Majelis Genome Bakteri De novo
Kita nyedhiyakake layanan perakitan genom bakteri lengkap, njamin 0 celah. Iki bisa ditindakake kanthi nggabungake teknologi sekuensing maca dawa, kayata Nanopore lan PacBio kanggo perakitan lan sekuensing maca cendhak karo Illumina kanggo validasi perakitan lan koreksi kesalahan maca ONT. Layanan kita nyedhiyakake alur kerja bioinformatik lengkap saka perakitan, anotasi fungsional, lan analisis bioinformatik canggih, sing ngrampungake tujuan riset tartamtu. Layanan iki mbisakake pangembangan genom referensi sing tepat kanggo macem-macem studi genetik lan genomik. Kajaba iku, iki mbentuk basis kanggo aplikasi kayata optimasi galur, rekayasa genetika, lan pangembangan teknologi mikroba, njamin data genomik sing dipercaya lan bebas celah sing penting kanggo ngembangake wawasan ilmiah lan inovasi bioteknologi.
Fitur Layanan
● Kanthi rong pilihan sing bisa dipilih gumantung saka tingkat kelengkapan genom sing dikarepake.
● Draf Pilihan Genom: Sekuensing maca cendhak nganggo Illumina NovaSeq PE150.
● Genom celah 0 lengkap.
● Sekuensing sing diwaca dawa ing Nanopore PromethION 48 utawa PacBio Revio kanggo perakitan genom.
● Sekuensing maca cendhak ing Illumina NovaSeq kanggo validasi genom lan koreksi kesalahan (Nanopore) utawa kanggo ngasilake draf genom.
Kauntungan Layanan
●Dijamin Genom Zero-GapIki amarga integrasi sekuensing Illumina karo sekuensing maca dawa (Nanopore utawa PacBio).
●Alur Kerja Bioinformatika Lengkap:Iki kalebu perakitan genom lan prediksi pirang-pirang unsur genom, anotasi gen fungsional, lan visualisasi genom kayata plot Circos.
●Keahlian sing jembarKanthi luwih saka 20.000 genom mikroba sing dirakit, BMKGENE nduweni pengalaman luwih saka dasawarsa, tim analisis sing trampil, konten sing komprehensif, lan dhukungan pasca-penjualan sing apik banget.
●Dhukungan Pasca-Penjualan:Komitmen kita ngluwihi rampunging proyek kanthi periode layanan purna jual 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, lan sesi tanya jawab kanggo njawab pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
●Strategi Urutan sing Kasedhiya:Kanggo tujuan riset sing beda-beda lan syarat kelengkapan genom.
Spesifikasi Layanan
| Layanan | Strategi Urutan |
| Draf Genom | Illumina PE150 100x |
| 0 Genom Celah | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (opsional) |
Sarat Conto:
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) | Volume (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0,06 | ≥20 | - | - |
· Bakteri: ≥3.5x1010 sel-sel
Alur Kerja Layanan
Pangiriman conto
Konstruksi perpustakaan
Urutan
Analisis data
Layanan sawise dodolan
Kalebu Analisis ing ngisor iki:
● Kontrol Kualitas Data Urutan
● Perakitan Genom
● Analisis Komponen Genom: Prediksi CDS lan pirang-pirang unsur genomik
● Anotasi fungsional karo pirang-pirang basis data umum (GO, KEGG, lsp) lan basis data canggih (CARD, VFDB, lsp)
● Visualisasi Genom
Kita nyedhiyakake genom ing format fasta sing gampang diakses lan file anotasi genom (gff).
Anotasi gen - GO
Anotasi gen - karbohidrat CAZY
Visualisasi genom – Plot Circos
Jelajahi kemajuan sing difasilitasi dening layanan perakitan genom bakteri BMKGene liwat koleksi publikasi sing dikuratori.
Dai, W. et al. (2023) 'Panemuan Bacteroides uniformis F18-22 minangka Bakteri Probiotik sing Aman lan Anyar kanggo Perawatan Kolitis Ulseratif saka Usus Besar Manungsa sing Sehat',Jurnal Internasional Ilmu Molekuler, 24(19), kaca 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Isolat Proteus mirabilis sing tahan multidrug sing nggawa blaOXA-1 lan blaNDM-1 saka satwa liar ing Tiongkok: nambah risiko kesehatan masyarakat',Zoologi Integratif, 16(6), kaca 798–809. doi: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Urutan genom lengkap saka endofit Bacillus flexus KLBMP 4941 mbukak mekanisme promosi pertumbuhan tanduran lan basis genetik kanggo toleransi uyah',Jurnal Bioteknologi, 260, kaca 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plasmid Resistensi Multi-Replikon Klebsiella Ngantarai Penyebaran Gen Antimikroba sing Ekstensif',Wates ing Mikrobiologi, 12, p. 754931. doi: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / BIBTEX.
