רצף תעתיק שלם - Illumina
מאפיינים
● ספרייה כפולה לרצף של התעתיק המלא: דלדול rRNA ואחריו הכנת ספריית PE150 ובחירת גודל ולאחר מכן הכנת ספריית SE50
● ניתוח ביואינפורמטיקה מלא של mRNA, lncRNA, circRNA ו-miRNA בדוחות ביואינפורמטיקה נפרדים
● ניתוח משותף של כל ביטוי ה-RNA בדוח משולב, כולל ניתוח רשתות ceRNA.
יתרונות השירות
●ניתוח מעמיק של רשתות רגולטוריות: ניתוח רשת ceRNA מתאפשר על ידי רצף משותף של mRNA, lncRNA, circRNA ו-miRNA ועל ידי זרימת עבודה ביואינפורמטית ממצה.
●ביאור מקיף: אנו משתמשים במספר מסדי נתונים כדי להעיר באופן פונקציונלי את הגנים המפורשים בצורה דיפרנציאלית (DEGs) ולבצע את ניתוח ההעשרה המתאים, תוך מתן תובנות על התהליכים התאיים והמולקולריים העומדים בבסיס תגובת התעתיק.
●מומחיות רבה: עם רקורד של סגירה מוצלחת של למעלה מ-2000 פרויקטי תעתיק שלמים בתחומי מחקר שונים, הצוות שלנו מביא ניסיון רב לכל פרויקט.
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרה ליבה בכל השלבים, מהכנת דגימות וספרייה ועד לרצף וביואינפורמטיקה.ניטור קפדני זה מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
● ביאור מקיף: אנו משתמשים במספר מסדי נתונים כדי להעיר באופן פונקציונלי את הגנים המפורשים בצורה דיפרנציאלית (DEGs) ולבצע את ניתוח ההעשרה המתאים, תוך מתן תובנות על התהליכים התאיים והמולקולריים העומדים בבסיס תגובת התעתיק.
●תמיכה לאחר מכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה.במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר פרויקט, סיוע בפתרון בעיות ופגישות שאלות ותשובות כדי לתת מענה לכל שאילתה הקשורה לתוצאות
דרישות לדוגמא ומשלוח
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| rRNA התרוקן | Illumina PE150 | 16 ג'יגה | Q30≥85% |
| גודל נבחר | אילומינה SE50 | 10-20 מיליון קריאה |
דרישות לדוגמה:
נוקלאוטידים:
| ריכוז (ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | יושרה |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA מוצג על ג'ל. | צמחים: RIN≥6.5 בעל חיים: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא |
משלוח לדוגמא מומלץ
מְכוֹלָה:
שפופרת צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ נייר כסף)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפל, למשל A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
2. צינורות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודה בשירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
סקירת ביטוי RNA
גנים בעלי ביטוי דיפרנציאלי
ניתוח ceRNA
מירנאים המבוטאים בצורה דיפרנציאלית ורנ"א קשורים
חקור את ההתקדמות המחקרית המאפשרת על ידי שירותי רצף התמלילים השלמים של BMKGene באמצעות אוסף פרסומים מאוצר.
דאי, י' ואח'.(2022) 'פרופילי ביטוי מקיפים של mRNAs, lncRNAs ו-miRNAs במחלת Kashin-Beck מזוהים על ידי רצף RNA', Molecular Omics, 18(2), עמ' 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. Nan וחב'.(2022) 'ניתוח תעתיקים באורך מלא של עמידות לקור של Apis cerana בהר צ'אנגבאי במהלך תקופת החורף.', Gene, 830, pp. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'תעדוף מבוסס אינטגרציה מרובה-אומיקס של רשתות ויסות RNA אנדוגניות מתחרות בסרטן ריאות של תאים קטנים: מאפיינים מולקולריים ומועמדים לתרופות', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
שו, פ. וחב'.(2022) 'ניתוח משולב של פרופילי הביטוי lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA חושף תובנות חדשות לגבי מנגנונים פוטנציאליים בתגובה לנמטודות שורש בבוטנים', BMC Genomics, 23(1), עמ' 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
יאן, ז' ועוד.(2022) 'ריצוף RNA שלם של תעתיק מדגיש את המנגנונים המולקולריים הקשורים לשמירה על איכות לאחר הקציר בברוקולי על ידי הקרנת LED אדומה', Postharvest Biology and Technology, 188, עמ'.111878. דוי: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
