-
רצף mRNA באורך מלא-Nanopore
רצף RNA היה כלי רב ערך לניתוח תעתיק מקיף.ללא ספק, רצף הקריאה הקצרה המסורתי השיג כאן התפתחות חשובה רבות.עם זאת, הוא נתקל לעתים קרובות במגבלות בזיהוי איזופורמים באורך מלא, כימות, הטיית PCR.
ריצוף Nanopore מבדיל את עצמו מפלטפורמות ריצוף אחרות, בכך שהנוקלאוטידים נקראים ישירות ללא סינתזת DNA ויוצר קריאה ארוכה בעשרות קילובסיסים.זה מאפשר קריאה ישירה של תמלילים באורך מלא והתמודדות עם האתגרים במחקרים ברמת איזופורמה.
פּלַטפוֹרמָה:Nanopore PromethION
סִפְרִיָה:cDNA-PCR
-
De novo רצף Transcriptome באורך מלא -PacBio
דה נובורצף תעתיק באורך מלא, הידוע גם בשםדה נובוIso-Seq לוקח את היתרונות של PacBio sequencer באורך הקריאה, המאפשר רצף של מולקולות cDNA באורך מלא ללא הפסקות.זה נמנע לחלוטין מכל שגיאה שנוצרת בשלבי הרכבת התמלול ובונה ערכות אוניגניות עם רזולוציה ברמת איזופורמה.ערכות אוניגניות אלו מספקות מידע גנטי רב עוצמה כ"גנום התייחסות" ברמת התעתיק.בנוסף, בשילוב עם נתוני רצף מהדור הבא, שירות זה מאפשר כימות מדויק של ביטוי ברמת איזופורמה.
פלטפורמה: PacBio Sequel IIספרייה: ספריית פעמון SMRT -
רצף mRNA אוקריוטי-אילומינה
רצף mRNA מאפשר יצירת פרופילים של כל ה-mRNA המתועתק מתאי בתנאים ספציפיים.זוהי טכנולוגיה רבת עוצמה לחשיפת פרופיל ביטוי גנים, מבני גנים ומנגנונים מולקולריים של תהליכים ביולוגיים מסוימים.עד כה, ריצוף mRNA נעשה שימוש נרחב במחקר בסיסי, אבחון קליני, פיתוח תרופות וכו'.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq 6000
-
רצף mRNA-Illumina שאינו מבוסס-Reference
רצף mRNA מאמץ טכניקת רצף של הדור הבא (NGS) כדי ללכוד את ה-RNA שליח (mRNA) בצורת אוקריוט בתקופה ספציפית שכמה פונקציות מיוחדות מופעלות.התמליל הארוך ביותר שחובר נקרא 'Unigene' ושימש כרצף ההתייחסות לניתוח עוקב, שהוא אמצעי יעיל לחקור את המנגנון המולקולרי ואת הרשת הרגולטורית של המין ללא התייחסות.
לאחר הרכבת נתוני תעתיק והערה פונקציונלית אוניגנית
(1) ניתוח SNP, ניתוח SSR, חיזוי CDS ומבנה גנים יבוצעו מראש.
(2) יבוצע כימות של ביטוי אוגנין בכל דגימה.
(3) אוניגנים המבוטאים בצורה דיפרנציאלית בין דגימות (או קבוצות) יתגלו בהתבסס על ביטוי אוניגן
(4) יתבצע אשכול, ביאור פונקציונלי וניתוח העשרה של אוניגנים בעלי ביטוי דיפרנציאלי
-
רצף ארוך ללא קידוד-אילומינה
RNA ארוכים שאינם מקודדים (lncRNAs) הם סוג של מולקולות RNA באורך העולה על 200 nt, אשר מאופיינות בפוטנציאל קידוד נמוך במיוחד.LncRNA, כחבר מפתח ב-RNA שאינם מקודדים, נמצא בעיקר בגרעין ובפלזמה.הפיתוח בטכנולוגיית רצף וביואינפורמטיקה מאפשרת זיהוי של מספר רב של lncRNAs חדשניים ולשייך את אלה לתפקודים ביולוגיים.עדויות מצטברות מצביעות על כך ש-lncRNA מעורב באופן נרחב בוויסות אפיגנטי, ויסות שעתוק וויסות שלאחר שעתוק.
