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クロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq）
ChIP-Seqは、ヒストン修飾、転写因子、およびその他のDNA関連タンパク質のDNAターゲットのゲノムワイドなプロファイリングを提供します。クロマチン免疫沈降（ChIP）の選択性を組み合わせて、特定のタンパク質-DNA複合体を回収し、次世代シーケンシング（NGS）の能力を組み合わせて、回収されたDNAのハイスループットシーケンスを実現します。さらに、タンパク質-DNA複合体は生細胞から回収されるため、結合部位をさまざまな細胞タイプや組織で、またはさまざまな条件下で比較できます。アプリケーションは、転写調節から発生経路、疾患メカニズムなどにまで及びます。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
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全ゲノムバイサルファイトシーケンシング
シトシン（5-mC）の5番目の位置でのDNAメチル化は、遺伝子発現と細胞活性に基本的な影響を及ぼします。異常なメチル化パターンは、癌などのいくつかの状態や病気に関連しています。WGBSは、単一塩基分解能でゲノム全体のメチル化を研究するためのゴールドスタンダードになりました。
プラットフォーム：イルミナNovaSeq6000
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ハイスループットシーケンシングによるトランスポザーゼアクセシブルクロマチンのアッセイ（ATAC-seq）
ATAC-seqは、ゲノムワイドなクロマチンアクセシビリティを分析するためのハイスループットシーケンシング法であり、遺伝子発現のグローバルなエピジェネティック制御に重要です。シーケンシングアダプターは、高活性Tn5トランスポザーゼによってオープンクロマチン領域に挿入されます。PCR増幅後、シーケンシングライブラリーが構築されます。すべてのオープンクロマチン領域は、転写因子の結合部位または特定のヒストン修飾領域に限定されるだけでなく、特定の時空間条件下で取得することができます。
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縮小表現バイサルファイトシーケンス（RRBS）
DNAメチル化の研究は、疾患研究において常にホットなトピックであり、遺伝子発現や表現型の特徴と密接に関連しています。RRBSは、DNAメチル化研究のための正確で効率的かつ経済的な方法です。バイサルファイトシーケンシングと組み合わせた酵素切断（Msp I）によるプロモーターおよびCpGアイランド領域の濃縮により、高解像度のDNAメチル化検出が可能になります。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
