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Sequenziamento dell'mRNA eucariotico-Illumina

Il sequenziamento dell'mRNA consente la profilazione di tutti gli mRNA trascritti dalle cellule in condizioni specifiche.Si tratta di una potente tecnologia per rivelare il profilo di espressione genetica, le strutture genetiche e i meccanismi molecolari di alcuni processi biologici.Ad oggi, il sequenziamento dell'mRNA è stato ampiamente utilizzato nella ricerca fondamentale, nella diagnostica clinica, nello sviluppo di farmaci, ecc.

Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq

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Dettagli del servizio

Bioinformatica

Risultati dimostrativi

Vantaggi

● Alta esperienza: oltre 200.000 campioni sono stati elaborati in BMK coprendo diversi tipi di campioni, tra cui colture cellulari, tessuti, fluidi corporei, ecc. e oltre 7.000 progetti mRNA-Seq chiusi che coprono varie aree di ricerca.

● Rigoroso sistema di controllo della qualità: i principali punti di controllo della qualità in tutte le fasi, tra cui la preparazione dei campioni, la preparazione delle librerie, il sequenziamento e la bioinformatica, sono sotto stretto monitoraggio al fine di fornire risultati di alta qualità.

● Diversi database disponibili per l'annotazione delle funzioni e gli studi di arricchimento per soddisfare diversi obiettivi di ricerca.

● Servizi post-vendita: servizi post-vendita validi per 3 mesi dal completamento del progetto, inclusi follow-up dei progetti, risoluzione dei problemi, domande e risposte sui risultati, ecc.

Requisiti e consegna del campione

Biblioteca	Strategia di sequenziamento	Dati consigliati	Controllo di qualità
Poli A arricchito	Illumina PE150	6 GB	Q30≥85%

Requisiti del campione:

Nucleotidi:

Concentrazione (ng/μl)

Quantità (μg)

Purezza

Integrità

≥ 20

≥ 0,5

DE260/280=1,7-2,5

DE260/230=0,5-2,5

Contaminazione limitata o assente di proteine o DNA mostrata sul gel.

Per gli impianti: RIN≥6,5;

Per gli animali: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevazione della linea di base limitata o assente

Tessuto: Peso (asciutto):≥1 g
*Per tessuti di peso inferiore a 5 mg, si consiglia di inviare campioni di tessuto congelati istantaneamente (in azoto liquido).

Sospensione cellulare:Conteggio delle cellule = 3×10⁶-1×10⁷
*Si consiglia di spedire il lisato cellulare congelato.Nel caso in cui la cella conteggi inferiore a 5×105.

Campioni di sangue:Volume≥1ml

Microrganismo:Massa ≥ 1 g

Consegna del campione consigliata

Contenitore: provetta da centrifuga da 2 ml (la carta stagnola non è consigliata)

Etichettatura del campione: Gruppo+replica, ad esempio A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Spedizione:

Ghiaccio secco: i campioni devono essere confezionati in sacchetti e sepolti nel ghiaccio secco.
Provette RNAstable: i campioni di RNA possono essere essiccati in provette di stabilizzazione dell'RNA (ad esempio RNAstable®) e spediti a temperatura ambiente.