מטבולומיקה
תכונות
●לֹא-מטבולומיקס ממוקד (Discovery Metabolomics)
בהתבסס על טכנולוגיית כרומטוגרפיית נוזלים-ספקטרומטריית מסות (LC-MS), מטבולומיקה לא ממוקדת מאפשרת זיהוי אובייקטיבי של כמה שיותר מטבוליטים של מולקולות קטנות בדגימות ביולוגיות כגון תאים, רקמות, איברים או נוזלי גוף. היא מבצעת ניתוח השוואתי בין קבוצות ניסוי וקבוצת ביקורת, ומסננת מטבוליטים שונים באמצעות ניתוח סטטיסטי.
● מטבולומיקה לא ממוקדת עבור ליפידים
מינוף טכנולוגיית כרומטוגרפיית נוזלים-ספקטרומטריית מסות (LC-MS),nטכנולוגיית מטבולומיקה לליפידים (Metabolomics for Lipids) ממוקדת משיגה זיהוי בלתי מוטה של כמה שיותר מולקולות ליפידים בדגימות ביולוגיות, כולל תאים, רקמות, איברים או נוזלי גוף.
● רחב-מטבולומיקה ממוקדת
שירות זה משלב בצורה מושלמת את היתרונות של רזולוציה גבוהה וכיסוי רחב של טכנולוגיה לא ממוקדת עם הרגישות הגבוהה ויכולות הכימות המדויקות של טכנולוגיית MRM (ניטור תגובות מרובה) ממוקדת. תהליך העבודה הוא כדלקמן: ראשית, ספקטרומטריית מסה ברזולוציה גבוהה משמשת לביצוע סריקת MS² בכיסוי גבוה במיוחד על דגימות כדי לקבל ספקטרום MS² של "כל" המטבוליטים. לאחר מכן, זיהוי מטבוליטים מדויק מתבצע על ידי שילוב עם ספריית MS² ברזולוציה גבוהה (המכסה מעל 25,000 מטבוליטים, עם ספקטרום MS² סטנדרטי מרובים ברזולוציה גבוהה עבור כל מטבוליט). לאחר מכן, מידע על זוג יונים MRM מופק מספקטרום המסה כדי ליצור ספרייה ספציפית לדגימות. לבסוף, ספקטרומטריית מסה משולשת קוואדרופול עם טכנולוגיית MRM מיושמת לכימות מדויק.
● מטבולומיקה ממוקדת
מטבולומיקה ממוקדת מתמקדת במספר תרכובות מטרה או במטבוליטים חלקיים/כוללים המעורבים במסלול ספציפי. באמצעות חומרים סטנדרטיים, היא קובעת שיטת גילוי בעלת ספציפיות חזקה, רגישות גבוהה וחזרה טובה לכימות וניתוח של תרכובות מטרה. היא מאמצת תקן חיצוני בשילוב עם תקן פנימי לכימות מוחלט, כאשר הלינאריות של עקומת הסטנדרט מגיעה ליותר מ-0.99 והרגישות עד לרמת ng/mL.
יתרונות
●פלטפורמת גילוי מתקדמת
-מצויד בספקטרומטרים של מסות ברזולוציה גבוהה מהשורה הראשונה ובספקטרומטרים של מסות משולשות קוואדרופליות, המאפשרים גילוי וניתוח בו זמנית של אלפי מטבוליטים.
●מאגרי מידע מקיפים
- מאגרי מידע ציבוריים: מכסים את METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas ו-Lipidmaps, הכוללים מעל 500,000 מטבוליטים.
- בתוך החברהמאגר נתונים ספציפי לצמח: מכיל מעל 25,000 מטבוליטים, כולל מטבוליטים ראשוניים ומשניים.
- בתוך החברהמאגר נתונים ספציפי לבעלי חיים/רפואיים: כולל מעל 12,000 מטבוליטים.
●מערכת בקרת איכות קפדנית
-בקרת איכות קפדנית הכוללת יציבות המכשיר, שאריות חומר, בקרת איכות PCA של דגימות וניתוח קורלציה כדי להבטיח איכות נתונים אמינה.
●קיבולת גילוי מטבוליטים גבוהה
- לֹא-מטבולומיקה ממוקדת: מזהה בממוצע מעל 4,200 מטבוליטים בכל ריצה, אידיאלי לחקר מטבוליטים לא ידועים בדגימות ולזיהוי מטבוליטים בדגימות מורכבות.
- רחב-מטבולומיקה ממוקדת (צמח): מזהה בממוצע מעל 2,410 מטבוליטים בכל ריצה, כולל מטבוליטים ראשוניים ומשניים.
- רחב-מטבולומיקה ממוקדת (בעלי חיים): מזהה בממוצע מעל 1,250 מטבוליטים בכל ריצה.
- מטבולומיקה ממוקדת: פאנליםעֲבוּרקטגוריות מטבוליטים מרובות.
●ניתוח מקיף
-מציע יותר מ-10 פריטי ניתוח ומעל 20 תרשימי ויזואליזציה.
●שירות לאחר המכירה מתחשב
-מספק ייעוץ לאחר המכירה ותמיכה בפירוש הדוחות הסופיים.
