細菌および真菌の全ゲノム再配列決定
細菌および真菌の全ゲノム再配列プロジェクトは、微生物ゲノムの完成と比較を可能にすることで、微生物ゲノミクスの進歩にとって極めて重要です。これにより、発酵工学、工業プロセスの最適化、二次代謝経路の探索が容易になります。さらに、真菌および細菌の再配列決定は、環境適応の理解、菌株の最適化、遺伝進化のダイナミクスの解明にとって極めて重要であり、医学、農業、環境科学に幅広い意味を持ちます。
サービスのメリット
●バイオインフォマティクス分析にはバリアント呼び出しが含まれます。再配列されたゲノムに対する機能的洞察を提供します。
● 豊富な専門知識: 年間何千件もの微生物再配列プロジェクトを実施しており、当社は 10 年以上の経験、高度なスキルを持つ分析チーム、包括的なコンテンツ、優れた販売後サポートを提供します。
●販売後のサポート:当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、および結果に関する質問に対処する Q&A セッションを提供します。
サービス仕様
| シーケンスプラットフォーム | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
| イルミナ ノヴァシーク | PE150 | 100倍の深さ | Q30≧85% |
サンプル要件
| 濃度 (ng/μL) | 総量(ng) | 容量 (μL) |
| ≥1 | 60以上 | 20以上 |
バクテリア: ≥1x107 細胞
単細胞菌: ≥5x106-1x107 細胞
大型菌類: ≥4g
サービスのワークフロー
サンプル納品
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
次の分析が含まれます。
- シーケンスデータの品質管理
- 参照ゲノムとのアライメント
- バリアント コーリング: SNP および InDel
- バリアントアノテーション
バリアント呼び出し: SNP タイプ
バリアント呼び出し: InDel の長さの分布
厳選された出版物コレクションを通じて、BMKGene の微生物ゲノム再配列サービスによって促進された進歩を探ってください。
Jia, Y. et al. (2023) 「小麦矮性バントの病害抵抗性遺伝子をスクリーニングするためのトランスクリプトームと全ゲノム再配列の組み合わせ」、分子科学の国際ジャーナル、２４（２４）。土井: 10.3390/IJMS242417356。
Jiang、M.ら。 (2023) 「アンピシリン制御のグルコース代謝は細菌の耐性から耐性への移行を操作する」、科学の進歩、９（１０）。文書: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF。
ヤン、M.ら。 (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. 11 月、中国の内モンゴル自治区のソーダ湖から分離された好ハロアルカリ性細菌」、Int. Ｊ．Ｓｙｓｔ．進化。微生物、72、p。 5263. 土井: 10.1099/ijsem.0.005263。
Zhu, Z.、Wu, R.、および Wang, G.-H. (2024) 「Nasonia vitripennis から単離された Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a のゲノム配列」、微生物学リソースのお知らせ。土井: 10.1128/MRA.00802-23。