-
רצף RNA קטן-אילומינה
RNA קטן מתייחס לסוג של מולקולות RNA שאינן מקודדות שאורכן בדרך כלל פחות מ-200nt, כולל מיקרו RNA (miRNA), RNA של הפרעות קטנות (siRNA) ו-RNA באינטראקציה עם פיווי (piRNA).
MicroRNA (miRNA) הוא מחלקה של RNA קטן אנדוגני באורך של כ-20-24nt, הממלא מגוון תפקידים רגולטוריים חשובים בתאים.מירנה מעורבת בתהליכי חיים רבים אשר חושפים רקמה – ספציפית ושלבית – ביטוי ספציפי ונשמר מאוד במינים שונים.
-
רצף circRNA-Illumina
רצף שלם של תעתיק מתוכנן ליצור פרופיל של כל סוגי מולקולות ה-RNA, כולל רנ"א מקודדים (mRNA) ו-RNA לא מקודדים (כולל lncRNA, circRNA ו-miRNA) המתועתקים על ידי תאים ספציפיים בזמן מסוים.רצף תעתיק שלם, המכונה גם "רצף RNA כולל" נועד לחשוף רשתות רגולטוריות מקיפות ברמת התעתיק.תוך ניצול היתרונות של טכנולוגיית NGS, רצפים של מוצרי transcriptome שלמים זמינים לניתוח ceRNA וניתוח RNA משותף, המספק את הצעד הראשון לקראת אפיון תפקודי.חושפת רשת רגולטורית של ceRNA מבוסס circRNA-miRNA-mRNA.
-
רצף תעתיק שלם - Illumina
רצף שלם של תעתיק מתוכנן ליצור פרופיל של כל סוגי מולקולות ה-RNA, כולל רנ"א מקודדים (mRNA) ו-RNA לא מקודדים (כולל lncRNA, circRNA ו-miRNA) המתועתקים על ידי תאים ספציפיים בזמן מסוים.רצף תעתיק שלם, המכונה גם "רצף RNA כולל" נועד לחשוף רשתות רגולטוריות מקיפות ברמת התעתיק.תוך ניצול היתרונות של טכנולוגיית NGS, רצפים של מוצרי transcriptome שלמים זמינים לניתוח ceRNA וניתוח RNA משותף, המספק את הצעד הראשון לקראת אפיון תפקודי.חושפת רשת רגולטורית של ceRNA מבוסס circRNA-miRNA-mRNA.
-
רצף RNA פרוקריוטי
רצף RNA פרוקריוטי משתמש ברצף הדור הבא (NGS) כדי לחשוף את הנוכחות והכמות של RNA ברגע נתון, על ידי ניתוח התעתיק הסלולרי המשתנה.רצף ה-RNA הפרוקריוטי של החברה שלנו, מכוון במיוחד לפרוקריוטים עם גנום התייחסות, מספק לך פרופיל תעתיק, ניתוח מבנה גנים וכו'. הוא יושם באופן נרחב למחקר מדעי בסיסי, מחקר ופיתוח תרופות ועוד.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq 6000
-
רצף Metatranscriptome
ריצוף Metatranscriptome מזהה ביטוי גנים של חיידקים (גם אוקריוטים וגם פרוקריוטים) בסביבות טבעיות (כלומר אדמה, מים, ים, צואה ומעי.). באופן ספציפי, שירותים אלה מאפשרים לך להשיג פרופיל ביטוי גנים שלם של קהילות מיקרוביאליות מורכבות, ניתוח טקסונומי. של מינים, ניתוח העשרה תפקודית של גנים בעלי ביטוי שונה ועוד.
פלטפורמה: Illumina NovaSeq 6000
