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Prodotti

Analisi di associazione su tutto il genoma

Lo studio di associazione sull'intero genoma (GWAS) mira a identificare varianti genetiche (genotipo) associate a tratti specifici (fenotipo).Lo studio GWAS indaga i marcatori genetici che attraversano l'intero genoma di un gran numero di individui e prevede le associazioni genotipo-fenotipo mediante analisi statistica a livello di popolazione.È stato ampiamente applicato nella ricerca sulle malattie umane e nell'estrazione genetica funzionale su tratti complessi di animali o piante.


Dettagli del servizio

Risultato dimostrativo

Pubblicazione in primo piano

immagine3

1.Vantaggi del servizio

● Numerosi casi di progetti: dalla sua fondazione nel 2009, BMKGENE ha completato centinaia di progetti sulle specie nella ricerca GWAS sulla popolazione, ha assistito i ricercatori nella pubblicazione di più di 100 articoli e il fattore di impatto cumulativo ha raggiunto 500.
● Analisti professionisti.
● Breve ciclo di analisi.
● Estrazione accurata dei dati.

2. Specifiche del servizio

Tipo

Scala della popolazione

Strategia e profondità del sequenziamento

SLAF-GWAS Numero di campioni ≥200 Dimensione del genoma < 400 M, con genoma di riferimento, si consiglia WGS

Dimensione del genoma ≤ 1G, 100.000 tag e 10X

1G ≤ dimensione del genoma ≤ 2G, 200.000 tag e 10X

Dimensione del genoma > 2G, 300.000 tag e 10X

WGS-GWAS

Numero di campioni ≥200

10X per ogni campione

3. Selezione dei materiali

动物1
动物2
immagine7

Diverse varietà, sottospecie, varietà autoctone/banche genetiche/famiglie miste/risorse selvatiche

Diverse varietà, sottospecie, varietà autoctone

Famiglia di fratellastri/famiglia di fratelli pieni/risorse selvagge

4. Analisi della bioinformazione

● Analisi di associazione sull'intero genoma
● Analisi e screening di SNP significativi
● Annotazione funzionale del gene candidato

5. Flusso di lavoro del servizio

Controllo qualità del campione

Progettazione dell'esperimento

consegna del campione

Consegna del campione

Esperimento pilota

Estrazione dell'RNA

Preparazione della biblioteca

Costruzione della biblioteca

Sequenziamento

Sequenziamento

Analisi dei dati

Analisi dei dati

Servizi post vendita

Servizi post-vendita


  • Precedente:
  • Prossimo:

  • UN.Controllo qualità del fenotipo

    Istogramma della distribuzione della frequenza

    immagine9

    Statistiche del fenotipo

    immagine10

    B.Analisi di associazione (Modello: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    Trama QQ

    immagine11

    Trama di Manhattan

    Ammoniaca_emmax_manhattan_00

    Anno

    rivista

    IF

    Titolo

    2022

    NC

    17.69

    Base genomica dei giga-cromosomi e giga-genoma della peonia arborea Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Le impronte della domesticazione ancorano le regioni genomiche di importanza agronomica nella soia

    2018

    MP

    9.32

    Il risequenziamento dell’intero genoma di una raccolta mondiale di accessioni di colza rivela la base genetica della loro divergenza di ecotipi

    2022

    HR

    7.29

    L’analisi dell’associazione dell’intero genoma fornisce approfondimenti molecolari sulla variazione naturale delle dimensioni dei semi di anguria

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