真菌ゲノム
サービスのメリット
● さまざまな研究目標に合わせて複数のシーケンス戦略が利用可能
● 10,000 を超える完全なゲノムを組み立てた菌類ゲノムアセンブリの経験が豊富です。
● より具体的な研究ニーズを満たす専門のアフターセールス技術サポート チーム。
サービス仕様
| サービス | シーケンス戦略 | 品質保証 | 推定所要時間 |
| 菌類微細マップ | イルミナ 50X+ナノポア 100X | コンティグ N50≧2 Mb | 35営業日 |
| PacBio HiFi 30X | |||
| 菌類侵入完全マップ | イルミナ 50X+ナノポア 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | 染色体アンカー率 >90% | 45営業日 |
バイオインフォマティクス分析
●生データの品質管理
●ゲノムアセンブリ
●ゲノム成分解析
● 遺伝子機能アノテーション
●比較ゲノム解析
サンプルの要件と納品
サンプル要件:
のためにDNA抽出物:
| サンプルの種類 | 額 | 集中 | 純度 |
| DNA抽出物 | ＞1.2μg | ＞ 20ng/μl | OD260/280=1.6-2.5 |
組織サンプルの場合:
| サンプルの種類 | 推奨されるサンプル処理 | サンプルの保管と発送 |
| 単細胞菌 | 酵母を顕微鏡で観察し、指数増殖期にある酵母を収集します。 培養物（約 3 ～ 4.5e9 細胞を含む）を 1.5 または 2 ml のエッペンドルフに移します。(氷上に置いておきます) チューブを 14000 g で 1 分間遠心分離して細菌を収集し、上清を注意深く除去します。 チューブを密閉し、細菌を液体窒素中で少なくとも 1 ～ 3 時間凍結させます。チューブは-80℃の冷蔵庫に保管してください。 | サンプルを液体窒素で 3 ～ 4 時間凍結し、液体窒素または -80 度で長期保存します。サンプルの配送にはドライアイスが必要です。 |
| マクロ菌 | 活発な成長期にある組織が推奨されます。 組織をエンドトキシンを含まない水で洗い、その後 70% エソナールで洗います。 サンプルをクライオチューブに保存します。 |
サービスのワークフロー
サンプル納品
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
1.真菌のゲノム成分に関するCircos図
2.比較ゲノミクス解析：系統樹
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