BMKMANU S1000 Transcriptome מרחבי
BMKMANU S1000 תכנית תעתיק מרחבית טכנית
היתרונות של BMKMANU S1000
1) רזולוציה תת-תאית: כל אזור לכידה הכיל יותר מ-2 מיליון נקודות ברקוד מרחביות בקוטר של 2.5 מיקרומטר ומרווח של 5 מיקרומטר בין מרכזי הנקודה, מה שמאפשר ניתוח תעתיק מרחבי ברזולוציה תת-תאית (5 מיקרומטר).
2) ניתוח רזולוציה מרובת רמות: ניתוח רב רמות גמיש הנעים בין 100 מיקרומטר ל- 5 מיקרומטר כדי לפתור תכונות רקמה מגוונות ברזולוציה אופטימלית.
3) פרופיל תעתיק מקיף: ניתן לנתח תמלילים שנלכדו משקופית הרקמה כולה, ללא הגבלה על מספר גני המטרה ואזור המטרה.
מפרט שירות
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית רצף | פלט נתונים מומלץ |
| ספריית cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/דגימה |
דרישות לדוגמא
| לִטעוֹם | מספר | גודל | איכות RNA |
| בלוק רקמה מוטבע ב-OCT | 2-3 בלוקים/דוגמא | משוער.6.8x6.8x6.8 מ"מ3 | RIN≥7 |
לפרטים נוספים על הדרכה לדוגמא וזרימת עבודה של שירות, אל תהסס לדבר עם אמומחה BMKGENE
זרימת עבודה בשירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
טרום ניסוי
ברקוד מרחבי
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
הנתונים שנוצרו על ידי BMKMANU S1000 מנותחים באמצעות התוכנה "BSTMatrix", אשר תוכננה באופן עצמאי על ידי BMKGENE, כולל:
1) יצירת מטריצות ביטוי גנים
2) עיבוד תמונה של HE
3) תואם לתוכנת צד שלישי במורד הזרם לניתוח
4) "BSTViewer" מקוון עוזר להשיג תוצאות הדמיה ברזולוציות שונות.
1. מקבץ נקודות
2. התפלגות מרחבית
Nהערה: פתרון הבעיהרמה=13 (100 מיקרומטר, שמאלה); 7 (50 מיקרומטר, ימין)
3. מפת חום מפת חום של שפע ביטוי מרקר
4. ניתוח נתונים בין מדגם
