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製品

ハイスループットシークエンシングによるトランスポザーゼアクセス可能なクロマチンのアッセイ (ATAC-seq)

ATAC-seq は、遺伝子発現の全体的なエピジェネティックな制御にとって重要である、ゲノム全体のクロマチンのアクセス可能性を分析するためのハイスループット シークエンシング手法です。シーケンシングアダプターは、高活性な Tn5 トランスポザーゼによって開いたクロマチン領域に挿入されます。PCR増幅後、配列決定ライブラリが構築されます。転写因子の結合部位や特定のヒストン修飾領域に限定されず、特定の時空条件下ですべてのオープンクロマチン領域を取得できます。


サービス内容

バイオインフォマティクス

デモの結果

サービスのメリット

● 包括的な分析: カスタマイズされたさまざまな分析ニーズを満たすプロフェッショナルな分析パイプライン。

● 豊富な経験: これまでに動物や植物のサンプルを含む数百のプロジェクトが成功裏に完了しました。

サービス仕様

プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム

ライブラリの種類: ATAC-seq

推奨されるデータ出力: ≥20M 読み取り

サンプル要件

サンプルの種類: 組織、生細胞、凍結細胞など

セル数: ≥ 5×105細胞、正確な細胞数が実験の成功の鍵です。

組織重量: ≥ 200mg の新鮮な組織。

血液: ≥ 2 mL

サービスのワークフロー

サンプルQC

実験計画

サンプル納品

サンプル納品

パイロット実験

DNA抽出

ライブラリの準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

アフターサービス

アフターサービス


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  • 表观-02

    1.ATAC 上のヒートマップによる TSS および隣接領域の分布 (±3 kb)

    3(1)2.異なるゲノム構成要素におけるオープンクロマチン領域の分布

    4(1)

    3.グループ間の差分ピーク通話

    5(1)

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