ריצוף RNA קטן - Illumina
תכונות
● הכנת ספריית בחירת גודל.
● ניתוח ביואינפורמטי המתמקד בניבוי ומטרות של miRNA.
יתרונות השירות
●מומחיות נרחבתעיבדנו למעלה מ-300 דגימות, המכסות סוגי דגימות מגוונים. אנו מביאים את עושר המומחיות שלנו לכל פרויקט.
●בקרת איכות קפדניתאנו מיישמים נקודות בקרה מרכזיות בכל השלבים, החל מהכנת דגימות ועד להכנת ספרייה, ריצוף וביואינפורמטיקה. הניטור הקפדני שלנו מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
●ניתוח ביואינפורמטיקה מקיף:זה מאפשר זיהוי של miRNAs ידועים וחדשים כאחד, זיהוי מטרות של miRNAs, וביאור פונקציונלי תואם והעשרה עם מסדי נתונים מרובים (KEGG, GO).
●תמיכה לאחר המכירהאנו מבינים עד כמה חשוב להיות נוכחים, ולכן המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט, עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לענות על כל שאלה הקשורה לתוצאות.
דרישות לדוגמה ומשלוח
| סִפְרִיָה | פּלַטפוֹרמָה | נתונים מומלצים | בקרת איכות נתונים |
| גודל שנבחר | אילומינה SE50 | 10 מיליון-20 מיליון קריאות | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה:
נוקלאוטידים:
| ריכוז (ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 זיהום חלבון או DNA מוגבל או ללא זיהום כלל על גבי הג'ל. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא גובה בסיס |
● צמחים:
שורש, גבעול או עלה כותרת: 450 מ"ג
עלה או זרע: 300 מ"ג
פרי: 1.2 גרם
● בעל חיים:
לב או מעיים: 450 מ"ג
קרביים או מוח: 240 מ"ג
שריר: 600 מ"ג
עצמות, שיער או עור: 1.5 גרם
● פרוקי רגליים:
חרקים: 9 גרם
סרטנאים: 450 מ"ג
● דם מלא2 צינורות
● תאים: 106 תאים
● סרום ופלזמה:6 מ"ל
משלוח דוגמיות מומלץ
מיכל: צינור צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ להשתמש בנייר אלומיניום)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפול לדוגמה A1, A2, A3; B1, B2, B3.
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז את הדגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
2. מבחנות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA במבחנות ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח אותן בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודה של שירות
תכנון הניסוי
משלוח לדוגמה
מיצוי RNA
בניית ספרייה
ריצוף
ניתוח נתונים
שירותי לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
● בקרת איכות נתונים גולמיים
● סיווג RNA קטן
● ביטוי miRNA וניתוח ביטוי דיפרנציאלי
● גן מטרה של miRNA וביאור של גן מטרה של miRNA המתבטא באופן דיפרנציאלי
● אנוטציה של גן מטרה והעשרה של תפקוד גן miRNA המתבטא באופן דיפרנציאלי
זיהוי miRNA: מבנה ועומק
ביטוי דיפרנציאלי של miRNA - אשכול היררכי
ביאור פונקציונלי של מטרה של miRNAs מבוטאים באופן דיפרנציאלי
גלו את התקדמויות המחקריות שמאפשרות שירותי ריצוף sRNA של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים שנבחרו בקפידה.
צ'ן, ה. ואחרים (2023) 'זיהומים ויראליים מעכבים ביוסינתזה ופוטוסינתזה של ספונינים ב-Panax notoginseng',פיזיולוגיה וביוכימיה של הצמח, 203, עמ' 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
לי, ה. ואחרים (2023) 'החלבון FREE1 המכיל את תחום FYVE של הצמח מתקשר עם רכיבי מיקרו-מעבד כדי לדכא ביוגנזה של miRNA',דוחות EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
יו, ג'. ואחרים (2023) 'ה-MicroRNA Ame-Bantam-3p שולט בהתפתחות גלמי הזחל על ידי מיקוד בגן 8 (megf8) דמוי גורמי גדילה אפידרמליים מרובים בדבורת הדבש, Apis mellifera',כתב העת הבינלאומי למדעים מולקולריים, 24(6), עמ' 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
ג'אנג, מ. ואחרים (2018) 'ניתוח משולב של מירנה וגנים הקשורים לאיכות בשר מגלה כי Gga-MiR-140-5p משפיע על שקיעת שומן תוך שרירית בתרנגולות',פיזיולוגיה וביוכימיה תאית, 46(6), עמ' 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
