BMKCloud Log in
条形באנר-03

מוצרים

אילומינה ו-BGI

טכנולוגיית רצף Illumina, המבוססת על Sequencing by Synthesis (SBS), היא חידוש של NGS שאומצו בעולם, האחראית על יצירת למעלה מ-90% מנתוני הרצף בעולם.העיקרון של SBS כולל הדמיה של terminators הפיכים עם תיוג פלואורסצנטי כאשר כל dNTP מתווסף, ולאחר מכן מבוקע כדי לאפשר את השילוב של הבסיס הבא.עם כל ארבעת ה-dNTPs הקשורים ל-terminator הפיך נוכחים בכל מחזור רצף, תחרות טבעית ממזערת את הטיית השילוב.טכנולוגיה רב-תכליתית זו תומכת הן בספריות קריאה בודדת והן בספריות קצה זוגיות, המספקת מגוון יישומים גנומיים.יכולות התפוקה הגבוהה והדיוק של רצף Illumina מציבים אותו כאבן יסוד במחקר הגנומי, ומעצים מדענים לפענח את נבכי הגנום עם פירוט ויעילות ללא תחרות.

DNBSEQ, שפותחה על ידי BGI, היא טכנולוגיית NGS חדשנית נוספת שהצליחה להפחית עוד יותר את עלויות הרצף ולהגדיל את התפוקה.הכנת ספריות DNBSEQ כוללת פיצול DNA, הכנת ssDNA והגברת מעגל מתגלגל להשגת ננו-כדורי ה-DNA (DNB).לאחר מכן הם נטענים על משטח מוצק ולאחר מכן רצף על ידי סינתזה קומבינטורית Probe-Anchor Synthesis (cPAS).

שירות רצף הספרייה המוכן מראש שלנו מקל על הלקוחות להכין את ספריות הרצף שלהם ממקורות מגוונים (mRNA, גנום שלם, אמפליקון, בין היתר).לאחר מכן, ניתן לשלוח ספריות אלו למרכזי הרצף שלנו לבקרת איכות ורצף בפלטפורמות Illumina או BGI.


פרטי שירות

תוצאת הדגמה

מאפיינים

פלטפורמות:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten ו-BGI-DNB-T7

מצבי רצף:PE50, PE100, PE150, PE250

בקרת איכות של ספריות לפני רצף

מסירת נתונים ברצף ו-QC:מסירת דוח QC ונתונים גולמיים בפורמט fastq לאחר דה-מולטיפלקס וסינון קריאות Q30.

 

יתרונות השירות

מגוון שירותי רצף:הלקוח יכול לבחור לרצף לפי נתיב, תא זרימה או כמות נתונים.

מגוון פלטפורמות:ניתן להעביר ספריות DNB לפלטפורמות של Illumina

ניסיון רב בפלטפורמת רצף Illumina:עם אלפי פרויקטים סגורים עם מינים שונים. 

מסירת דוח QC ברצף:עם מדדי איכות, דיוק נתונים וביצועים כלליים של פרויקט הרצף.

תהליך רצף בוגר:עם זמן אחזור קצר.

בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים דרישות QC קפדניות כדי להבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.

דרישות לדוגמה*

רצף נתיב חלקי

כמות נתונים (X)

ריכוז (qPCR/nM)

כרך

X ≤ 50 Gb

≥ 2 ננומטר

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 ננומטר

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 ננומטר

≥ 20 μl

נתיב יחיד (אילומינה)

פּלַטפוֹרמָה

ריכוז (qPCR/nM)

כרך

HiSeq X Ten

≥ 2 ננומטר

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 ננומטר

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1.5 ננומטר

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1.5 ננומטר

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1.5 ננומטר

≥ 25 μl

 בנוסף לריכוז ולכמות הכוללת, נדרשת גם תבנית שיא מתאימה.

 

אנא פנה אלינו אם הדוגמאות שלך אינן עומדות בדרישות חומר המוצא.

זרימת עבודה של שירות

הכנת מדגם

בקרת איכות הספרייה

רצף

רצף

ניתוח נתונים

בקרת איכות נתונים

QC לדוגמה

משלוח פרויקט


  • קודם:
  • הַבָּא:

  • דוח QC של הספרייה

    דוח על איכות הספרייה מסופק לפני ביצוע הרצף, הערכת כמות הספרייה והפיצול.

     

    דוח QC ברצף

     

    טבלה 1. סטטיסטיקה על נתוני רצף.

    מזהה לדוגמא

    BMKID

    קריאות גולמיות

    נתונים גולמיים (bp)

    קריאות נקיות (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    איור 1. התפלגות איכות לאורך קריאות בכל מדגם

    A9

    איור 2. הפצת תוכן בסיסי

    A10

    איור 3. התפלגות תוכן שנקרא בנתוני רצף

    A11

     

    קבל ציטוט

    כתבו כאן את הודעתכם ושלחו אותה אלינו

    שלח את הודעתך אלינו: