● פרוטאומיקה איכותנית: משתמשת ב-LC-MS/MS לזיהוי הרכב חלבונים בדגימות מורכבות (רצועות ג'ל SDS-PAGE, IP, Co-IP, Pull-down). יתרונות: אין הגבלת מספר דגימות, זיהוי מהיר, עיבוד דגימות פשוט, תפוקה גבוהה ויכולת לזהות חלבונים בשפע נמוך.
● פרוטאומיקה כמותית ללא סימון: טכנולוגיה ללא סימון עם זיהוי דגימות בודדות. מכמתת חלבונים על ידי השוואת עוצמות אות פפטידיות בנתוני ספקטרומטריית מסות. יתרונות: פעולה פשוטה, תפוקה גבוהה (ללא הגבלת מספר דגימות) ויישומה רחב (מתאים להשוואה דיפרנציאלית של חלבונים "נוכחות/היעדרות" בין מינים).
● פרוטאומיקה כמותית DIA: מאמץ מצב רכישה בלתי תלויה בנתונים (DIA), סורק את כל היונים בחלונות מפולחים כדי ללכוד מידע מלא על יונים. יתרונות: חזרתיות טובה יותר, כיסוי חלבון גבוה יותר וכימות מדויק יותר ממצב DDA (TMT/ללא תווית), אידיאלי למחקרים במדגמים גדולים.
● פרוטאומיקה כמותית ללא תווית 4D/פרוטאומיקה כמותית 4D-DIA: מבוסס על ספקטרומטר מסות Bruker timsTOF, מוסיף ניידות יונים (חתך רוחב התנגשות) להפרדה תלת-ממדית מסורתית. יתרונות: ניצול ודיוק משופרים של יונים, שיפור מקיף בעומק הכיסוי, הרגישות והתפוקה; עומק זיהוי גבוה יותר משיטת התלת-ממד המסורתית.
● פרוטאומיקה כמותית ללא תווית של Astral/פרוטאומיקה כמותית DIA של Astral: מבוסס על ספקטרומטר מסות ברזולוציה גבוהה של Orbitrap™ Astral™. יתרונות: תפוקה גבוהה יותר (100+ דגימות/יום עם גרדיאנט של 8 דקות), כיסוי עמוק יותר (8,000+ חלבונים זוהו בתאי Hela תוך 8 דקות), ורגישות גבוהה יותר (נדרש פחות דגימה).
● פרוטאומיקה כמותית TMT: משתמש ב-18 תגי איזוטופ לסימון פפטידים לגילוי סימולטני של 18 דגימות. יתרונות: יציבות גבוהה (הפרעה מינימלית ליציבות המכשיר, שגיאת מערכת קטנה) ורגישות גבוהה (פרקציונציה מפחיתה את מורכבות הדגימה, משפרת את גילוי החלבון בשפע נמוך).
● פרוטאומיקה ממוקדת PRM: טכנולוגיה ממוקדת ברזולוציה גבוהה לגילוי סלקטיבי של חלבוני/פפטידים מטרה. יתרונות: מאפשר כימות יחסי/מוחלט ואימות של תוצאות פרוטאומיקה כמותיות; ללא הגבלת נוגדנים, תחולה רחבה יותר מאשר Western Blot ו-ELISA.
● ציוד מתקדם: מצויד הן בפלטפורמות פרוטאומיקה קונבנציונליות והן בספקטרומטרים מתקדמים לעומק גבוה (למשל, 4D, Astral).
● גילוי יציב: מערכות בקרת איכות קפדניות מבטיחות תהליכי בדיקה עקביים ויציבים.
● תוצאות אמינות: ניתוח איכותני וכמותי בו זמנית מספק ביטוי יחסי, משקל מולקולרי, שפע ונתונים מרכזיים אחרים עבור כל קבוצה.
● אוטומציה גבוהה: מערכות LC-MS אוטומטיות מאפשרות ניתוח מהיר וביצועי הפרדה מצוינים.
| השוואה בין טכניקות פרוטאומיקה לא ממוקדות | ||||
| ללא תוויות | דיא | TMT | ||
| תִיוּג | NO | NO | כֵּן | |
| מצב סריקת נתונים | די.איי.די. | די.איי.די. | דיא | די.איי.די. |
| שחזור | לְהוֹרִיד | גָבוֹהַ | גָבוֹהַ | |
| רְגִישׁוּת | לְהוֹרִיד | גָבוֹהַ | גָבוֹהַ | |
| רִבּוּב | NO | כֵּן | NO | כֵּן |
| בַּקָשָׁה | השוואה בין נוכחות/היעדר חלבון | דגימות בקנה מידה גדול | ניתוח של קבוצות דגימות שונות | השוואה בין ביטוי חלבונים דיפרנציאלי באותו מין ורקמה |
| דִיוּק | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| ספירת גילוי | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
האם אתם תוהים האם הדוגמאות שלכם עומדות בקריטריונים שלנו? לחצו כאן כדי לקבל אתדרישות הדוגמה העדכניות ביותר.
