מוצרים

מטא-גנום הוא אוסף של חומר גנטי של קהילה מעורבת של אורגניזמים, כגון מטא-גנומים סביבתיים ובני אדם. הוא מכיל גנומים של מיקרואורגניזמים הניתנים לגידול וגם של מיקרואורגניזמים שאינם ניתנים לגידול. ריצוף מטא-גנומי מאפשר מחקר של נופים גנומיים מורכבים אלה המוטמעים בדגימות אקולוגיות על ידי מתן יותר מאשר פרופיל טקסונומי. הוא גם מציע פרספקטיבה גנומית פונקציונלית על ידי חקר הגנים המקודדים ותפקידיהם המשוערים בתהליכים סביבתיים. בעוד שגישות מסורתיות של "shotgun shotgun" עם ריצוף Illumina נמצאות בשימוש נרחב במחקרי מטא-גנום, הופעתם של ריצוף ארוך-קריאה Nanopore ו-PacBio שינתה את התחום. טכנולוגיית Nanopore ו-PacBio משפרת ניתוחים ביואינפורמטיים במורד הזרם, ובמיוחד הרכבת מטא-גנומים, ומבטיחה הרכבות רציפות יותר. דיווחים מצביעים על כך שמטא-גנומיקה מבוססת Nanopore ו-PacBio יצרה בהצלחה גנומים חיידקיים שלמים וסגורים ממיקרוביום מורכב (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). שילוב קריאות Nanopore עם קריאות Illumina מספק גישה אסטרטגית לתיקון שגיאות, ומפחיתה את הדיוק הנמוך הטמון ב-Nanopore. שילוב סינרגטי זה ממנף את נקודות החוזק של כל פלטפורמת ריצוף, ומציע פתרון חזק להתגברות על מגבלות פוטנציאליות ולקידום הדיוק והאמינות של ניתוחים מטאגנומיים.

פלטפורמה: Nanopore PromethION 48, Illumia ו-PacBio Revio