טרנסקריפטום באורך מלא של ננופור

ריצוף טרנסקריפטומים של Nanopore הוא שיטה רבת עוצמה לריצוף cDNA באורך מלא, זיהוי וכימות מדויקים של איזופורמים של טרנסקריפט. צינור הטרנסקריפטומים של BMKCloud Nanopore באורך מלא נועד לנתח נתוני RNA-Seq שנוצרו בפלטפורמת Nanopore כנגד גנום ייחוס איכותי ומבואר היטב, ומספק ניתוח איכותני וכמותי הן ברמת הגן והן ברמת התעתיק. לאחר בקרת האיכות, מתקבלים רצפים לא כימריים באורך מלא (FLNC) ורצפי קונצנזוס ממופים לגנום הייחוס כדי להסיר טרנסקריפטים מיותרים. מקבוצת התעתיקים הזו, הביטוי מכומת וגנים ותעתיקים המבוטאים באופן דיפרנציאלי מזוהים ומבוארים פונקציונלית. הצינור כולל גם ניתוח פוליאדנילציה חלופית (APA), ניתוח שחבור חלופי, ניתוח חזרה על רצף פשוט (SSR), ניבוי lncRNA ומטרות תואמות, ניבוי רצפי קידוד (CDS), ניתוח משפחות גנים, ניתוח גורמי שעתוק, ניבוי גנים חדשים וביאור פונקציונלי של טרנסקריפטים.