小分子RNAシーケンス（イルミナ社製）
特徴
● サイズ選択ライブラリの準備。
● miRNAの予測と標的を中心としたバイオインフォマティクス解析。
サービスの利点
●豊富な専門知識当社は、多様なサンプルタイプにわたる300件以上のサンプルを処理してきました。あらゆるプロジェクトに、豊富な専門知識を活かして貢献いたします。
●厳格な品質管理サンプル調製からライブラリー調製、シーケンス解析、バイオインフォマティクス解析に至るまで、すべての段階においてコアとなる管理ポイントを設けています。綿密なモニタリングにより、常に高品質な結果を提供することを保証します。
●包括的なバイオインフォマティクス解析：これにより、既知および新規のmiRNAの同定、miRNA標的の同定、および複数のデータベース（KEGG、GO）を用いた対応する機能アノテーションとエンリッチメントが可能になります。
●販売後のサポート私たちは、お客様との繋がりがいかに重要であるかを理解しています。そのため、プロジェクト完了後も3ヶ月間のアフターサービス期間を設けています。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、結果に関するあらゆるご質問にお答えする質疑応答セッションを提供いたします。
サンプル要件と配送
| 図書館 | プラットフォーム | 推奨データ | データ品質管理 |
| 選択されたサイズ | イルミナSE50 | 1000万～2000万回の閲覧数 | Q30≥85% |
サンプル要件：
ヌクレオチド：
| 濃度（ng/μl） | 量（μg） | 純度 | 誠実さ |
| 80以上 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ゲル電気泳動において、タンパク質またはDNAの汚染はほとんど、あるいは全く認められない。 | RIN≧6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ベースラインの上昇が限定的または全くない |
● 植物：
根、茎、または花弁：450mg
葉または種子：300mg
果実：1.2g
● 動物:
心臓または腸：450mg
内臓または脳：240mg
筋肉：600mg
骨、毛髪、または皮膚：1.5g
● 節足動物：
昆虫：9g
甲殻類：450mg
●全血: 2本のチューブ
● 細胞: 106 細胞
● 血清および血漿：6 mL
推奨サンプル配送
容器：2ml遠心分離管（アルミホイルは推奨しません）
サンプルラベル：グループ＋反復例（例：A1、A2、A3、B1、B2、B3）。
発送:
1. ドライアイス：サンプルは袋に入れてドライアイスの中に埋める必要があります。
2. RNA安定チューブ：RNAサンプルはRNA安定化チューブ（例：RNAstable®）で乾燥させ、室温で輸送できます。
サービスワークフロー
実験計画
サンプル配送
RNA抽出
図書館建設
シーケンス解析
データ分析
アフターサービス
バイオインフォマティクス
● 生データの品質管理
● 小型RNAの分類
● miRNA発現および差次的発現解析
● miRNA標的遺伝子および差次的発現miRNA標的遺伝子の注釈
● 標的遺伝子の注釈付けと、差次的発現miRNA遺伝子の機能エンリッチメント
miRNAの同定：構造と深層
miRNAの差次的発現 – 階層的クラスタリング
差次的発現miRNAの標的の機能アノテーション
BMKGeneのsRNAシーケンスサービスによって促進された研究の進歩を、厳選された出版物コレクションを通してご覧ください。
Chen, H. et al. (2023)「ウイルス感染は田七人参のサポニン生合成と光合成を阻害する」植物生理学および生化学、203、p. 108038。doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038。
Li, H. et al. (2023)「植物FYVEドメイン含有タンパク質FREE1はマイクロプロセッサコンポーネントと結合してmiRNA生合成を抑制する」EMBOレポート、24(1)。土井: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF。
Yu, J. et al. (2023)「ミツバチ Apis mellifera のマイクロRNA Ame-Bantam-3p は、複数の上皮成長因子様ドメイン8遺伝子 (megf8) を標的とすることで幼虫蛹の発達を制御する」国際分子科学ジャーナル、24(6)、p. 5726。doi: 10.3390/IJMS24065726/S1。
Zhang, M. et al. (2018)「肉質に関連するmiRNAと遺伝子の統合解析により、Gga-MiR-140-5pが鶏の筋肉内脂肪沈着に影響を与えることが明らかになった」細胞生理学および生化学、46(6)、2421–2433ページ。土井：10.1159/000489649。