מפרט השירות
| פִּתָרוֹן | פּלַטפוֹרמָה | שכפולים ביולוגיים מומלצים |
|---|---|---|
| מטבולומיקה לא ממוקדת | UHPLC-TOF-MS (ווטרס Xevo G2-XS QTof) | דגימה צמחית ומיקרוביאלית: ≥ 6 דגימת בעלי חיים: ≥ 10 מדגם קליני: ≥ 30 כל דגימות הביולוגיות המשוכפלות נותחו באופן עצמאי. |
| מטבולומיקה רחבת היקף | מים Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | דגימת צמח: ≥ 3 |
| מטבולומיקה ממוקדת | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (אג'ילנט 7890-5977, אג'ילנט 7820-5977) | דגימת צמח: ≥ 3 דגימת בעל חיים: ≥ 6 |
דרישות לדוגמה
האם אתם תוהים האם הדוגמאות שלכם עומדות בקריטריונים שלנו? לחצו כאן כדי לקבל אתדרישות הדוגמה העדכניות ביותר.
זרימת עבודה של שירות
אוסף דגימות
מיצוי מטבוליטים
איסוף נתונים
ניתוח נתונים
אספקת נתונים
1. רעשי רקע ועיבוד נתונים גולמי באיכות נמוכה
2. הערכת איכות הנתונים
2.1 ניתוח רכיבים עיקריים
2.2 הערכת שחזור
3. ביאור מטבוליטים
3.1 ביאור מסד נתונים של KEGG
3.2 ביאור מסד נתונים HMDB
3.3 ביאור מסד הנתונים Lipidmaps
4. ניתוח נתוני קיבוץ דגימות (שכפולים ביולוגיים)≥3)
4.1 ניתוח רכיבים עיקריים של הקבוצה
4.2 ניתוח דיסקרימיננטי חלקי אורתוגונלי של ריבועים פחותים (OPLS-DA)
4.3 ניתוח מטבוליטים דיפרנציאלי קבוצתי
5. בחירת מטבוליטים דיפרנציאלית (שכפולים ביולוגיים)≥3)
5.1 ניתוח שינוי קיפול דיפרנציאלי
5.2 תרשים הר געש מטבוליטים דיפרנציאלי
5.3 מפת חום של אשכול מטבוליטים דיפרנציאלי
5.4 גרף קורלציה של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.5 גרף ציון Z של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.6 ניתוח עלילת מכ"ם של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.7 תרשים כינור של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.8 תרשים קופסה של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.9 ניתוח אנוטציה וניתוח העשרה פונקציונליים של KEGG של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.10 ניתוח עקומת ROC
5.11 אשכולות k-means של מטבוליטים דיפרנציאליים
5.12 דיאגרמת ון של מטבוליט דיפרנציאלי
1. הערכת איכות הנתונים
↑Cניתוח קורלציה(דגימת בדיקה/דגימת בקרת איכות)
↑ניתוח רכיבים עיקריים ↑ניתוח אשכול מטבוליטים
2. ביאור מטבוליטים
↑ביאור מסד נתונים של KEGG↑ביאור מסד נתונים HMDB
↑ביאור מסד הנתונים Lipidmaps
3. ניתוח נתוני קיבוץ דגימות (שכפולים ביולוגיים)≥3)
↑ניתוח רכיבים עיקריים של הקבוצה(דו-ממדי/תלת-ממדי)
↑ניתוח דיסקרימיננטי של ריבועים פחותים חלקיים אורתוגונליים (OPLS-DA)
4. בחירת מטבוליטים דיפרנציאלית (שכפולים ביולוגיים)≥3)
↑ניתוח שינוי קיפול דיפרנציאלי↑גרף של הר געש מטבוליטים דיפרנציאלי
↑מפת חום של אשכול מטבוליטים דיפרנציאלי↑עלילה של קורלציה של מטבוליטים דיפרנציאליים
↑גרף ציון Z של מטבוליטים דיפרנציאליים↑ניתוח עלילת מכ"ם מטבוליטים דיפרנציאלי
↑עלילה של כינור מטבוליטים דיפרנציאלי↑תרשים קופסה של מטבוליטים דיפרנציאליים
↑ ביאור פונקציונלי והעשרה של מטבוליט דיפרנציאלי של KEGG
↑ניתוח עקומת ROC↑התקבצות k-means של מטבוליטים דיפרנציאליים
↑ דיאגרמת מטבוליט דיפרנציאלי Venn
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. גורם שעתוק הומיאודומיין דמוי BEL1 SAWTOOTH1 (MdSAW1) ב-Malus domestica משפר את הסבילות של תפוח טרנסגני וארבידופסיס לעודף עקה של אבץ. Int J Biol Macromol. מאי 2025;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 10 במרץ 2025. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. השפעה אינטראקטיבית של חלקיקים ירוקים ננומטריים ופטריות מיקוריזאליות ארבוסקולריות בתיווך מורינגה אוליפרה על צמיחה, ארכיטקטורת מערכת השורשים וספיגת חומרים מזינים בתירס (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. ספטמבר 2025;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 24 במאי 2025. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. ג'סמונט מפעיל מודול דמוי SlJAZ2/3-SlMYC3 המווסת את צריכת K+ בתגובת עגבניות לעקה נמוכה של K+. J Integr Plant Biol. אוגוסט 2025;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 28 במאי 2025. PMID: 40432500.
