ריצוף מחדש של גנום שלם של חיידקים ופטריות
פרויקטים של ריצוף מחדש של גנומים שלמים של חיידקים ופטריות הם קריטיים לקידום הגנומיקה המיקרוביאלית בכך שהם מאפשרים השלמה והשוואה של גנומים מיקרוביאליים. זה מקל על הנדסת תסיסה, אופטימיזציה של תהליכים תעשייתיים וחקר מסלולי מטבוליזם משניים. יתר על כן, ריצוף מחדש של פטריות וחיידקים הוא קריטי להבנת הסתגלות סביבתית, אופטימיזציה של זנים וחשיפת דינמיקת אבולוציה גנטית, עם השלכות רחבות ברפואה, חקלאות ומדעי הסביבה.
יתרונות השירות
●ניתוח ביואינפורמטי כולל קריאת וריאנטים:מתן תובנות פונקציונליות לגבי הגנומים שעברו ריצוף מחדש.
● מומחיות נרחבתעם אלפי פרויקטים של ריצוף מחדש של מיקרוביאלים המבוצעים מדי שנה, אנו מביאים עימה ניסיון של למעלה מעשור, צוות ניתוח מיומן ביותר, תוכן מקיף ותמיכה מעולה לאחר המכירה.
●תמיכה לאחר המכירה:המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט, עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לענות על כל שאלה הקשורה לתוצאות.
מפרט השירות
| פלטפורמת ריצוף | אסטרטגיית ריצוף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| אילומינה נובה-סיק | PE150 | עומק של פי 100 | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה
| ריכוז (נגנוגרם/µL) | סכום כולל (נגו) | נפח (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
חיידקים: ≥1x107 תאים
פטריות חד-תאיות: ≥5x106-1x107 תאים
פטריות מאקרו: ≥4 גרם
זרימת עבודה של שירות
משלוח לדוגמה
בניית ספרייה
ריצוף
ניתוח נתונים
שירותי לאחר המכירה
כולל את הניתוח הבא:
- בקרת איכות נתוני ריצוף
- יישור לגנום הייחוס
- קריאת וריאנט: SNP ו-InDel
- ביאור וריאנט
קריאת וריאנט: סוגי SNP
קריאה לגרסה: התפלגות אורך InDel
גלו את ההתקדמות שמאפשרות שירותי ריצוף מחדש של גנום מיקרוביאלי של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים שנבחר.
ג'יה, י. ואחרים (2023) 'שילוב ריצוף מחדש של טרנסקריפטומים וגנום שלם לסינון גנים עמידים למחלות עבור צמח חיטה ננסית',כתב עת בינלאומי למדעים מולקולריים, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
ג'יאנג, מ. ואחרים (2023) 'מטבוליזם של גלוקוז הנשלט על ידי אמפיצילין משפיע על המעבר מסבילות לעמידות בחיידקים',התקדמות המדע, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., חיידק הלו-אלקליפילי שבודד מאגם סודה באזור האוטונומי של מונגוליה הפנימית, סין', Int. J. Syst. Evol.מיקרוביול, 72, עמ'. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
ג'ו, ז., וו, ר. וואנג, ג.-ה. (2024) 'רצף גנום של סטפילוקוקוס נפאלנסיס ZZ-2023a, שבודד מ-Nasonia vitripennis',הודעות על משאבים למיקרוביולוגיהdoi: 10.1128/MRA.00802-23.
