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Il sequenziamento ONT è una tecnologia di sequenziamento di segnali elettrici in tempo reale a singola molecola basata su nanopori; il principio di sequenziamento di entrambe le piattaforme è lo stesso. Il DNA/RNA a doppio filamento si legherà alla proteina nanoporosa incorporata nel biofilm e si srotolerà sotto la guida della proteina motrice; sotto l'azione della differenza di tensione su entrambi i lati del biofilm, i filamenti di DNA/RNA attraverseranno il canale proteico del nanoporo a una certa velocità. A causa delle diverse proprietà chimiche delle diverse basi sul filamento di DNA/RNA, quando una singola base o molecola di DNA attraversa il canale del nanoporo, causerà la variazione di diversi segnali elettrici. Rilevando e confrontando questi segnali, è possibile calcolare i tipi di base corrispondenti e completare il rilevamento in tempo reale della sequenza.