条形バナー-03

製品

メタトランスクリプトーム配列決定

イルミナのシーケンス技術を活用したBMKGENEのメタトランスクリプトームシーケンスサービスは、土壌、水、海、便、腸などの自然環境内で、真核生物から原核生物、ウイルスに至るまでの多様な微生物の動的な遺伝子発現を明らかにします。当社の包括的なサービスにより、研究者は複雑な微生物群集の完全な遺伝子発現プロファイルを詳しく調べることができます。分類学的分析を超えて、当社のメタトランスクリプトーム配列決定サービスは、機能強化の探索を促進し、発現差のある遺伝子とその役割に光を当てます。これらの多様な環境ニッチ内の遺伝子発現、分類学的多様性、機能ダイナミクスの複雑な状況をナビゲートしながら、豊富な生物学的洞察を明らかにします。


サービス内容

バイオインフォマティクス

デモの結果

注目の出版物

サービスの特徴

● rRNA 枯渇とその後の方向性 mRNA ライブラリーの調製。

● Illumina NovaSeq でのシーケンス。

サービスのメリット

複雑な微生物群集の変化を研究する:これは転写レベルで起こり、潜在的な新しい遺伝子を探索します。

微生物群集と宿主または環境との相互作用を説明します。

包括的なバイオインフォマティクス解析: これにより、群集の分類学的および機能的構成、ならびに差次的な遺伝子発現分析に関する洞察が得られます。

広範な遺伝子アノテーション:最新の遺伝子機能データベースを使用して、微生物群集の有益な遺伝子発現情報を取得します。

販売後のサポート:当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、および結果に関する質問に対処する Q&A セッションを提供します。

サービス仕様

シーケンスプラットフォーム

シーケンス戦略

推奨されるデータ

データ品質管理

イルミナ ノヴァシーク

PE150

12GB

Q30≧85%

サンプル要件

濃度 (ng/μL)

総量(μg)

容量 (μL)

OD260/280

OD260/230

リン

50以上

≥1.0

20以上

1.8~2.0

1.0~2.5

≥6.5

 

 

 

サービスのワークフロー

サンプル納品

サンプル納品

ライブラリの準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

アフターサービス

アフターサービス


  • 前の:
  • 次:

  • 流れ図7-01

    次の分析が含まれます。

    ● シーケンスデータの品質管理

    ● トランスクリプトのアセンブリ

    ● 分類学的注釈と豊富さ

    ● 機能的な注釈と豊富さ

    ● 発現の定量化と微分分析

    各サンプルの分類学的分布:

     

     写真73

     

    ベータ多様性分析: UPGMA

     

    写真74 

     

      

    機能的なアノテーション – GO の豊富さ

     

    写真75 

     

    差異分類学の豊富さ – LEFSE

     

     写真76

     

    厳選された出版物コレクションを通じて、BMKGene のメタ トランスクリプトミクス シーケンス サービスによって促進される進歩を探ってください。

    Lu、Z.ら。 (2023) 「バクテロイダル目の乳酸利用細菌の耐酸性は、高濃度食に適応したヤギのルーメンアシドーシスの予防に貢献する」、動物の栄養学、14、130–140ページ。土井: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006。

    ソング、Z.ら。 (2017) 「ハイスループットアンプリコンとメタトランスクリプトミクスシーケンスによる伝統的な固体発酵における核となる機能的微生物叢の解明」、微生物学のフロンティア、8(7月)。土井: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL。

    Wang、W.ら。 (2022) 「植物病原性アルテルナリア真菌のメタトランスクリプトミクス調査から発見された新規マイコウイルス」、ウイルス、14(11)、p. 2552.土井: 10.3390/V14112552/S1。

    Wei、J.ら。 (2022) 「並行メタトランスクリプトーム分析により、甲虫とその腸内共生生物による植物の二次代謝産物の分解が明らかになりました」、分子 エコロジー、31(15)、3999–4016ページ。土井: 10.1111/MEC.16557。

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