mRNA-seq ‏(NGS) – דה נובו

ריצוף mRNA מאפשר יצירת פרופיל של כל תעתיקי ה-mRNA בתאים בתנאים ספציפיים ומהווה טכנולוגיה נפוצה בתחומי מחקר שונים. צינור ה-BMKCloud De novo mRNA-seq נועד לנתח ספריות ריצוף מועשרות ב-poly-A כאשר אין גנום ייחוס זמין. הצינור מתחיל בבקרת איכות, ולאחר מכן...דה נובוהרכבת תמליל ובחירת קבוצת יוניגנים. ניתוח מבנה יוניגנים מנבא רצף קידוד (CDS) וחזרות רצף פשוטות (SSR). לאחר מכן, ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מוצא גנים בעלי ביטוי דיפרנציאלי (DEGs) בקרב התנאים שנבדקו, ולאחר מכן מתבצעת ביאור פונקציונלי והעשרה של DEGs כדי להפיק תובנות ביולוגיות.