-
Sequenziamento dell'immunoprecipitazione della cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq fornisce la profilazione dell'intero genoma dei target del DNA per la modificazione degli istoni, i fattori di trascrizione e altre proteine associate al DNA.Combina la selettività dell'immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) per recuperare specifici complessi proteina-DNA, con la potenza del sequenziamento di prossima generazione (NGS) per il sequenziamento ad alto rendimento del DNA recuperato.Inoltre, poiché i complessi proteina-DNA vengono recuperati da cellule viventi, i siti di legame possono essere confrontati in diversi tipi di cellule e tessuti o in condizioni diverse.Le applicazioni spaziano dalla regolazione trascrizionale ai percorsi di sviluppo fino ai meccanismi delle malattie e oltre.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
-
Sequenziamento dell'intero genoma con bisolfito
La metilazione del DNA alla quinta posizione nella citosina (5-mC) ha un'influenza fondamentale sull'espressione genica e sull'attività cellulare.Modelli di metilazione anormali sono stati associati a diverse condizioni e malattie, come il cancro.Il WGBS è diventato il gold standard per lo studio della metilazione dell'intero genoma con risoluzione a base singola.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
-
Saggio per la cromatina accessibile alla trasposasi con sequenziamento ad alta produttività (ATAC-seq)
ATAC-seq è un metodo di sequenziamento ad alto rendimento per l'analisi dell'accessibilità della cromatina a livello dell'intero genoma, che è importante per il controllo epigenetico globale dell'espressione genica.Gli adattatori di sequenziamento vengono inseriti nelle regioni di cromatina aperte mediante trasposasi Tn5 iperattiva.Dopo l'amplificazione mediante PCR, viene costruita una libreria di sequenziamento.Tutte le regioni di cromatina aperte possono essere ottenute in una specifica condizione spazio-temporale, non solo limitata ai siti di legame di un fattore di trascrizione, o ad una certa regione modificata dall'istone.
-
Sequenziamento del bisolfito a rappresentazione ridotta (RRBS)
La ricerca sulla metilazione del DNA è sempre stata un argomento caldo nella ricerca sulle malattie ed è strettamente correlata all’espressione genica e ai tratti fenotipici.RRBS è un metodo accurato, efficiente ed economico per la ricerca sulla metilazione del DNA.L'arricchimento del promotore e delle regioni insulari CpG mediante scissione enzimatica (Msp I), combinato con il sequenziamento del bisolfito, fornisce il rilevamento della metilazione del DNA ad alta risoluzione.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
