● rRNA 枯渇とその後の方向性 mRNA ライブラリーの調製。
● Illumina NovaSeq でのシーケンス。
●複雑な微生物群集の変化を研究する:これは転写レベルで起こり、潜在的な新しい遺伝子を探索します。
●微生物群集と宿主または環境との相互作用を説明します。
●包括的なバイオインフォマティクス解析: これにより、群集の分類学的および機能的構成、ならびに差次的な遺伝子発現分析に関する洞察が得られます。
●広範な遺伝子アノテーション:最新の遺伝子機能データベースを使用して、微生物群集の有益な遺伝子発現情報を取得します。
●販売後のサポート:当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、および結果に関する質問に対処する Q&A セッションを提供します。
シーケンスプラットフォーム | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | データ品質管理 |
イルミナ ノヴァシーク | PE150 | 12GB | Q30≧85% |
濃度 (ng/μL) | 総量(μg) | 容量 (μL) | OD260/280 | OD260/230 | リン |
50以上 | ≥1.0 | 20以上 | 1.8~2.0 | 1.0~2.5 | ≥6.5 |
次の分析が含まれます。
● シーケンスデータの品質管理
● トランスクリプトのアセンブリ
● 分類学的注釈と豊富さ
● 機能的な注釈と豊富さ
● 発現の定量化と微分分析
各サンプルの分類学的分布:
ベータ多様性分析: UPGMA
機能的なアノテーション – GO の豊富さ
差異分類学の豊富さ – LEFSE
厳選された出版物コレクションを通じて、BMKGene のメタ トランスクリプトミクス シーケンス サービスによって促進される進歩を探ってください。
Lu、Z.ら。 (2023) 「バクテロイダル目の乳酸利用細菌の耐酸性は、高濃度食に適応したヤギのルーメンアシドーシスの予防に貢献する」、動物の栄養学、14、130–140ページ。土井: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006。
ソング、Z.ら。 (2017) 「ハイスループットアンプリコンとメタトランスクリプトミクスシーケンスによる伝統的な固体発酵における核となる機能的微生物叢の解明」、微生物学のフロンティア、8(7月)。土井: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL。
Wang、W.ら。 (2022) 「植物病原性アルテルナリア真菌のメタトランスクリプトミクス調査から発見された新規マイコウイルス」、ウイルス、14(11)、p. 2552.土井: 10.3390/V14112552/S1。
Wei、J.ら。 (2022) 「並行メタトランスクリプトーム分析により、甲虫とその腸内共生生物による植物の二次代謝産物の分解が明らかになりました」、分子 エコロジー、31(15)、3999–4016ページ。土井: 10.1111/MEC.16557。