifkjörnungum með viðmiðunarerfðamengi, sem veitir þér umritunarsnið, greiningu á genabyggingu o.s.frv. Það hefur verið mikið notað til grunnvísindarannsókna, lyfjarannsókna og -þróunar og fleira.
Pallur: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome raðgreining
Metatranscriptome raðgreining auðkennir genatjáningu örvera (bæði heilkjörnunga og dreifkjörnunga) í náttúrulegu umhverfi (þ.e. jarðvegi, vatni, sjó, saur og þörmum.). Nánar tiltekið gerir þessi þjónusta þér kleift að fá heildar genatjáningarsnið flókinna örverusamfélaga, flokkunarfræðilega greiningu tegunda, virkniauðgunargreiningu á mismunandi tjáðum genum og fleira.
Pallur: Illumina NovaSeq 6000