פרוטאומיקה איכותנית
1. תמיסת חלבון/ג'ל: טבלת תוצאות איכותיות
2. תוצאות חיפוש במסד הנתונים
2.1 רשימת מקטעי פפטידים שנמצאו בחיפוש במסד הנתונים
2.2 רשימת חלבונים שנמצאו בחיפוש במסד הנתונים
2.3 רשימת שינויים שנמצאו בחיפוש במסד הנתונים (זרחון, יוביקוויטינציה וכו')
3. נתונים גולמיים
פרוטאומיקה כמותית(ללא תווית/DIA/TMT)
1. עיבוד נתונים מקדים
1.1 חיפוש במסד נתונים של חלבונים
2. ניתוח ביטוי חלבונים
2.1 ניתוח רכיבים עיקריים (PCA)
2.2 סטיית תקן יחסית (RSD)
2.3 K-means התפלגות מגמה
2.4 הערכת שחזור
2.5 מפת חום של ביטוי חלבונים
3. ביאור פונקציונלי
3.1 ביאור פונקציונלי של GO
3.2 ביאור פונקציונלי של KEGG
3.3 ביאור פונקציונלי של COG
3.4 ביאור פונקציונלי של GOslim
3.5 ביאור תחום מבנה חלבון Pfam
4. אנליזה דיפרנציאלית של חלבונים (חזרות ביולוגיות ≥ 3)
4.1 תוצאות ניתוח דיפרנציאלי של חלבונים
4.2 התפלגות שינויים דיפרנציאליים בקיפול חלבונים (FC)
4.3 ניתוח סטטיסטי של כמות חלבון דיפרנציאלית
4.4 גרף הר געש של חלבון דיפרנציאלי
4.5 מפת חום של אשכול חלבונים דיפרנציאלי
4.6 ביאור פונקציונלי וניתוח העשרה של חלבון GO דיפרנציאלי
4.7 ניתוח ביאור פונקציונלי והעשרה של חלבון KEGG דיפרנציאלי
4.8 ביאור פונקציונלי של COG של חלבון דיפרנציאלי
4.9 ניתוח ביאור והעשרה של GOslim של חלבון דיפרנציאלי
4.10 ביאור וניתוח העשרה של מבנה חלבון דיפרנציאלי
5. ניתוח אינטראקציה של רשת חלבונים
6. ביאור מסלול ריאקום חלבון
7. חיזוי פפטיד איתות
8. לוקליזציה תת-תאית של חלבונים
פרוטאומיקה כמותית(PRM)
1. תוצאות כימות חלבון PRM
1.1 סקירה כללית של תוצאות הכימות
1.2 התפלגות שטחי שיא יוני הפרגמנט עבור מקטעי פפטיד
פרוטאומיקה כמותית
1.ניתוח ביטוי חלבונים
↑ניתוח רכיבים עיקריים (PCA)↑סטיית תקן יחסית (RSD)

↑K- פירושו התפלגות מגמה ↑קורלציהAניתוח שלPרוטיןEביטויLרמות
2. ביאור פונקציונלי


↑GO ביאור פונקציונלי↑ביאור פונקציונלי של KEGG
↑ ביאור פונקציונלי של COG ↑ ביאור פונקציונלי של GOslim
3.ניתוח אינטראקציה של רשת חלבונים
↑ ניתוח אינטראקציה של רשת חלבונים
4.חיזוי פפטיד אותות
↑ חיזוי פפטיד איתות
5. לוקליזציה תת-תאית של חלבונים
↑לוקליזציה תת-תאית של חלבונים
| 2025 | שלפוחיות אפופטוטיות שמקורן בתאי גזע מזנכימליים משפרות תגובות רגישות יתר באמצעות גרימת אפופטוזיס של תאי T מסוג CD8+ עם עומס יתר של סידן ותפקוד לקוי של מיטוכונדריה | מדע מתקדם |
| 2024 | מולטיאומיקס משולב מדגים יעילות משופרת נגד גידולים של | אונקולוגיה טרנסלציונית |
| 2024 | ניתוח מולטי-אומיקס חושף את המאפיינים הייחודיים של מסלולי מטבוליזם התומכים ב- גודל פרי וצבע שונים של דלעת ענקית | מדע בינלאומי ביולוגי מולקולרי. |
| 2024 | פרופילציה של טרנסקריפטומים ומטבולומים מספקת תובנות חדשות לגבי ניוון שרירים לאחר חוסר שימוש בעוף: התפקיד הפוטנציאלי של סיבי שריר בעלי עוויתות מהירות | מדע בינלאומי ביולוגי מולקולרי. |
| 2023 | ניתוח מולטי-אומיקס מגלה את השפעת הטטרציקלין על צמיחת שורש עשב השיפון. | כתב העת לחומרים מסוכנים |