ריצוף מחדש של גנום שלם של חיידקים ופטריות
פרויקטים של ריצוף מחדש של גנום שלם של חיידקים ופטריות הם חיוניים לקידום גנומיקה מיקרוביאלית על ידי מתן אפשרות להשלמת והשוואה של גנומים מיקרוביאליים. זה מקל על הנדסת תסיסה, אופטימיזציה של תהליכים תעשייתיים וחקירת מסלולי חילוף חומרים משניים. יתר על כן, ריצוף מחדש של פטריות וחיידקים הוא חיוני להבנת הסתגלות סביבתית, אופטימיזציה של זנים וחשיפת דינמיקה של אבולוציה גנטית, עם השלכות רחבות ברפואה, בחקלאות ובמדעי הסביבה.
יתרונות השירות
●ניתוח ביואינפורמטי כולל קריאת וריאנטים:מתן תובנות פונקציונליות לגבי הגנום ברצף מחדש.
● מומחיות רבה: עם אלפי פרויקטים של ריצוף מחדש של חיידקים שנערכים מדי שנה, אנו מביאים למעלה מעשור של ניסיון, צוות ניתוח מיומן ביותר, תוכן מקיף ותמיכה מצוינת לאחר המכירה.
●תמיכה לאחר מכירה:המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי לטפל בכל שאלה הקשורה לתוצאות.
מפרט שירות
| פלטפורמת רצף | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| Illumina NovaSeq | PE150 | עומק של פי 100 | Q30≥85% |
דרישות לדוגמא
| ריכוז (ng/µL) | סכום כולל (ng) | נפח (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
חיידקים: ≥1x107 תאים
פטריות חד-תאיות: ≥5x106-1x107 תאים
פטריות מאקרו: ≥4 גרם
זרימת עבודה בשירות
משלוח לדוגמא
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
כולל את הניתוח הבא:
- בקרת איכות נתונים ברצף
- יישור לגנום הייחוס
- קריאת וריאנטים: SNP ו-InDel
- הערת וריאנט
קריאת וריאנטים: סוגי SNP
קריאת וריאנטים: הפצת אורך InDel
חקור את ההתקדמות המאפשרת שירותי ריצוף מחדש של הגנום המיקרוביאלי של BMKGene באמצעות אוסף של פרסומים.
Jia, Y. et al. (2023) 'שילוב של תעתיק ורצף מחדש של הגנום השלם למסך גנים של עמידות למחלות עבור גמד גמד חיטה',כתב העת הבינלאומי למדעים מולקולריים, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'מטבוליזם גלוקוז מבוקר אמפיצילין מפעיל את המעבר מסובלנות לעמידות בחיידקים',התקדמות המדע, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halkaliphila sp. נובמבר, חיידק הלואלקליפילי שבודד מאגם סודה באזור האוטונומי הפנימי של מונגוליה, סין', Int. ג'יי סיסט. Evol.מיקרוביול, 72, עמ'. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. and Wang, G.-H. (2024) 'רצף הגנום של Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, מבודד מ- Nasonia vitripennis',הודעות על משאבי מיקרוביולוגיה. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
