ריצוף mRNA/LncRNA/CircRNA אקסוזומלי - Illumina
תכונות
● גלאים מיוחדים משמשים כדי לדלדל את ה-cDNA הריבוזומלי.
● בניית ספרייה ספציפית לגדיל.
● תהליך עבודה אחד לקבלת נתוני mRNA, lncRNA ו-circRNA בו זמנית.
יתרונות השירות
● בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרה מרכזיות בכל השלבים, החל מהכנת הדגימות והספרייה ועד ריצוף וביואינפורמטיקה. ניטור קפדני זה מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
● תמיכה לאחר המכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט, עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לענות על כל שאלה הקשורה לתוצאות.
דרישות לדוגמה ומשלוח
| סִפְרִיָה | פּלַטפוֹרמָה | נתונים מומלצים | בקרת איכות נתונים |
| ספרייה כיוונית מדוללת של rRNA | אילומינה PE150 | 10-16 ג'יגה-בייט | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה
נוקלאוטידים:
| כמות (נגנוגרם) | נפח (μL) |
| 40 | 20 |
רִקמָה:
אקסוזום: 100 מיקרוליטר; 40 מיקרוגרם; >10^9 חלקיקים/מ"ל
סרום/פלזמה: 5 מ"ל
סופרנטאנט של תרבית תאים: 100 מ"ל
שתן: 100 מ"ל
רוק: 15 מ"ל
הפרשות מהאף: 15 מ"ל
נוזל מוחי שדרתי: 15 מ"ל
מי שפיר: 50 מ"ל
זרע: 5 מ"ל
מרה: 5 מ"ל
מיימת: 50 מ"ל
חלב: 15 מ"ל
נוזל זקיקי: 15 מ"ל
נוזל צואה: 50 מ"ל
סופרנטאנט של תרבית מיקרוביאלית: 100 מ"ל
רקמת בעלי חיים: 3 גרם
רקמת צמח: 1 גרם
משלוח דוגמיות מומלץ
מיכל: צינור צנטריפוגה של 2 מ"ל (לא מומלץ להשתמש בנייר אלומיניום)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפול לדוגמה A1, A2, A3; B1, B2, B3.
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז את הדגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
2. מבחנות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA במבחנות ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח אותן בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודה של שירות
תכנון הניסוי
משלוח לדוגמה
מיצוי RNA
בניית ספרייה
ריצוף
ניתוח נתונים
שירותי לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
ניבוי circRNA: התפלגות כרומוזומלית
circRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי - תרשים געשי
circRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי - אשכול היררכי
העשרה פונקציונלית של גנים מארחים של circRNA
ניתוח ביטוי גנים דיפרנציאלי (DEGs)
כימות ביטוי lncRNA - אשכול
העשרת גני מטרה של lncRNA
ניתוח מיקום mRNA ו-lncRNA משותף – גרף Circos (המעגל האמצעי הוא mRNA והמעגל הפנימי הוא lncRNA)
