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メタゲノムシーケンシング（NGS）
メタゲノムとは、環境メタゲノム、ヒトメタゲノムなど、生物の混合コミュニティの総遺伝物質のコレクションを指します。これには、培養可能な微生物と培養不可能な微生物の両方のゲノムが含まれています。メタゲノムシーケンシングは、環境サンプルから抽出された混合ゲノム材料を分析するために使用される分子ツールであり、種の多様性と豊富さ、個体群構造、系統発生関係、機能遺伝子、および環境要因との相関ネットワークに関する詳細情報を提供します。
プラットホーム：イルミナNovaSeq6000
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メタゲノムシーケンシング-ナノポア
メタゲノミクスは、環境サンプルから抽出された混合ゲノム材料を分析するために使用される分子ツールであり、種の多様性と豊富さ、個体群構造、系統発生関係、機能遺伝子、環境要因との相関ネットワークなどの詳細情報を提供します。ナノポアシーケンスプラットフォームが最近導入されましたメタゲノム研究へ。読み取り長におけるその卓越したパフォーマンスは、下流のメタゲノム解析、特にメタゲノムアセンブリを大幅に強化しました。読み取り長の利点を利用して、ナノポアベースのメタゲノミクス研究は、ショットガンメタゲノミクスと比較してより連続的なアセンブリを達成することができます。ナノポアベースのメタゲノミクスは、微生物叢から完全で閉じた細菌ゲノムを正常に生成することが公開されています（Moss、EL、et。al、ネイチャーバイオテック、2020）
プラットホーム：Nanopore PromethION P48
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16S / 18S/ITSアンプリコンシーケンス-PacBio
高度に保存された領域と超可変領域の両方を含む16Sおよび18SrRNAのサブユニットは、原核生物と真核生物の識別に最適な分子フィンガープリントです。シーケンシングを利用して、これらのアンプリコンは保存された部分に基づいてターゲティングでき、超可変領域は微生物の同定のために完全に特徴付けることができ、微生物多様性分析、分類法、系統発生などをカバーする研究に貢献します。単一分子リアルタイム（SMRT ）PacBioプラットフォームのシーケンスにより、完全長のアンプリコン（約1.5 Kb）をカバーできる非常に正確なロングリードを取得できます。遺伝子分野の視野が広がることで、細菌や真菌のコミュニティにおける種の注釈の解像度が大幅に向上しました。
プラットホーム：PacBio Sequel II
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16S / 18S/ITSアンプリコンシーケンス-NGS
16S / 18S / ITSアンプリコンシーケンスは、高度に会話された部分と超可変部分の両方を含むハウスキーピング遺伝子マーカーのPCR産物を調査することにより、微生物群集における系統発生、分類学、および種の豊富さを明らかにすることを目的としています。Woeses et al、（1977）によるこれらの完全な分子フィンガープリントの導入により、分離のない微生物叢のプロファイリングが可能になります。16S（細菌）、18S（真菌）、および内部転写スペーサー（ITS、真菌）のシーケンスにより、豊富な種と希少種および未確認種の両方を識別できます。この技術は、人間の口、腸、糞便などのさまざまな環境で異なる微生物組成を特定するために広く適用され、主要なツールになりつつあります。
プラットホーム：イルミナNovaSeq6000
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細菌および真菌の全ゲノムリシーケンシング
細菌および真菌の全ゲノムリシーケンシングは、既知の細菌および真菌のゲノムを完成させ、複数のゲノムを比較したり、新しい生物のゲノムをマッピングしたりするための重要なツールです。正確なリファレンスゲノムを生成し、微生物の同定やその他の比較ゲノム研究を行うために、細菌と真菌の全ゲノムを配列決定することは非常に重要です。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
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真菌ゲノム
Biomarker Technologiesは、特定の研究目標に応じて、真菌のゲノム調査、ファインゲノム、およびペネコンプリートゲノムを提供します。ゲノムシーケンシング、アセンブリ、および機能アノテーションは、次世代シーケンシングと第3世代シーケンシングを組み合わせて高レベルのゲノムアセンブリを実現することで実現できます。Hi-Cテクノロジーは、染色体レベルでのゲノムアセンブリを容易にするためにも使用できます。
プラットホーム：PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
イルミナNovaSeq6000
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バクテリアコンプリートゲノム
Biomarker Technologiesは、ギャップがゼロの細菌の完全なゲノムを構築するためのシーケンスサービスを提供します。細菌の完全なゲノム構築の主なワークフローには、特定の研究目標を達成する第3世代のシーケンス、アセンブリ、機能アノテーション、および高度なバイオインフォマティクス分析が含まれます。細菌ゲノムのより包括的なプロファイリングは、それらの生物学的プロセスの根底にある基本的なメカニズムを明らかにすることを可能にし、それはまた、高等真核生物種におけるゲノム研究のための貴重な参照を提供する可能性があります
プラットホーム：Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
