ניתוח אסוציאציה כלל-גנומי
זרימת עבודה
יתרונות השירות
●מומחיות נרחבת ורקורד פרסומיםעם ניסיון מצטבר ב-GWAS, BMKGene השלימה מאות פרויקטים של מינים במחקר GWAS על אוכלוסיות, סייעה לחוקרים לפרסם יותר מ-100 מאמרים, וגורם ההשפעה המצטבר הגיע ל-500.
● ניתוח ביואינפורמטיקה מקיףזרימת העבודה כוללת ניתוח אסוציאציה של תכונות SNP, אספקת קבוצה של גנים מועמדים והערות פונקציונליות מתאימות להם.
●צוות ביואינפורמטיקה מיומן ביותר ומחזור ניתוח קצרעם ניסיון רב בניתוח גנומי מתקדם, צוות BMKGene מספק ניתוחים מקיפים עם זמן אספקה מהיר.
●תמיכה לאחר המכירה:המחויבות שלנו חורגת מעבר להשלמת הפרויקט, עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לענות על כל שאלה הקשורה לתוצאות.
מפרט ודרישות השירות
| סוג הריצוף | קנה מידה מומלץ של אוכלוסייה | אסטרטגיית ריצוף | דרישות נוקלאוטידים |
| ריצוף גנום שלם | 200 דגימות | פי 10 | ריכוז: ≥ 1 ננוגרם/µL סכום כולל ≥ 30 ננוגרם פירוק או זיהום מוגבלים או ללא פירוק או זיהום כלל |
| מקטע מוגבר של לוקוס ספציפי (SLAF) | עומק תג: פי 10 מספר תגיות: < 400 מגה-בייט: מומלץ להשתמש ב-WGS < 1 ג'יגה-בייט: 100 אלף תגים 1 ג'יגה-בייט > 2 ג'יגה-בייט: 300 אלף תגים מקסימום 500 אלף תגים | ריכוז ≥ 5 ננוגרם/µL כמות כוללת ≥ 80 ננוגרם ננו-טרופ OD260/280=1.6-2.5 ג'ל אגרוז: ללא פירוק או זיהום מוגבלים
|
בחירת חומרים
זנים שונים, תת-מינים, גזעים קרקעיים/בנקי גנים/משפחות מעורבות/משאבי בר
זנים שונים, תת-מינים, גזעים יבשתיים
משפחה של אחים למחצה/אחים מלאים/משאבים בטבע
זרימת עבודה של שירות
תכנון הניסוי
משלוח לדוגמה
מיצוי RNA
בניית ספרייה
ריצוף
ניתוח נתונים
שירותי לאחר המכירה
כולל את הניתוח הבא:
- ניתוח אסוציאציה כלל-גנומי: מודל LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- ביאור פונקציונלי של גנים מועמדים
ניתוח אסוציאציה של תכונות SNP - עלילת מנהטן
ניתוח אסוציאציה של תכונות SNP - עלילת QQ
גלו את ההתקדמות שמאפשרות שירותי de GWAS של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים שנבחרו בקפידה:
Lv, L. et al. (2023) 'תובנה לגבי הבסיס הגנטי של סבילות לאמוניה בצדפת גילוח Sinonovacula constricta על ידי מחקר אסוציאציה כלל-גנומי',חקלאות ימית, 569, עמ' 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
לי, ש. ואחרים (2022) 'ניתוחי מולטי-אומיקס של 398 אקספרסים של דוחן זנב שועל חושפים אזורים גנומיים הקשורים לביות, תכונות מטבוליטים והשפעות אנטי-דלקתיות',צמח מולקולרי, 15(8), עמ' 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
לי, ג'. ואחרים (2022) 'מיפוי אסוציאציות כלל-גנומי של פנוטיפים חסרי עצם בסביבת בצורת',גבולות במדעי הצמח, 13, עמ' 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
ז'או, ש. ואחרים (2021) 'GmST1, המקודד לסולפוטרנספראז, מקנה עמידות לזני נגיף פסיפס סויה G2 ו-G3',צמח, תא וסביבה, 44(8), עמ' 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
