BMKCloud Log in
条形באנר-03

מוצרים

רצף קטעים מוגבר של לוקוס ספציפי (SLAF-Seq)

גנוטיפ בתפוקה גבוהה, במיוחד באוכלוסיה בקנה מידה גדול, הוא שלב בסיסי במחקרי אסוציאציות גנטי, המספקים בסיס גנטי לגילוי גנים פונקציונליים, ניתוח אבולוציוני וכו'. במקום ריצוף מחדש של גנום שלם עמוק, רצף גנום ייצוג מופחת (RRGS) ) מוצג כדי למזער את עלות הרצף לדגימה, תוך שמירה על יעילות סבירה בגילוי סמן גנטי.זה מושג בדרך כלל על ידי חילוץ קטע הגבלה בטווח גודל נתון, אשר נקרא ספריית ייצוג מופחתת (RRL).רצף מקטעים מוגבר במיקום ספציפי (SLAF-Seq) הוא אסטרטגיה שפותחה בעצמה עבור גנוטיפ SNP עם או בלי גנום ייחוס.
פלטפורמה: פלטפורמת Illumina NovaSeq


פרטי שירות

תוצאות הדגמה

פרסומים מומלצים

פרטי שירות

תכנית טכנית

111

זרימת עבודה

流程图

יתרונות השירות

יעילות גבוהה לגילוי סמנים- טכנולוגיית רצף תפוקה גבוהה מסייעת ל-SLAF-Seq בגילוי מאות אלפי תגים בתוך הגנום כולו.

תלות נמוכה בגנום- ניתן ליישם אותו על מינים עם או בלי גנום ייחוס.

עיצוב סכימה גמישה- אנזים בודד, כפול, עיכול רב-אנזים וסוגים שונים של אנזימים, כולם ניתנים לבחירה כדי לתת מענה למטרות מחקר או מינים שונים.הערכה מוקדמת בסיליקו משמשת כדי להבטיח עיצוב אנזים אופטימלי.

עיכול אנזימטי יעיל- ניסוי מקדים בוצע כדי לייעל את התנאים, מה שהופך את הניסוי הפורמלי ליציב ואמין.יעילות איסוף השברים יכולה להגיע למעל 95%.

תגי SLAF מפוזרים באופן שווה- תגי SLAF מפוזרים באופן שווה בכל הכרומוזומים במידה הרבה ביותר, ומשיגים ממוצע של 1 SLAF לכל 4 kb.

הימנעות יעילה מחזרות- רצף חוזר בנתוני SLAF-Seq מופחת לנמוך מ-5%, במיוחד במינים עם רמה גבוהה של חזרות, כגון חיטה, תירס וכו'.

ניסיון רב-מעל 2000 פרויקטים של SLAF-Seq סגורים על מאות מינים המכסים צמחים, יונקים, ציפורים, חרקים, אורגניזמים מים וכו'.

זרימת עבודה ביואינפורמטיבית בפיתוח עצמי- זרימת עבודה ביואינפורמטית משולבת עבור SLAF-Seq פותחה על ידי BMKGENE כדי להבטיח אמינות ודיוק של הפלט הסופי.

 

מפרט שירות

 

פּלַטפוֹרמָה

Conc.(ng/gl)

סה"כ (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(כרך>15μl)

1.6-2.5

הערה: שלוש דגימות, כל אחת עם שלוש ערכות אנזימים, יבוצעו לצורך ניסוי מקדים.

אסטרטגיית רצף מומלצת

עומק רצף: 10X/תג

גודל הגנום

תגיות SLAF מומלצות

< 500 מגה-ביט

100K או WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 Gb -2 Gb

200 K

גנומים ענקיים או מורכבים

300 - 400K

 

יישומים

 

מוּמלָץ

סולם אוכלוסייה

 

אסטרטגיית רצף ועומק

 

עוֹמֶק

 

מספר תג

 

GWAS

 

מספר דוגמה ≥ 200

 

פי 10

 

 

 

 

 

לפי

גודל הגנום

 

אבולוציה גנטית

 

בודדים מכל אחד

תת-קבוצה ≥ 10;

סה"כ דגימות ≥ 30

 

פי 10

 

משלוח לדוגמא מומלץ

מיכל: שפופרת צנטריפוגה 2 מ"ל

עבור רוב הדגימות, אנו ממליצים לא לשמר באתנול.

תיוג לדוגמה: דגימות צריכות להיות מסומנות בבירור וזהות לטופס המידע המוגש לדוגמא.

משלוח: קרח יבש: יש לארוז תחילה את הדגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.

זרימת עבודה של שירות

QC לדוגמה
ניסוי טייס
ניסוי SLAF
הכנת ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר מכירה

QC לדוגמה

ניסוי טייס

ניסוי SLAF

הכנת ספרייה

רצף

ניתוח נתונים

שירותים לאחר המכירה


  • קודם:
  • הַבָּא:

  • 1. סטטיסטיקה של תוצאת המפה

    תמונה 1

    A1

    2. פיתוח סמן SLAF

    A2

    3. ביאור וריאציה

    A3

    שָׁנָה

    כתב עת

    IF

    כותרת

    יישומים

    2022

    תקשורת בטבע

    17.694

    בסיס גנומי של הג'יגה-כרומוזומים והג'יגה-גנום של אדמונית העץ

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    פיטולוג חדש

    7.433

    טביעות הרגל של ביות מעגנות אזורים גנומיים בעלי חשיבות אגרונומית ב

    פולי סויה

    SLAF-GWAS

    2022

    כתב עת למחקר מתקדם

    12.822

    כניסות מלאכותיות של Gossypium barbadense לרחבי הגנום לתוך G. hirsutum

    לחשוף לוקוסים מעולים לשיפור בו-זמנית של איכות ותפוקת סיבי הכותנה

    תכונות

    SLAF-גנטיקה אבולוציונית

    2019

    צמח מולקולרי

    10.81

    ניתוח גנומי של אוכלוסיות ואסיפת דה נובו חושפים את מקורו של ווידי

    אורז כמשחק אבולוציוני

    SLAF-גנטיקה אבולוציונית

    2019

    גנטיקה של הטבע

    31.616

    רצף הגנום והמגוון הגנטי של הקרפיון המצוי, Cyprinus carpio

    מפת SLAF-Linkage

    2014

    גנטיקה של הטבע

    25.455

    הגנום של בוטנים תרבותיים מספק תובנה לגבי קריוטיפים של קטניות, פוליפלואידים

    אבולוציה וביות יבולים.

    מפת SLAF-Linkage

    2022

    יומן ביוטכנולוגיה צמחית

    9.803

    זיהוי של ST1 חושף מבחר הכרוך בטרמפים של מורפולוגיה של זרעים

    ותכולת שמן במהלך ביות פולי סויה

    פיתוח SLAF-Marker

    2022

    כתב העת הבינלאומי למדעים מולקולריים

    6.208

    זיהוי ופיתוח סמן DNA עבור Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D)

    החלפת כרומוזומים דיסומיים

    פיתוח SLAF-Marker

    קבל ציטוט

    כתבו כאן את הודעתכם ושלחו אותה אלינו

    שלח את הודעתך אלינו: