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PacBio-全長トランスクリプトーム（非参照）
アンプリコン（16S / 18S / ITS）プラットフォームは、微生物多様性プロジェクト分析の長年の経験を基に開発されています。これには、標準化された基本分析と個別分析が含まれます。基本分析は、現在の微生物研究の主流の分析コンテンツをカバーし、分析コンテンツは豊富で包括的です。分析結果はプロジェクトレポートの形式で表示されます。パーソナライズされた分析の内容は多様です。基本的な分析レポートや研究目的に応じて、サンプルを選択したり、パラメータを柔軟に設定したりして、パーソナライズされた要件を実現できます。Windowsオペレーティングシステム、シンプルで高速。
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PacBio-全長トランスクリプトーム（非参照）
Pacific Biosciences（PacBio）アイソフォームシーケンスデータを入力として使用すると、このアプリは完全長の転写シーケンスを識別できます（アセンブリなし）。全長配列をリファレンスゲノムに対してマッピングすることにより、既知の遺伝子、転写産物、コード領域などによって転写産物を最適化できます。この場合、選択的スプライシングなどのmRNA構造のより正確な同定を実現できます。NGSトランスクリプトームシーケンシングデータとの共同分析により、トランスクリプトレベルでの発現におけるより包括的なアノテーションとより正確な定量化が可能になり、下流の差次的発現と機能分析に大きなメリットがあります。
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ツールキット
BMKCloudは、ゲノムプログラムのワンストップソリューションを提供する主要なバイオインフォマティックプラットフォームであり、医療、農業、環境などのさまざまな分野の研究者から広く信頼されています。BMKCloudは、バイオインフォマティクス分析プラットフォームやツールなど、統合された信頼性の高い効率的なサービスの提供に取り組んでいます。 、コンピューティングリソース、公開データベース、生物情報オンラインコースなど。BMKCloudには、遺伝子注釈、進化的遺伝子ツール、ncRNA、データ品質管理、アセンブリ、アライメント、データ抽出、突然変異、統計、図ジェネレータ、シーケンスなど、頻繁に使用されるさまざまな生物情報ツールがあります。分析など
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低分子RNA
低分子RNAは、miRNA、siRNA、piRNAなど、平均長が18〜30ntの短い非コードRNAの一種です。これらの低分子RNAは、mRNA分解、翻訳阻害、ヘテロクロマチン形成などのさまざまな生物学的プロセスに関与していることが広く報告されています。低分子RNAシーケンス分析は、動植物の発達、病気、ウイルスなどの研究に広く適用されています。シーケンシング分析プラットフォームは、標準的な分析と高度なデータマイニングで構成されています。RNA-seqデータに基づいて、標準的な分析により、miRNAの同定と予測、miRNAターゲット遺伝子の予測、注釈と発現の分析を行うことができます。高度な分析により、カスタマイズされたmiRNAの検索と抽出、ベン図の生成、miRNA、およびターゲット遺伝子ネットワークの構築が可能になります。
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NGS-WGS（イルミナ/ BGI）
NGS-WGSは、Biomarker Technologiesでの豊富な経験に基づいて開発された、全ゲノムリシーケンシング分析プラットフォームです。この使いやすいプラットフォームでは、イルミナプラットフォームとBGIシーケンスプラットフォームの両方から生成されたDNAシーケンスデータに適合するいくつかの基本的なパラメーターを設定するだけで、統合された分析ワークフローをすばやく送信できます。このプラットフォームは、非常に限られた時間で非常に効率的なデータ分析を可能にする高性能コンピューティングサーバーに導入されます。パーソナライズされたデータマイニングは、変異遺伝子クエリ、PCRプライマーデザインなどを含む標準的な分析に基づいて利用できます。
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mRNA（参考）
トランスクリプトームは、ゲノム遺伝子情報と生物学的機能のプロテオームの間のリンクです。転写レベルの調節は、生物の最も重要で最も広く研究されている調節モードです。トランスクリプトームシーケンシングは、任意の時点または条件下で、単一ヌクレオチドに正確な解像度でトランスクリプトームをシーケンスできます。遺伝子転写のレベルを動的に反映し、まれな正常な転写物を同時に識別および定量化し、特定のトランスクリプトのサンプル。
現在、トランスクリプトームシーケンシング技術は、動植物の発達調節、環境適応、免疫相互作用、遺伝子局在化、種の遺伝的進化、腫瘍および遺伝病の検出など、農学、医学、その他の研究分野で広く使用されています。
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メタゲノミクス（NGS）
この分析プラットフォームは、長年の経験に基づいたショットガンメタゲノムデータ分析用に設計されています。これは、データ処理、種レベルの研究、遺伝子機能レベルの研究、メタゲノムビニングなど、一般的に必要とされるさまざまなメタゲノミクス分析を含む統合ワークフローで構成されます。さらに、遺伝子および種のクエリを含む標準の分析ワークフローで、カスタマイズされたデータマイニングツールを利用できます。 、パラメータ設定、パーソナライズされた図の生成など。
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LncRNA
長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）は、200 ntを超える長さの転写産物の一種であり、タンパク質をコードすることができません。蓄積された証拠は、ほとんどのlncRNAが機能している可能性が非常に高いことを示唆しています。ハイスループットシーケンシングテクノロジーとバイオインフォマティック分析ツールにより、lncRNA配列とポジショニング情報をより効率的に明らかにし、重要な調節機能を備えたlncRNAを発見することができます。BMKCloudは、お客様にlncRNAシーケンス分析プラットフォームを提供し、高速で信頼性が高く柔軟なlncRNA分析を実現できることを誇りに思っています。
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GWAS
ゲノムワイド関連解析（GWAS）は、特定の形質（表現型）に関連する遺伝的変異（遺伝子型）を特定することを目的としています。GWA研究は、多数の個人の全ゲノムを横断する遺伝子マーカーを調査し、集団レベルでの統計分析によって遺伝子型と表現型の関連を予測します。全ゲノムリシーケンシングにより、すべての遺伝子変異を発見できる可能性があります。表現型データと組み合わせることで、GWASを処理して、表現型に関連するSNP、QTL、および候補遺伝子を特定できます。これにより、現代の動植物の育種が強力にバックアップされます。SLAFは、ゲノム全体に分散したマーカーであるSNPを発見する、自己開発の単純化されたゲノムシーケンス戦略です。これらのSNPは、分子遺伝学的マーカーとして、対象となる形質との関連研究のために処理することができます。これは、遺伝的変異に関連する複雑な特性を特定する上で費用効果の高い戦略です。
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ナノポア全長トランスクリプトミクス
生物における複雑で可変的な代替アイソフォームは、遺伝子発現とタンパク質の多様性を調節するための重要な遺伝的メカニズムです。転写構造の正確な同定は、遺伝子発現調節パターンの詳細な研究の基礎です。ナノポアシーケンシングプラットフォームは、トランスクリプトミクス研究をアイソフォームレベルで成功裏にもたらしました。この分析プラットフォームは、リファレンスゲノムに基づいてNanoporeプラットフォームで生成されたRNA-Seqデータを分析するように設計されており、遺伝子レベルと転写物レベルの両方で定性的および定量的分析を実現します。
