真核生物の mRNA シークエンシング-イルミナ
利点
● 経験豊富：BMK では、細胞培養、組織、体液などを含むさまざまな種類のサンプルをカバーする 200,000 を超えるサンプルが処理され、さまざまな研究分野をカバーする 7,000 を超える mRNA-Seq プロジェクトが完了しました。
● 厳格な品質管理システム: 高品質の結果を提供するために、サンプル調製、ライブラリー調製、シーケンス、バイオインフォマティクスを含むすべてのステップにわたる中核となる品質管理ポイントが綿密に監視されています。
● 多様な研究目標を達成するための機能アノテーションおよびエンリッチメント研究に利用できる複数のデータベース。
● アフターサービス: プロジェクト完了後 3 か月間有効なアフターサービス (プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング、結果の Q&A など)。
サンプルの要件と納品
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
| ポリAが豊富 | イルミナPE150 | 6GB | Q30≧85% |
サンプル要件:
ヌクレオチド:
| 濃度(ng/μl) | 量（μg） | 純度 | 誠実さ |
| ≥ 20 | ≧ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5～2.5 ゲル上にタンパク質や DNA の汚染はほとんど見られないか、まったく見られません。 | 植物の場合: RIN≥6.5。 動物の場合：RIN≧7.0。 5.0≧28S/18S≧1.0; 基準高度が限られているか、基準高度がない |
組織: 重量(乾燥):≧1g
※5 mg未満の組織については、急速冷凍（液体窒素）した組織サンプルをお送りいただくことをお勧めします。
細胞懸濁液:セル数 = 3×106- 1×107
※細胞ライセートは凍結して発送することをお勧めします。セル数が5×105未満の場合。
血液サンプル：容量≧1ml
微生物:質量 ≥ 1 g
推奨されるサンプル配信
容器: 2 ml 遠沈管 (錫箔は推奨しません)
ラベル付けのサンプル: グループ + 複製 (A1、A2、A3 など)。B1、B2、B3……
出荷:
- ドライアイス: サンプルは袋に詰めてドライアイスに埋める必要があります。
- RNAstable チューブ: RNA サンプルは RNA 安定化チューブ (例: RNAstable®) 内で乾燥され、室温で出荷されます。
サービスのワークフロー
実験計画
サンプル納品
RNA抽出
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
バイオインフォマティクス
真核生物 mRNA シーケンス解析のワークフロー
バイオインフォマティクス
Ø生データの品質管理
Ø参照ゲノムのアライメント
Ø転写物構造解析
Ø発現の定量化
Ø発現差解析
Ø関数のアノテーションとエンリッチメント
1.mRNAデータ飽和曲線
2.微分発現解析 - ボルケーノプロット
3.DEG の KEGG アノテーション
4.DEG の GO 分類
