BMKMANU S1000 空間トランスクリプトーム
BMKMANU S1000 空間トランスクリプトーム技術スキーム
BMKMANU S1000の利点
1) 細胞以下の解像度: 各キャプチャ領域には、直径 2.5 μm、スポット中心間の間隔 5 μm の空間バーコード スポットが 200 万個以上含まれており、細胞以下の解像度 (5 μm) での空間トランスクリプトーム分析が可能です。
2) マルチレベル分解能分析: 100 μm から 5 μm までの柔軟なマルチレベル分析により、最適な分解能で多様な組織の特徴を分解します。
3) 包括的なトランスクリプトームプロファイリング: 標的遺伝子の数や標的領域に制限を受けることなく、組織スライド全体から捕捉された転写物を分析できます。
サービス仕様
| 図書館 | シーケンス戦略 | データ出力推奨 |
| S1000 cDNAライブラリー | BMKMANU S1000-イルミナ PE150 | 60Gb/サンプル |
サンプル要件
| サンプル | 番号 | サイズ | RNAの品質 |
| OCT埋め込み組織ブロック | 2～3ブロック/サンプル | 約6.8×6.8×6.8mm3 | RIN≧7 |
サンプルの準備ガイダンスやサービスのワークフローの詳細については、担当者にお気軽にご相談ください。BMKGENE エキスパート
サービスのワークフロー
実験計画
サンプル納品
事前実験
空間バーコーディング
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
BMKMANU S1000 によって生成されたデータは、BMKGENE が独自に設計したソフトウェア「BSTMatrix」を使用して分析されます。
1) 遺伝子発現行列の生成
2) HE画像処理
3) 分析用の下流サードパーティ ソフトウェアとの互換性
4) オンライン「BSTViewer」は、さまざまな解像度で視覚化結果を取得するのに役立ちます。
1.スポットクラスタリング
2.空間分布
N大手： 解決レベル=13 (100 μm、 左); 7 (50 μm、 右）
3.マーカー発現量クラスタリングヒートマップ
4.サンプル間データ分析
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