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Prodotti

Sequenziamento di piccoli RNA-Illumina

Le molecole di piccoli RNA (sRNA), tipicamente inferiori a 200 nucleotidi di lunghezza, includono microRNA (miRNA), piccoli RNA interferenti (siRNA) e RNA che interagiscono con piwi (piRNA).Tra questi, i miRNA, lunghi circa 20-24 nucleotidi, sono particolarmente degni di nota per il loro ruolo regolatorio fondamentale in vari processi cellulari.Con modelli di espressione specifici del tessuto e dello stadio, i miRNA mostrano un'elevata conservazione tra specie diverse.

Piattaforma: Illumina NovaSeq


Dettagli del servizio

Bioinformatica

Risultati dimostrativi

Pubblicazioni in primo piano

Caratteristiche

● Selezione delle dimensioni dell'RNA prima della preparazione della libreria

● Analisi bioinformatica incentrata sulla previsione dei miRNA e sui loro obiettivi

Vantaggi del servizio

Analisi bioinformatica completa:consentendo l'identificazione di miRNA sia noti che nuovi, l'identificazione dei bersagli dei miRNA e la corrispondente annotazione funzionale e l'arricchimento con più database (KEGG, GO)

Controllo qualità rigoroso: implementiamo punti di controllo fondamentali in tutte le fasi, dalla preparazione dei campioni e delle librerie al sequenziamento e alla bioinformatica.Questo meticoloso monitoraggio garantisce la fornitura di risultati costantemente di alta qualità.

Supporto post-vendita: Il nostro impegno si estende oltre il completamento del progetto con un periodo di servizio post-vendita di 3 mesi.Durante questo periodo, offriamo follow-up del progetto, assistenza per la risoluzione dei problemi e sessioni di domande e risposte per rispondere a qualsiasi domanda relativa ai risultati.

Ampia competenza: con un track record di chiusura con successo di molteplici progetti sRNA che coprono oltre 100 specie in vari settori di ricerca, il nostro team apporta una vasta esperienza a ogni progetto.

Requisiti e consegna del campione

Biblioteca

piattaforma

Dati consigliati

Controllo qualità dei dati

Taglia selezionata

Illumina SE50

10M-20M letture

Q30≥85%

Requisiti del campione:

Nucleotidi:

Concentrazione (ng/μl)

Quantità (μg)

Purezza

Integrità

≥ 80

≥ 0,5

DE260/280=1,7-2,5

DE260/230=0,5-2,5

Contaminazione limitata o assente di proteine ​​o DNA mostrata sul gel.

RIN≥6,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevazione della linea di base limitata o assente

● Piante:

Radice, stelo o petalo: 450 mg

Foglia o seme: 300 mg

Frutta: 1,2 g

● Animale:

Cuore o Intestino: 450 mg

Visceri o cervello: 240 mg

Muscolo: 600 mg

Ossa, capelli o pelle: 1,5 g

● Artropodi:

Insetti: 9 g

Crostacei: 450 mg

● Sangue intero: 2 tubi

● Celle: 106 cellule

● Siero e plasma:6 ml

Consegna del campione consigliata

Contenitore:
Provetta da centrifuga da 2 ml (la carta stagnola non è consigliata)
Etichettatura del campione: Gruppo+replica, ad esempio A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Spedizione:
1. Ghiaccio secco: i campioni devono essere confezionati in sacchetti e sepolti nel ghiaccio secco.
2.Provette RNAstable: i campioni di RNA possono essere essiccati in provette di stabilizzazione dell'RNA (ad esempio RNAstable®) e spediti a temperatura ambiente.

Flusso di lavoro del servizio

Controllo qualità del campione

Progettazione dell'esperimento

consegna del campione

Consegna del campione

Esperimento pilota

Estrazione dell'RNA

Preparazione della biblioteca

Costruzione della biblioteca

Sequenziamento

Sequenziamento

Analisi dei dati

Analisi dei dati

Servizi post vendita

Servizi post-vendita


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  • Bioinformatica

    wps_doc_14

    Identificazione dei miRNA: struttura e profondità

     

     

     struttura-precursore-miRNA-e-profondità-sequenziamento

     

    Espressione differenziale dei miRNA – clustering gerarchico

    Immagine 34

     

    Annotazione funzionale del target di miRNA espressi in modo differenziale

    Immagine 35

    Esplora i progressi della ricerca facilitati dai servizi di sequenziamento dell'sRNA di BMKGene attraverso una raccolta curata di pubblicazioni.

      

    Chen, H. et al.(2023) "Le infezioni virali inibiscono la biosintesi e la fotosintesi della saponina nel Panax notoginseng", Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038.doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.

    Li, H. et al.(2023) "La proteina FREE1 contenente il dominio FYVE della pianta si associa ai componenti del microprocessore per reprimere la biogenesi dei miRNA", riporta EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.

    Yu, J. et al.(2023) "Il microRNA Ame-Bantam-3p controlla lo sviluppo delle pupe larvali prendendo di mira il gene multiplo simile al fattore di crescita epidermico 8 (megf8) nell'ape mellifera, Apis mellifera", International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726.doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.

    Zhang, M. et al.(2018) "L'analisi integrata di MiRNA e geni associati alla qualità della carne rivela che Gga-MiR-140-5p influisce sulla deposizione di grasso intramuscolare nei polli", Fisiologia cellulare e biochimica, 46(6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.

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