רצף Metatranscriptome
תכונות שירות
● דלדול rRNA ואחריו הכנת ספריית mRNA כיוונית.
● רצף על Illumina NovaSeq.
יתרונות השירות
●למד את השינויים של קהילות מיקרוביאליות מורכבות:זה קורה ברמת התעתיק ולחקור גנים חדשים פוטנציאליים.
●הסבר על אינטראקציות קהילתיות מיקרוביאלית עם המארח או הסביבה.
●ניתוח ביואינפורמטי מקיף: זה מספק תובנות על קומפוזיציות טקסונומיות ופונקציונליות בקהילה, כמו גם ניתוח ביטוי גנים דיפרנציאלי.
●ביאור גנים נרחב:שימוש במאגרי מידע עדכניים של תפקודי גנים למידע אינפורמטיבי על ביטוי גנים של קהילות מיקרוביאליות.
●תמיכה לאחר מכירה:המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי לטפל בכל שאלה הקשורה לתוצאות.
מפרט שירות
| פלטפורמת רצף | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות נתונים |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
דרישות לדוגמא
| ריכוז (ng/µL) | כמות כוללת (מיקרוגרם) | נפח (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
זרימת עבודה בשירות
משלוח לדוגמא
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
כולל את הניתוח הבא:
● בקרת איכות נתונים ברצף
● הרכבת תמלול
● ביאור טקסונומי ושפע
● ביאור פונקציונלי ושפע
● כימות ביטוי וניתוח דיפרנציאלי
התפלגות טקסונומית של כל מדגם:
ניתוח גיוון בטא: UPGMA
ביאור פונקציונלי - GO שפע
שפע טקסונומיה דיפרנציאלית – LEFSE
חקור את ההתקדמות שמאפשרת שירותי רצף המטא-תעתיקים של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים מאוצר.
לו, ז' ועוד. (2023) "סבילות לחומצה של חיידקים המנצלים לקטט מהסדר Bacteroidales תורמת למניעת חמצת גירה בעיזים המותאמות לתזונה עתירת ריכוז",תזונה לבעלי חיים, 14, עמ' 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
שיר, ז' ואח'. (2017) 'פתירת מיקרוביוטה תפקודית הליבה בתסיסה מסורתית במצב מוצק על ידי אמפליקונים בתפוקה גבוהה ורצף metatranscriptomics',גבולות במיקרוביולוגיה, 8 (ביולי). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mycoviruses חדש שהתגלו מסקר Metatranscriptomics של פטריית Alternaria Phytopathogenic',וירוסים, 14(11), עמ'. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) "ניתוח מקביל של מטטרנסקריפטום מגלה השפלה של מטבוליטים משניים של צמחים על ידי חיפושיות וסימביונטות המעיים שלהן",מולקולרית אֵקוֹלוֹגִיָה, 31(15), עמ' 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
