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Prodotti

Sequenziamento dell'mRNA eucariotico-Illumina

Il sequenziamento dell'mRNA consente la profilazione di tutti gli mRNA trascritti dalle cellule in condizioni specifiche.È una potente tecnologia per rivelare il profilo di espressione genica, le strutture geniche e i meccanismi molecolari di determinati processi biologici.Ad oggi, il sequenziamento dell'mRNA è stato ampiamente impiegato nella ricerca fondamentale, nella diagnostica clinica, nello sviluppo di farmaci, ecc.

Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000


Dettagli del servizio

Bioinformatica

Risultati demo

Vantaggi

ØAlta esperienza: oltre 200.000 campioni sono stati elaborati in BMK coprendo diversi tipi di campioni, tra cui colture cellulari, tessuti, fluidi corporei, ecc. e oltre 7.000 progetti mRNA-Seq chiusi che coprono varie aree di ricerca.

ØSistema di controllo della qualità rigoroso: i punti di controllo della qualità principali in tutte le fasi, inclusa la preparazione del campione, la preparazione della libreria, il sequenziamento e la bioinformatica, sono sotto stretto monitoraggio per fornire risultati di alta qualità.

ØDatabase multipli disponibili per annotazioni di funzioni e studi di arricchimento per soddisfare diversi obiettivi di ricerca.

ØServizi post-vendita: servizi post-vendita validi per 3 mesi dal completamento del progetto, inclusi follow-up dei progetti, risoluzione dei problemi, domande e risposte sui risultati, ecc.

Requisiti del campione e consegna

Biblioteca Strategia di sequenziamento Dati consigliati Controllo di qualità
Poli A arricchito Illumina PE150

6 GB

Q30≥85%

Requisiti del campione:

Nucleotidi:

Purezza Integrità Importo
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Contaminazione limitata o assente di proteine ​​o DNA mostrata sul gel. Per le piante: RIN≥6,5; Per gli animali: RIN≥7;28S/18S≥1,0;elevazione basale limitata o nulla conc.≥30 ng/μl;Volume ≥ 10 μl;Totale ≥ 1,5 μg

Tessuto: Peso (asciutto):≥1 g
*Per i tessuti di dimensioni inferiori a 5 mg, si consiglia di inviare un campione di tessuto congelato (in azoto liquido).

Sospensione cellulare:Conteggio cellule = 3×106- 1×107
*Si consiglia di spedire il lisato cellulare congelato.Nel caso in cui la conta cellulare sia inferiore a 5×105, si consiglia di congelare il flash in azoto liquido, che è preferibile per la microestrazione.

Campioni di sangue:Volume≥1 ml

Microrganismo:Massa ≥ 1 g

Consegna del campione consigliata

Contenitore: provetta da centrifuga da 2 ml (non si consiglia la carta stagnola)

Esempio di etichettatura: Gruppo+replica es. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Spedizione:

  1. Ghiaccio secco: i campioni devono essere imballati in sacchi e sepolti nel ghiaccio secco.
  2. Provette RNAstable: i campioni di RNA possono essere essiccati in provette di stabilizzazione dell'RNA (ad es. RNAstable®) e spediti a temperatura ambiente.

Flusso di lavoro del servizio

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Progettazione dell'esperimento

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Consegna del campione

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Estrazione dell'RNA

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Costruzione della biblioteca

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Sequenza

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Analisi dei dati

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Servizi post vendita


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  • Bioinformatica

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    eucariotico Flusso di lavoro di analisi del sequenziamento dell'mRNA

    Bioinformatica

    ØControllo della qualità dei dati grezzi

    ØAllineamento del genoma di riferimento

    ØAnalisi della struttura della trascrizione

    ØQuantificazione dell'espressione

    ØAnalisi dell'espressione differenziale

    ØAnnotazione e arricchimento di funzioni

    1.Curva di saturazione dei dati dell'mRNA

    3(1)

    2.Analisi dell'espressione differenziale-Vulcano plot

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    3.Annotazione KEGG sui DEG

    5(1)

    4.Classifica GO su DEG

    6(1)

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