真核生物のmRNAシーケンス-イルミナ
利点
Ø経験豊富：細胞培養、組織、体液など、さまざまなサンプルタイプをカバーするBMKで200,000を超えるサンプルが処理され、さまざまな研究領域をカバーする7,000を超えるmRNA-Seqプロジェクトが終了しました。
Ø厳格な品質管理システム：サンプル調製、ライブラリー調製、シーケンシング、バイオインフォマティクスを含むすべてのステップを通じたコア品質管理ポイントは、高品質の結果を提供するために綿密に監視されています。
Ø多様な研究目標を達成するための機能注釈および濃縮研究に利用可能な複数のデータベース。
Øアフターサービス：プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング、結果のQ＆Aなどを含む、プロジェクト完了後3か月間有効なアフターサービス。
サンプル要件と配信
| としょうかん | シーケンシング戦略 | 推奨データ | 品質管理 |
| ポリA濃縮 | イルミナPE150 | 6 Gb | Q30≥85％ |
サンプル要件：
ヌクレオチド：
| 純度 | 威厳 | 額 |
| OD260/280≥1.7-2.5OD260/230≥0.5-2.5ゲル上にタンパク質またはDNAの混入が制限されているか、まったく表示されていません。 | 植物の場合：RIN≥6.5;動物の場合：RIN≥7; 28S /18S≥1.0;ベースラインの上昇が制限されているか、まったくない | 濃度≥30ng/μl;容量≥10μl;合計≥1.5μg |
ティッシュ：重量（乾燥）：≥1g
* 5 mg未満の組織の場合は、フラッシュ凍結（液体窒素）組織サンプルを送付することをお勧めします。
細胞懸濁液：細胞数=3×106-1×107
*凍結細胞ライセートの発送をお勧めします。細胞数が5×105未満の場合は、液体窒素でフラッシュ凍結することをお勧めします。これは、微量抽出に適しています。
血液サンプル：容量≥1ml
微生物：質量≥1g
推奨されるサンプル配信
容器：2mlの遠心分離管（アルミホイルは推奨されません）
サンプルのラベル付け：グループ+複製（例：A1、A2、A3）。B1、B2、B3.....。
発送：
- ドライアイス：サンプルはバッグに詰めてドライアイスに埋める必要があります。
- RNAstableチューブ：RNAサンプルはRNA安定化チューブ（RNAstable®など）で乾燥させ、室温で出荷できます。
サービスワークフロー
実験計画
サンプル配信
RNA抽出
図書館建設
シーケンス
データ解析
アフターサービス
バイオインフォマティクス
真核生物 mRNAシーケンシング分析ワークフロー
バイオインフォマティクス
Ø生データの品質管理
Øリファレンスゲノムアラインメント
Ø転写構造解析
Ø発現の定量化
Ø差次的発現分析
Ø関数の注釈と強化
1.mRNAデータ飽和曲線
2.差次的発現分析-火山プロット
3.DEGのKEGGアノテーション
4.DEGのGO分類
